实验问答21,902,842 科研人在看

科研学霸天团，48小时有问必答

问如何用R语言编辑用于孟德尔随机化分析用的VSF格式snp数据库

loveliufudan

对于孟德尔随机化（Mendelian randomization）分析，您需要对SNP数据库进行处理和分析。下面是一些用R语言进行处理和分析SNP数据库的常用步骤：下载和安装R语言：您可以从R官方网站（https://www.r-project.org/）下载和安装R语言。安装必要的R包：您需要安装一些必要的R包来处理和分析SNP数据库，例如“tidyverse”、“data.table”、“qq

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问求助，SNP的meta文章原文数据不全如何处理

loveliufudan

可以考虑以下几种方法来处理这种情况：邮件作者：您可以通过电子邮件联系该研究的作者，并请求他们提供缺失的数据。通常情况下，研究作者愿意共享其原始数据，并在您的meta分析中提供所需信息。推测基因型频率：如果无法联系作者，您可以尝试通过推测基因型频率来处理。您可以假设该SNP符合Hardy-Weinberg平衡，并根据该基因型的其他信息（如基因型频率、Minor allele frequency等）来

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问IP磁珠洗脱

loveliufudan

如果在磁珠洗脱过程中loading buffer的量不足，可能会导致磁珠沾在管壁上，从而影响实验结果。为了解决这个问题，您可以考虑以下几点：尽量使用足够的loading buffer。如果您的实验方案已经确定，可以根据样品数和洗脱次数计算所需的loading buffer量。如果实验中使用的loading buffer含有比较昂贵的成分，可以考虑自制loading buffer。在洗脱磁珠时，要注

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问MEGA遗传距离矩阵怎么看

土井挞克树

是对应的，模型选择方面p-distance的成功率比较高

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问关于细胞冻融处理的问题

土井挞克树

第二种好一些，保持温度变化小一些，会提高复苏成活率

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问RDP软件参数怎么设置

土井挞克树

我一般是按照曝光度对各个参数进行调整

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问CTAB法提取DNA的实验数据处理方法及参考文献

loveliufudan

CTAB法是一种常用的植物DNA提取方法。以下是该方法实验数据处理方法及参考文献的建议：实验数据处理方法：使用比色法、比浊法或荧光分光光度法测定DNA的质量和浓度；根据DNA的质量和浓度计算出DNA的摩尔浓度；计算每个样品的DNA纯度，包括260nm/280nm比值和260nm/230nm比值，以评估是否有污染和DNA纯度是否足够高；可以进行凝胶电泳检测，评估DNA的完整性和是否有RNA或其他污染

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问【求助】RoB 2 for cross-over trials Excel表资源求助

loveliufudan

是的，对于Crossover trial，ROB 2.0也有相应的Excel表格，用于帮助评估试验的风险偏倚。您可以在Cochrane官网上找到这个Excel表格的下载链接。具体而言，您可以前往Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions的官网页面，找到ROB 2.0工具箱的下载链接。在下载页面中，您会看到两个Excel表格：一

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问富集分析要上条和下调分开去做吗？

loveliufudan

对于蛋白组学数据的分析，富集分析通常用于挖掘蛋白质的功能、通路等信息，以了解生物学过程的变化。关于是否需要将上调和下调的蛋白分开进行富集分析，其实这个问题没有一定的答案，需要根据具体情况而定。如果将上调和下调的蛋白分开进行富集分析，可以更准确地了解上调或下调的生物学过程和通路。但是，如果某个生物学过程或通路的上下调蛋白没有被完全覆盖到，那么就会导致这个生物学过程或通路被遗漏。相反，将所有蛋白质一起

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问9 kDa左右蛋白带GFP，可观察到绿色荧光，但GFP标签抗体WB检测不到重组蛋白，空载正常

loveliufudan

有几种可能导致您无法检测到GFP标签的重组蛋白：GFP标签没有正确地折叠成其活性构象。这可能会影响抗体的结合，使其无法检测到标记的蛋白。您可以尝试使用其他抗体或试剂，例如融合蛋白的亲和标签（如His标签）。GFP标签可能已被降解或裂解，导致无法被抗体检测。这可能会发生在特定的实验条件下，例如高温、酸碱度变化或重组蛋白在某些条件下长时间存储。您可以尝试优化您的实验条件或使用其他标签。您的抗体可能存在

