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        丁香实验推荐阅读
        Paraformaldehyde

        This is a quick method of getting paraformaldehyde (PFM) into solution. It is a good alternative to the traditional methods which can take hours and has the advantage that it is so quick that you are ...

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        非同位素银染测序系统操作技术

          一、概述:   Promega公司的SILVER SEQUENCETM DNA测序系统是一种无放射性的序列分析系统,它通过灵敏的银染方法检测凝胶中的条带。 银染提供了一种对于放射性或荧光法来说更加快速,廉价的替代方法。测序结果可以在同一天内得到;电泳完成后经90分钟就可读序,这是常规的放射性测序法做不到的。 此外 SILVER SEQUENCETM系统用未修饰的5'OH寡聚核苷酸作为引物, 减 ...

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        大范围微管蛋白的制备

        Large Scale Tubulin Preparation Tubulin is purified from bovine/porcine brain by two cycles of polymerization/depolymerization followed by removal of copurifying proteins on a phosphocellulose (PC) co ...

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        DNA纯化浓缩与定量

        实验目的 将复杂的细胞分子混合物加入有机溶媒萃取以除去蛋白质及其它成分,就可以纯化DNA。一般常用酚及氯仿(phenol/chloroform)可使蛋白质变性(denaturaion)的特性来进行萃取的步骤,DNA和RNA不溶于有机溶媒中,而溶于水层。另外,分子选殖(molecular cloning)常利用洋菜胶(agarose)来分离不同大小的DNA片段或用以纯化DNA。 核酸定量可利用核酸会 ...

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        RNAi技术在植物基因功能研究中的应用

        摘要 RNAi技术是研究基因功能的重要工具。其原理是对某个已知基因,设计诱导其沉默的dsRNA,通过合适手段导入细胞或机体使产生干涉效应的信号分子siRNA,导致基因表达水平下降或完全沉默。通过基因表型变化,鉴定该基因功能。从RNAi的研究背景和作用机制出发,对近年来利用RNAi技术研究植物基因功能的概况、诱导方法和载体作一综述。   关键词 基因沉默;RNAi技术;植物基因功能      1RA ...

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        Inducing RNAi with siRNA Cocktails Generated by RNase III

        Mike W. Byrom Angie M. Cheng and Lance P. Forundefined Ambion Inc. 2130 Woodward Street Austin TX 78744-1832 *Corresponding author email: lford@ambion.com AbstractSmall interfering RNA (siRNA) is an extremel ...

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        相似性序列发生Cross-react引起脱靶效应

        监测手段:对脱靶效应的监测一般通过基因芯片来监测。Gene expression profiling对脱靶效应。脱靶效应的特性:转录物表达模式有序列特异性和靶特异性两种大部分脱靶效应具有siRNA序列特异性低浓度也可能产生脱靶效应,不仅仅是高浓度能产生脱靶效应的假象。脱靶效应在蛋白和mRNA水平同时考虑进行分析,要缜密分析和确定分析的时间点。特别是要确定脱靶效应是否是蛋白被knock-down的次 ...

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        活体RNAi关键点

        在活体RNAi关键点:类似药物属性的引入,如稳定性、细胞内的传送、组织的生物可溶性进入合成的siRNA.授予siRNA类似药物的属性化学稳定性的胆固醇共聚的siRNA 显著的改善了其在体内和体外的药物属性。化学稳定性增强的方法:对正义和反义链进行部分的phosporothioate backbone和 2’-O-methyl sugar 修饰,增加其在血清中和组织匀浆中对核酸内切酶和外切酶的抗性。 ...

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        RT-PCR对siRNA沉默效果的评价

        虽然通过siRNA处理,整个基因的mRNA都受到影响,围绕siRNA周围的区域是受沉默影响最大的区域。就时效性研究来看,编码区是siRNA效应的最稳定区,非翻译区相对稳定性较弱。这与断裂位点和非翻译区之间的距离有关。因此引物最好选择在编码区内的任何位点,为了最大的灵敏度推荐使用围绕着siRNA位点进行设计。为了比较不同的siRNA针对不同的基因的相对沉默效果,最好在选择引物的时候用对于每个目的基因 ...

