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【心得】自己设计的三个基因的Qpcr的引物,供战友指正`讨论

因为是Qpcr引物,为了提高准确性,就缩短了产物长度,大概都在100-150bp左右。供高手讨论,共同提高。目的基因一(CDS区):gacattgtctaaaagccaagatgacagactgagaggcctgagcccttgttctggcattctcccaggaagatgcagtaaaggggttgacccaatatactgcagagaatttcatccagttccctcctccatcctgatccca ...

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推荐:PCR从引物设计到反应条件的优化

这份资料以言简意赅的幻灯形式展示了PCR从引物设计到反应条件的优化应注意的问题,相信对您的实验有指导意义。极力推荐!http://www.biotechlab.nwu.edu/pe/包括以下内容:Introduction - PCR PrimerComponentsPrimer DesignPrimer Design - IPrimer Design - IIMelting Temperature, TmTm Calculations, Nearest Neighbor A ...

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关于RNA的一整套操作

Working with RNALiving with RNaseMost researchers are acutely aware of the risk of RNase contamination, and we do not want to belabor this point or cause undue worry. We do not routinely find it necessary to treat the microcentrifuge tubes used with RNA if they are from unopened bags or from bags in which ca ...

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【旧贴整理】半定量PCR

1.选择方法(同管或是不同管)http://www.dxy.cn/bbs/thread/80432892.循环次数选择http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/1701400_0.htmlhttp://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/4882246_0.html3.内参比目的片断亮http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/po ...

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【分享】介绍高通量SNP genotyping一篇不错的综述

Oncogene. 2006 Mar 13;25(11):1594-601.Using high-throughput SNP technologies to study cancer.Engle LJ, Simpson CL, Landers JE.Cetek Corporation, Marlborough, MA, USA.Identifying genes involved in the development of cancer is crucial to fully understanding cancer biology, for ...

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【分享】电子书《PCR Primer Design》

Book DescriptionIn the past decade, molecular biology has been transformed from the art of cloning a single gene to a statistical science measuring and calculating properties of entire genomes. New high-throughput methods have been developed for genome sequencing and studying the ce ...

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【原创】NCBI中查询出的cds序列中出现了k,r,m,请问代表什么意思呢?

请各位战友看下面这段注释,来自NCBI:{LOCUS AY602989 704 bp DNA linear PLN 19-DEC-2006DEFINITION Trichoderma sp. zd 56 endochitinase 42 (ech42) gene, partial cds.ACCESSION AY602989VERSION AY602989.1 GI:52630747KEYWORDS .SOURCE Trichoderma sp. zd 56ORGANISM Trichoderma sp. zd 56Euk ...

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【资源共享】 PCR-DGGE的汇总

有空将DGGE的给总结了一下,好辛苦哦如下了其中以这个最为精彩:请教用FISH和DGGE做污泥细菌分布那一更好? :http://www.dxy.cn/bbs/thread/566504其中可以看到好多的大侠啊,嘿嘿求助PCR DGGE :http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=1157763&sty=3&keywords=dgge关于DGGE :http://www.dxy.cn/bbs/post/vi ...

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[旧贴整理]提取RNA,以及RT-PCR的问题整理

1。提取RNA的原理http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/2476706_0.html2。细胞RNA的提取(1)提取RNA要求的细胞数http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/72002_0.htmlhttp://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/2860126_0.htmlhttp://www.dxy.cn/bb ...

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【旧贴整理】至今为止,园内检测miRNA方法的帖子集合

至今为止,园内检测miRNA方法的帖子集合miRNA的定量检测一般是测成熟的还是前体miRNA细胞中的miRNA 的表达水平用什么方法比较好不知现在有没有这么一种芯片:检测miRNA的target 检测miRNA引物设计 rt-pcr检测mirna的引物 rt-pcr检测mirna的引物如何设计利用real time PCR检测mature miRNA22bp左右的miRNA也可以代替Northern blot用real-time PC ...

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【旧贴整理】多重PCR

1.多重PCR的相关文章以及原理http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/2077150_0.htmlhttp://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=7917287&sty=1&tpg=1&age=0http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=4532991&sty=3&keywords=%B6%E0%D6%D8PCRhttp:// ...

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长片段PCR扩增中几个常见问题的解决办法!

1.当PCR结果不满意时,考虑以下几个方面:(1)将PCR反应的试管与反应板紧贴,(2)使用50ul或更少反应体系时,勿使用AmpliWax,两个反应混合液=的操作方式在大多数情况下很有效,(3)当酶反应混合物以70度"热启动"开始循环时,切记在加入酶后稍微振荡一下,因为在0.2ml的PCR管不能均匀传热.(4)不要随意减少dNTP的用量,必需与其他成分保持平衡.2.没有扩增产物:(1)在提供氯化镁缓冲液中,以0.25mmol ...

