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        求助,plko.1酶切条带很奇怪

        相关实验:酶切实验

        user-title

        dxy_15mfo6d2

        用plko.1构建敲降质粒,双酶切时用的是BshT1和EcoR1,按理说切出来的电泳后应该一条7k bp一条1.9k bp,但做了3次都没有1.9k bp的条带,却都有一条接近3k bp的条带。

        酶没有问题,3次酶切时间也不一样,都切开了,用了3管不同的plko.1质粒,其中2管来自同一菌液,另1管来自不同的菌液,质粒不是同一人提的,按理说应该也可以排除质粒本身的问题,问过师姐都说可以去用,但拿去做完转化后送去测序都没信号,从头到尾整个实验就是这个酶切条带实在无法理解,想问问这是什么情况。

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        2 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        以下是一些可能的解释:

        酶切位点:请确保BshT1和EcoR1的酶切位点是正确的。如果酶切位点存在问题,可能导致不完整的酶切或完全没有酶切。您可以查看质粒的序列,或使用其他方法(如限制性内切酶消化或测序)来验证酶切位点是否正确。

        酶切反应条件:请确保使用的酶切反应缓冲液、酶的浓度和反应时间都是正确的。有时候,过高或过低的浓度、反应时间不足或过长,可能导致不完全的酶切或者不正确的酶切。

        质粒问题:即使来自不同的菌液,质粒也可能存在变异或不正确的构建。如果这些质粒存在问题,可能会影响您的酶切结果。

        DNA片段太小:如果您的DNA片段太小,可能难以在电泳中看到正确的条带。您可以尝试使用聚丙烯酰胺凝胶(PA gel)或聚丙烯酰胺凝胶梯度凝胶(PAGE)进行电泳分离。

        转化问题:转化后未检测到您所期望的DNA序列可能是由于转化效率不高,或者您的DNA不稳定,损失了在过程中。您可以尝试使用其他方法(如电转化或者化学转化)来提高转化效率,或者使用其他方法(如PCR)检测您的DNA样品是否稳定。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        还是酶的问题,酶没有把最后一个化学键切开,建议重新确定化学键序列然后选择合适的酶

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