尽管现在所有的注意力都集中到了蛋白芯片的研究上,蛋白质组研究实验室的主流技术还是双向凝胶电泳。双向凝胶电泳在历史上由于其低通量、低重复性以及对于少量蛋白不易检出的特性,其应用受到限制,这些少量蛋白通常是人类蛋白质组中最重要的疾病相关蛋白。然而,双向凝胶电泳技术的优势又继续推动了日益进展高通量模式的细化与开发。 数码蛋白质组芯片是Protein Forest公司的微化芯片,用于通过电荷和分子量大小在 ...
一、前言 芯片实验室(Lab-on-a-chip)或称微全分析系统(Miniaturized Total Analysis System,µ-TAS)是指把生物和化学等领域中所涉及的样品制备、生物与化学反应、分离检测等基本操作单位集成或基本集成一块几平方厘米的芯片上,用以完成不同的生物或化学反应过程,并对其产物进行分析的一种技术。它是通过分析化学、微机电加工(MEMS)、计算机、电子学 ...
酵母表达纯化问题
一、培养基的历史 体外培养(in vitro culture)包括:组织培养(tissue culture)、细胞培养(cell culture)、器官培养(organ culture)。顾名思义,就是将活体结构成分(如活体组织、活体细胞或者活体器官等)从体内或其寄生体内取出,放在类似于体内生存环境的体外环境中,让其生长发育的方法。广义组织培养与体外培养同义。 体外培养已经历了约一百年的发展历史, ...
1.实时PCR原理 对扩增产物进行可重复性的定量长期以来一直是科学家和研究者的目标。传统的方法需要对终产物进行凝胶电泳分析。这种方法可以确定目的产物和竞争产物的大小,估算纯度,计算条带强度。然而,所用扩增试剂和体系的变动会造成扩增的终产物的重复性有较大的变动,成为这种方法的主要弊端。 扩增过程的指数期提供给我们最有用的,可重复的数据。在起始的目的DNA量与循环过程的指数期的扩增产物量之间存在着定量 ...
基因芯片技术具有快速多样、微型化和自动化等特点在生物医学领域广泛的应用。但由于其基本原理是基于核酸杂交技术,有着内在的缺陷,实验的敏感性和重复性都存在一定问题。核酸杂交较适合于检测基因的表达,不易检测基因组DNA的基因的重排,突变和缺失。而大多数肿瘤性疾病和一些遗传变异和表型的改变与后者有关。为了解决上述问题,我们将芯片技术与荧光PCR技术相结合,设立设计一种含有大量微反应池的PCR基因芯片,以期 ...
丁香园网友zlawrance的观点为: (1)细胞冻存管一般有1.5-2ml左右体积,原则上可以存放1.5ml充满均匀悬浮细胞的冻存液,一些人喜欢灌注1-1.5ml冻存液冻存,这实际上并不好。原因如下:冻存液冻存需要一段时间,如果这段时间冻存管倾斜,液体容易流到管口,很容易在后续的操作中造成污染。建议0.5-1ml之间即可。 (2)许多教科书推荐细胞解冻用37度水,本人发现温度可以适当提高,39度 ...
一、遗传变异细胞系和正常组织来源细胞系 1、小鼠类 3T3-Swiss albino 胚胎成纤维细胞 Mo-MuLv/3T3 Mo-MuLv感染的3T3细胞 3T6-Swiss albino 胚胎成纤维细胞 PA317 成纤维细胞 Ana-1 (半贴壁) 巨噬细胞 SRSV/3T3 SRSV转化的3T3细胞 CTLL-2 (悬 ...
假如你问一个研究人员选择芯片扫描仪(microarray scanner)的时候,主要考虑什么性能?他们很可能回答说:“速度和分辨率”,因此不用感到奇怪生产厂商会在这些关键性能上下大功夫。从以下列出来的芯片扫描仪产品你就可以看到,在扫描芯片的速度和分辨率性能方面总是会出现一山还比一山高的情况。然而对于许多研究人员来说,处理能力和易操作性渐渐也成为了他们挑选芯片扫描仪时的选择 ...