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[分享]在中山医找到的~~嘿嘿--因特网上分子生物学的免费软件

因特网上分子生物学的免费软件作者:pfdbs对研究分子生物学的人来说,因特网是一个大宝藏。因特网上有大量的分子生物学免费软件与各种蛋白质、核酸和酶的数据库,应用它们,可以极大地推动我们的研究工作。  因特网上的免费工具软件有在线与离线两种形式。对于在线工具软件,只要通过浏览器,输入一定的信息,便可得到相应结果,例如二级序列分析、PCR引物设计等信息。而离线工具软件,只要下载了这个软件,便可在本地*上使用。当你在互联网上 ...

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【分享】iCubate全自动多重微生物核酸检测系统-----扩增子拯救多重PCR技术(ARM-PCR)

iCubate全自动多重微生物核酸检测系统-----扩增子拯救多重PCR技术(ARM-PCR)美国iCubate公司研究开发了革新的扩增子拯救多重PCR技术——arm-PCR,成功解决了多重微生物核酸检测中靶点不兼容的问题,并创新性设计了一次性全封闭卡盒,以及配套的卡盒处理仪、卡盒阅读仪和控制软件,整合形成现在的iCubate 全自动多重微生物核酸检测系统。同时,该系统还免费提供一个开放性的多重PCR检测试剂开发平台i ...

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【公告】专业讨论组员得分链接区!

为鼓励本版战友参与专业的讨论,特设立专业讨论组员得分链接区。凡是已获批准的专业讨论组员请在此区按要求规范跟贴,注明您在本版的得分链接,每5个得分链接将给予1分鼓励。具体规则说明:1. 在本版得分累计5分后,在本区提供相应链接,奖励1分。2.对于高分战友,平均5条无加分,但却有价值的帖子,也可奖励1分!3. 有价值的帖子:只包含专题讨论和回答问题的帖子、对本版专业建设提出非常有意义的帖子、个人经验原创,而不包括旧帖整理和上传资 ...

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我的总RNA提取到底出了什么问题?

玻璃器具、研钵处理方法:洗洁精洗后自来水冲7遍,双蒸水冲3次,60℃烤干,泡酸过夜后自来水冲7遍,双蒸水冲3次。烤干,150℃烤4小时。枪头、EP管等处理方法:0.1%DEPC溶液浸泡过夜,取出高压灭活DEPC 15分钟。实验用水:均用0.02%DEPC处理水配制。0.02%DEPC处理水配制方法:配0.02%DEPC水溶液,15Psi高压15分钟。组织处理:迅速取出称取100mg,放入1.5 ml EP管中(未处理),置-70℃保存。提取方法: ...

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【分享】RNA提取心得

RNA提取心得一 组织RNA提取1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。2.如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80°或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4°,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后加入一定量的TRIZOL试剂,然后匀浆。注意:速度不要太快,要匀一会挺一会,否则由于摩擦产热,RNA遇热会加速降解。如果一次做多个标 ...

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人细胞因子引物资料、EMSA等可索取

各位站友:我于2002年开始进行一系列的SNP,人细胞因子RT-PCR检测和核因子-kappa B的EMSA检测,积累了一些资料和引物,目前仍在继续进行该类的研究。如有需要者可与我联系,我将随时赠送给真正需要者,并在赠送前都进行验证以确保引物能P出东东来。我的EMAIL:yubaojun1219@sohu.com以下是我的研究结果和资料。请大家批评指正。基因组DNA的提取:静脉全血2ml加0.5ml ACD(柠檬酸22.8 mM ...

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几个有关primer5.0引物设计的问题,急请各位帮忙!!!

本人刚进实验室,目前在做实验前的准备工作,在引物设计遇到一些困难,希望各位战友能帮帮忙!我的序列如下,为双链RNA病毒,准备做克隆表达。1 gttaaaaatc tatagagatg gacactatcg ccgcaagagc actcactgtg atgcgagcat61 gtgctacgct tcaagaggca agaattgtgt tggaagccaa tgtgatggaa attttgggga121 tagctatcaa taggtacaat ggac ...

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【分享】RT-PCR 经验之我谈

看到论坛上有很多朋友询问RT-PCR的重复性问题,说明这里面还是有很多问题的,于是 想跟大家分享一下自己做PCR的经验:1. 总RNA的提取: 材料来源一般为细胞和组织,细胞相对比较单一,蛋白污染较小,TRIZOL法提取结果 A260/A280 结果一般都在1.8-2.1之间;组织的成分较复杂,污染多,提取较纯的RNA有一定难度, 我觉得以下地方需注意:1)最好新鲜取材,不能马上做的标本可以-70度保存,短时间内也不会有什么影响。2)研磨的手法 ...

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