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        Mapping miRNA genes

        1.miRNA Map 是一个整合的数据,被开发用来存储已知miRNA 基因,假定的miRNA基因,已知的miRNA targets和假定的miRNA target.(Hsu et al 2006).2.已知的miRNA基因,来自人,小鼠,大鼠以及狗的miRNA基因,可以从miRNAase获得,试验已经证实的miRNA targets在文献中可以获得。3.假定的miroRNA precursors ...

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        Strategy for accurate sequencing through hairpin structures

        Verifying the sequence of an shRNA hairpin is essentialsince mismatch of even one nucleotide within the target sequence can ablate knockdown . An issue that is frequently encountered in the preparatio ...

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        Evolutionary rates vary among rRNA structural elements

        Nucleic Acids Research 2007 Vol. 35 No. 10 3339-3354S. Smit J. Widmann and R. Knighundefined Department of Chemistry and Biochemistry University of Colorado Boulder CO 80309 Understanding patterns of rRNA ev ...

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        siRNA片段与用shRNA质粒的选择

        用siRNA片段还是用shRNA质粒,这个要根据具体情况而定,两种方法都做是一种可行的方法,如果您经费足够。具体使用何种方法进行给药,这个具体情况具体分析,给您一个参考如下:

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        Transvascular delivery of small interfering RNA to the centr

        A major impediment in the treatment of neurological diseases is the presence of the blood–brain barrier which precludes the entry of therapeutic molecules from blood to brain. Here we show that a shor ...

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        Non Coding RNA 专家及其网址

        Reuven AgamiDivision of Tumor Biology - The Netherlands Cancer Institute - Amsterdam (TheNetherlands)r.agami@nki.nlWebpage: http://research.nki.nl/agamilab/Philippe BastinTrypanosome Cell Biology Unit ...

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        正确使用DEPC

        DEPC有致癌性,不能处理Tris溶液等这些事项大家都知道,所以不谈。谈一些实验室中的操作误区。误区一:重复使用含DEPC的水处理枪头、离心管等。由于DEPC较贵,而且书上说DEPC要用高压灭菌处理去除,于是有些人就萌发了重复使用DEPC的想法,即对含有DEPC的水不进行高压灭菌,从而重复使用含DEPC的水处理枪头、离心管等。节约本是好事,但这样的节约是无效的。为什么不能重复使用含DEPC的水,因 ...

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        RNase真的很顽固吗?

        刚涉及RNA抽提的新手都会听到别人说RNase很顽固,用高压灭菌都无法去除其活性。于是在配制tris缓冲液时就遇到了两难的境地。tris缓冲液不能用DEPC处理,只能用DEPC处理过的水配制,那么在药品称量、调pH值等过程中tris缓冲液会造到RNase的再次污染,所以是一个两难的境地。但是今天我要谈的是RNase并不顽固,高压灭菌可以去除其大量活性。下面的实验照片(照片来自ambion)很清楚的 ...

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        RNAi Glossary

        Argonaute - A family of proteins containing multiple domains and involved in RNA interference (RNAi). Argonatue is the main component of RNAi effector complex the so called siRNA induced silencing com ...

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        揭示“LiCl 沉淀”背后的故事

        不少的文献都说,用LiCl 沉淀RNA有很多好处,比如只沉淀RNA,不会沉淀DNA、蛋白和多糖等。但就是操作比较麻烦,比如,过夜沉淀,不能沉淀小分子RNA等。下面就LiCl 沉淀方法的误区进行探讨。误区一:LiCl 不能沉淀小分子RNA。很多文献都说LiCl 沉淀的RNA不含小分子的5s rRNA和tRNA。但,事实是这样吗?至少在我的实验中发现LiCl 可以沉淀小分子RNA。下面的图片更能说明L ...

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        Cos-1细胞暂时转染

        Note: This protocol has been optimized for Cos-1 cells. Successful transfection of each cell type requires optimization of the basic protocol. Variables to consider for optimization include but are no ...

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