RT-PCR对siRNA沉默效果的评价

虽然通过siRNA处理，整个基因的mRNA都受到影响，围绕siRNA周围的区域是受沉默影响最大的区域。就时效性研究来看，编码区是siRNA效应的最稳定区，非翻译区相对稳定性较弱。这与断裂位点和非翻译区之间的距离有关。因此引物最好选择在编码区内的任何位点，为了最大的灵敏度推荐使用围绕着siRNA位点进行设计。为了比较不同的siRNA针对不同的基因的相对沉默效果，最好在选择引物的时候用对于每个目的基因而言选择与siRNA靶点距离一致的引物更加有可比性！