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        植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析

        互联网

        10683

        一、目的

        掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。

        二、原理

        十六烷基三乙基溴化胺是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB与核酸的复合物同蛋白质、多糖类物质分开,然后将CTAB与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液,再加乙醇使核酸沉淀,CTAB能溶解于乙醇。

        三、试剂与器材

        (一)、试剂

        1 、DNA extraction :500ml
        31.885g sorbitol (山梨醇)
        6.05g tris PH8.2 (一般不调)

        2、Nuclei lysis buffer: 500ml
        100ml 1M Tris PH7.5
        100ml 0.25M EDTA
        200ml 5M NaCl
        10g CTAB
        100ml ddH2 O

        3、5% sarkosyl (N-月桂酰肌氨基钠盐) 500ml
        用时,将上述三种溶液按1:1:0.4 比例混匀,加入亚硫酸氢钠(3.8g/l),65℃预热,既为抽提液。

        (二)器材

        恒温水浴、研钵、电泳设备

        四、操作步骤

        (一)、基因组 DNA 提取

        1 取0.15g左右小麦叶片,在液氮中研磨后放入1.5ml离心管中,加入700ml抽体液(65℃预热)混匀,放入65℃水浴中,裂解40-60分钟,期间温和混匀几次。

        2 取出裂解好的DNA ,加入700ml氯仿:异戊醇(24:1),猛烈混匀,离心(1000rpm,10分钟)。

        3 取上清于新管中,(不要混入氯仿),加入0.8-1倍预冷异丙醇,缓慢混匀后,再猛烈混匀,使DNA成团,-20℃放半小时以上。

        4 将析出的DNA 离心,14000rpm,10分钟。

        5 去掉上清,将沉淀用1ml 70% 乙醇清洗一次,离心 干燥,溶于50ml ddH2O。

        (二)、酶切及电泳分析

        1.取四支1.5ml离心管,分别写上标记:g/EcoRⅠ、g/HindⅢ、λ/EcoRⅠ和λ/ Hind Ⅲ。

        2.前两支试管加入30 ml基因组DNA。后两支试管加入3mlλ基因组DNA。

        3.前两支加入5 ml 10×buffer。后两支加入2ml 10×buffer。

        4.前两支分别加入ddH2O 12.5ml,后两支分别加入ddH2 O 13.

        5.分别加入RNase 1 ml。

        6.前两支试管分别加入1.5 ml EcoRⅠ和Hind Ⅲ,10000rpm离心20 S混匀。前两支试管分别加入1 ml EcoRⅠ和Hind Ⅲ,10000rpm离心20 S混匀。
        7.37℃反应4h

        8.0.8%琼脂糖凝胶电泳(样品全部点样)。

        9.观察记录并分析实验结果。

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