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科研学霸天团,48小时有问必答
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DNA 提取有杂带,有哪些办法可以提取得更干净?
wangyy1990
胶回收即可,一般我们实验室是这么弄 的,简单粗暴有效率。
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问
G418 筛选小鼠支持细胞确定最佳筛选浓度时,浓度都加到 5mg/ml 了,但两周后为何不见细胞死亡?
马帅儿
方便的话,把你设的浓度梯度和细胞show一下;首先查一下文献,大家都用的什么浓度(如果有的话),一般我们用G418筛选浓度为几百ug/ml,不会像你说的那么高的。。。
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问
Chip 实验最后的 PCR 需要注意什么问题?
lh19840703
1. Chip 实验最后免疫沉淀后得到的模板用酚:氯仿或者PCR纯化试剂盒提取都行的,但浓度一般都不会太高,通常在十几到几十ng/uL之间,因为浓度太低,所以纯度(吸光值260:280)也不能准确地测取。最重要的是阳性对照要能在PCR后检查到明显的条带。2. PCR引物设计一般退火温度要相近,分别位于基因组上靶序列上下游各50~150bp左右,最好使靶序列位于PCR产物链的中间位置。正如上面这位同
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问
用乙醇沉淀质粒时只能看到一点点沉淀是什么原因?
yeselanshan
没有盐,还有就是加乙醇后一定得混匀。
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问
已经跑了 35 个循环,条带仍然很弱,要继续加循环吗?
86964109
一般循环可以加到40个的,可能有突变,不过又不用测序
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问
如果电泳中发现DNA几乎不移动,可能是什么原因?
王国的雪
可能是电泳缓冲液的PH值不对。每次应该用新配置的。或者电泳仪的电流太小了。
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问
酶切反应中添加酶的量应控制在什么范围,为什么?
yhh931229
为了防止出现星号活性,因为甘油浓度上升,酶量上升都有可能会出现星号活性。
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问
限制性内切酶进行酶切DNA实验时DNA必须是纯化的吗?
王国的雪
我觉得是必须的,如果DNA不纯,会影响酶切反应。
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问
ChIP 中收细胞一定要用刮刀吗,可以用胰酶消化收集细胞吗?
越努力越幸运AKSR
分析纯就是37.5%
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问
关于质粒筛选中的抗生素使用
赤脚草医
可以的,两者都是氨基糖苷类抗生素,都是抑制蛋白合成达到杀细胞作用,我也是用的neomycin抗性质粒,G418筛选,付个质粒的详细文件你看下。。。。。怎么传不了PDF文件?
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问
蛋白表达量低,并且多是包涵体形式,请问,如果做EMSA,该怎么办呢?
bylvjing
我们最近也在做这个,做了一个月,各种优化原核表达的条件,还是多数以包涵体的形式存在。处理方法:1、换载体,我们用的标记基因蛋白可能大了,把GST换成了His,不知道结果怎样。2、用Thermo的试剂盒,它能把包涵体中的蛋白复性,但是价格也不便宜3、技术指导说可以用上清直接和探针结合,毕竟还是有上清还是有少量可溶性蛋白的。不知道对你有没有帮助,你可以试试
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问
ECOR1做单酶切后去磷酸化,为何连接不出重组的目的质粒?
赵志斌_001
建议单酶切后不要去磷酸化了,载体和基因比例1:10左右,连接好后涂板,然后菌落PCR(一条通用引物+一条特异引物)鉴定10个左右的单克隆,有阳性的就行了。
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问
质粒提取中的振荡到底该怎么振荡?
臭屁昱
基本上我都是把管子上下颠倒7-8次,不需要太过用力。如果你用qiagen的试剂盒,直到溶液絮状沉淀全部由蓝变白即可。之后在冰上放置15分钟让其分层就可以离心了。有的时候肉眼看不见沉淀未必就没有沉淀,可以在加酒精洗脱的时候移到小管子里高速离心(14000r)2-5分钟也许就可以看见了。
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问
W1B与W2 的顺序可以调换么?或者是否可以重复洗涤?
我是金博士
这两个作用是不同的,W1B是洗脱液,W2是去盐液,顺序是不能换的,但我有些同学会出现调换的情况,这个时候就要重新把基因组回收回来,再继续提取。重复洗涤的意义在哪里呢?基本上按试剂盒上的要求操作就足够了,重复洗涤损失更多。没必要。
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问
感受态制备不出来是为什么?
detaibio
做大肠杆菌蛋白表达试验中,感受态的制备主要与以下几个因素有关:1.细菌的生长状态:实验中应密切注视细菌的生长状态和密度,尽量使用对数生长期的细胞(一般通过检测OD600来控制。DH5α菌株 OD600为 0.5 时细胞密度是 5 × 107/ml );2.所有操作均应在无菌条件和冰上进行;3.经 CaCl2处理的细胞,在低温条件下,一定的时间内转化率随时间的推移而增加, 24小时达到最高,之后转化
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问
自杀质粒构建的重组质粒转化含有自杀质粒的大肠杆菌,是否会有质粒的相容性问题?
大明天桃子
没有必要再转到含有自杀质粒的细菌中了。你构建的含有同源片段的重组质粒本来就具有自杀质粒的功能,转到没有自杀载体的细菌中,其同样能够进行敲除或失活目的基因。另外,如果你有其他特殊目的,实在要转到含有自杀载体的细菌里的话,那你可在你重建的质粒上添加一个不同的抗性基因,这样就可以通过添加抗生素防止质粒丢失了。还有质粒的不相容性是一个缓慢的过程,一般需要几代或几十代或更长的细菌繁殖周期,你做自杀载体的话肯
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问
求问大肠组织标本保存条件及方法?
emily_cby
是否需要加rna保护液
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问
质粒DNA提取及琼脂糖凝胶电泳检测,琼脂糖凝胶电泳的目的是什么?
我是金博士
针对质粒DNA提取实验,它用来检测DNA是否成功提取。除此之外,还可以用来DNA纯化、验证PCR产物、酶切产物等等。建议先复习下基本知识,这个问题实在太基础了。
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问
PCR 电泳验证条带很亮,但酶切后跑电泳后条带很暗很模糊,该怎么改善?
我是金博士
酶切量多少?可以扩大酶切的PCR量试试。
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问
质粒怎么都提不出来,该用哪种方法?
琴琴小贝
分支杆菌中的质粒提取:采用经典的碱裂解法。取4.5 mlEP管一支,加0.5 ml菌液,加入1 ml溶液1(15%蔗糖、25 mMTriscl pH8.0、10 mMEDTA pH8.0),隔时加入溶菌酶,终浓度10 mg/ml,小心混匀。置于0度冰浴30 min,加入2 ml溶菌液2(0.2NNao 1%SDS),0度冰浴10 min,加1.5 ml 3M NaAC小心混匀。1 000 rpm离
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