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问做实验练练手，结果有点出人意料

loveliufudan

这种结果可能有以下几种可能的原因：过量染色：在染色过程中，过量的染料会与蛋白质结合，导致颜色过深。如果您在染色过程中使用了过多的染料，那么即使内参蛋白质的上样量最小，它仍然可能出现深色带。实验条件不一致：在进行蛋白质电泳实验时，很多因素都会影响结果，如电泳时间、电压、缓冲液pH值等。如果这些实验条件在不同的实验中存在差异，那么结果也会有所不同。仪器问题：蛋白质电泳实验需要使用一些特殊的仪器，如电泳

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问遗传模型（显性，隐性和共显性）的问题

sswei

如果双亲的性状同时在F1个体上表现出来，即一对等位基因的两个成员在杂合体中都表达的遗传现象称为共显性。性状分离指杂种后代中，同时出现显性性状和隐性性状的现象。

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问VSV假病毒

sswei

这种细胞形态应该是细胞死亡的表现。建议仔细回想步骤，并查找文献，重新做转染。

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问如何考察核酸检测方法的灵敏度

loveliufudan

为了考察核酸检测方法的灵敏度，可以使用不同浓度的DNA或质粒来检测，并确定方法能够检测到的最低浓度。不同的基准可以用来考察不同类型的核酸检测方法的灵敏度。DNA浓度(m/v)：对于基于荧光染料或凝胶电泳的DNA检测方法，可以用不同浓度的DNA样品来检测，以确定方法能够检测到的最低DNA浓度。质粒拷贝数(copy/v)：对于基于PCR的检测方法，可以用含有不同拷贝数的质粒标准样品来检测，以确定方法能

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问双荧光素酶验证实验转染问题

loveliufudan

在进行双荧光素酶验证miRNA是否与靶基因的3UTP结合实验时，您可以选择将报告载体和miRNA模拟物分别配置两个体系进行转染，也可以将它们混合在一起加入转染试剂中。这取决于您的实验需求和转染试剂的使用说明。如果您选择将它们分别配置两个体系进行转染，可能需要更多的转染试剂，但是可以控制每个体系中报告载体和miRNA的比例，从而减少不必要的干扰。同时，这种方法也可以避免miRNA与转染试剂或其他物质

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问请问大家牛垂体提取物都用什么溶解啊

loveliufudan

牛垂体组织提取的溶解液可以根据不同实验需求选择。以下是一些常用的牛垂体提取液：RIPA缓冲液：含有1% NP-40、0.5% sodium deoxycholate、0.1% SDS、150 mM NaCl、50 mM Tris-HCl pH 8.0。该缓冲液适用于提取膜蛋白和可溶性蛋白，可以用于Western blot、免疫沉淀等实验。RIPA缓冲液含有高盐浓度：含有1% NP-40、0.5%

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问求助！！双荧光素酶检测海肾荧光素酶值低！！求求！！

初秋丶NI0Q

求助！！我也是在敲低和NC组中转染TOP/FOP质粒、海肾的荧光值只有几千，而TOP和FOP都是几千万。已经是TOP:海肾RLUc的质粒比1：10了

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问构建载体最后测序乱码怎么办？

是TTT

插入片段有过测序结果吗?是挑的单克隆提的质粒吗?p出来的产物跑的DNA凝胶是单一且很亮的条带吗?有没有杂带或者拖尾呢?

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问影响连接转化的因素

是TTT

影响转化的因素:1.感受态细胞的状态、2.加入的质粒最好在≤200ng，3.热击1-2分钟以后，需要立刻放在冰上静置2分钟，4.摇完菌以后离心需要常温，这些没做好都会影响转化效率。影响连接的因素:1.载体是否线性化完全，一般来说双酶切要优于单酶切，但也和酶切的温度与时间有关；2.线性载体和插入片段之间的比例需要计算好；3.连接酶以及缓冲液的量需严格按照说明书使用

6 回答2640 围观

问做重组蛋白，构建质粒（无his-tag）

sswei

通过设计引物，添加his-tag，克隆到质粒中去。

3 回答530 围观

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