丁香园网友yxbo21021提出: SNP的研究在当前仍然可以用入火如荼形容,一方面是各大数据库可以方便检索到几乎任何一个基因的SNP分布及其频率,另一方面SNP的功能研究有非常大的研究空间和前景,这应归于许多SNP的流行病关联研究重复性差,因此只有在功能上对其阐述才能解决根本问题。 当前SNP功能研究主要有以下几方面: 1、报告基因转染技术:这一技术主要用于研究启动子SNP对于mRNA转录效率, ...
SNP是单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism )。一般来说它是双等位基因的,就是说一个位点,人群中大部分人是A碱基,那么还有一部分人是T碱基,一般不会是C或者G了,这是一般的规律,没有什么好解释的。举个例子,一个人是正常人他的某一条染色体一段序列是:AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA,反向肯定是一串t了,是吧?另一条染色体也是这个样子的 ...
是一篇蛋白质组学学期报告——Single Nucleotide Polymorphism内容,原文为繁体。 点击下载 ...
snp现有检测技术有主要的3大类别 1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点,如hla区域,但成本较高,工作量大,不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠,国外文章也大量应用,不过对于国内成本偏高,同类还有snpshot技术,abi和贝克曼都相应试剂盒。成本和成功率都比taqman要低。 3、snp芯片 国外大规模筛查疾病关联分析常用,illumina和af ...
摘要:在高定位精度的运动系统中,光栅尺做为位置反馈元件大量使用。本点样仪选用Galil公司的DMC1800控制卡、松下交流伺服电机、雷尼绍光栅尺和贝塞德运动单元,定位精度可以满足设计要求。控制软件采用VB编写。 《双闭环控制的生物芯片点样仪》下载 点击这里下载 ...
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。 SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换( ...
对于SNP 研究,我个人的感觉是:曾经非常的“热”过,而现在,似乎有些降温。 这种降温在国内的研究领域内主要表现为:SNP研究做得非常多,甚至有些滥了,就象前面有的战友说的,随便做点PCR就可以在国内的杂志发文章了,文章太多太滥,没有多大的价值。 对于国外SNP研究领域,我认为现在也进入了理性思考期。SNP的文章还有很多,但是研究的思路和风格已经和以往不同了。记得2002- ...
用以检测T2DM的众多候选基因突变所需要的技术,既要求能够自动化、高通量进行,也要求除PCR之外,勿需进行PCR引物修饰、购买特殊试剂、检测标记信号或作其它的样品处理;而目前已有的许多DNA突变分析技术诸如单链构象多态性 (single-strand conformation polymorphism,SSCP) 、变性梯度凝胶电泳法(denaturing gradient gel electro ...
1、引物设计 细心地进行引物设计是PCR中最重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。设计糟糕的引物可能会同扩增其他的非目的序列。下面的指导描述了一个可以增加特异性的引物所具有的令人满意的特点: 1.典型的引物18到24个核苷长。引物需要足够长,保证序列独特性,并降低序列存在于非目的序列位点的可能性。但是长度大于24核苷的引物并不意味着更高的特异性。较长的序列可能会与错 ...
当前检测转基因植物的权威方法是分子杂交,其中Southern、Northern、Western杂交分别从整合、转录、翻译水平检测外源基因的行为,虽然说服力强,但是操作繁琐,费用较高,只适用于随机取样检测。如果用于批量检测,传统做法将会进一步显露出效率偏低、重复性差等缺点。 为建立高速度、高通量的检测方法,近年来发展了生物芯片技术,即将大量DNA或蛋白质等以预先设计的方式固定在载体上形成高密度阵列, ...
一 设计引物应遵循以下原则 1 、引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。 2 、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。 3 、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。上下游引物的GC含量不能相差太大。附加序列(RT site P ...