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Mapping miRNA genes

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2112
 
1.miRNA Map 是一个整合的数据,被开发用来存储已知miRNA 基因,假定的miRNA基因,已知的miRNA targets和假定的miRNA target.(Hsu et al 2006).
2.已知的miRNA基因,来自人,小鼠,大鼠以及狗的miRNA基因,可以从miRNAase获得,试验已经证实的miRNA targets在文献中可以获得。
3.假定的miroRNA precursors可以通过RNAz来鉴定,RNAz是一个序列比较分析的工具
4.假定的miRNA基因的成熟miRNA可以通过mmiRNA来确认,mmiRNA使用机器智能学习的方法
5.miRanda是一个用来在四种哺乳动物基因组中的基因的3' UTR区域的保守区预计miRNA靶点的工具
6.miRNA map也提供已知的miRNA的表达图谱,跨物种的比较,基因的注释以及与别的生物数据库进行交叉检索
7.文本和图片的网页交互性界面在http://mirnamap.mbc.nctu.edu.tw/ 提供了方便的检索功能
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