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        PCR一般步骤

        互联网

        56477

        (一)总RNA提取


        取液氮冻存脑组织置于玻璃匀浆器中,按100g:3ml的比例加入Trizol试剂,严格按照TrizolRNA提取试剂盒说明书的流程进行。
        (1)加Trizol(按3ml/100mg组织,宁多勿少)置于玻璃匀浆器中匀浆后,冰浴10-15min。


        (2)移入1.5mlEP管中,4ºC 13000g离心10min。


        (3)上清液移至另一EP管中,室温放置10-15min。


        (4)加入0.2ml氯仿/1mlTrizol,振荡15s,室温置5min。


        (5)4ºC 12000g离心15min。


        (6)仔细吸取上层水相,移至新的EP管中。


        (7)加入0.5ml异丙醇/1mlTrizol,振摇,置室温10min。


        (8)4ºC 12000g离心10min,EP管底部可见白色沉淀物。


        (9)弃上清,纸巾吸干,加入75%乙醇1ml,振摇,充分洗涤沉淀。


        (10)4ºC 11000g离心5min。


        (11)吸尽乙醇,空气干燥10min(可离心加快干燥,尽量吸尽离心液体)。


        (12)半透明时将RNA溶于去核酸酶的水20ul中(可吹打混匀),-20ºC冻存备用。


        (13)所提取的总RNA用核酸蛋白分析仪分析RNA含量和纯度,所有标本260/280nm吸光度的比值均为1.8-2.0。


        (14)取所提取的总RNA用1%琼脂糖凝胶电泳,显示出清晰的28s和18s两条rRNA。


        (二)逆转录反应


        DEPC水 9ul
        dig primer 1ul
        5×buffer 4ul
        10M dNTPmix 2ul
        RNA酶抑制剂 1ul
        总RNA 2ul 70ºC 5min
        ~undefined********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~0~0~0~0~0~0~0逆转录酶 1ul
        ~undefined********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~0~0~0~0~0~0~020ul_42ºC 60min(+?)
        70ºC 10min
        4ºC ∞


        (三)PCR反应


        DEPC水(可用高压双蒸水) 17.5ul
        10×Taq buffer 2.5ul
        MgCl2 2.0ul
        10M dNTP Mix 0.5ul
        上游引物 0.5ul
        下游引物 0.5ul
        Tap酶(5u/ul) 0.5ul
        总CDNA 1.0ul
        ~undefined*******************************************************~Kbr_~H~M~2~1~0~0~0~0~0~0~025ul~Kbr_~H~M~2~1~0~0~0~0~0~0~0PCR仪参数设置
        94 ºC
        5min 94 ºC ? ºC 72 ºC
        30s 45s 45s 72ºC 4ºC
        7min ∞


        (四)电泳


        (1)20ml 0.5×TBE


        0.3-0.4g琼脂糖
        煮沸,配成1.5-2.0%琼脂糖凝胶(RNA为1.0%)


        (2)冷切至60 ºC,加入4ulEB,倒入槽中(8孔梳),室温冷切30min


        (3)拔梳,加入4ulPCR产物+1ul上样缓冲液


        (4)电压100-135V


        (5)UVP成像系统观察


        试剂配制
        5×TBE配制方法(1L计)
        Tris-Base 54g
        硼酸 27.5g
        EDTA 3.72g
        加双蒸水至1L
        2%琼脂糖凝胶配制方法
        琼脂糖 0.4g
        0.5×TBE 20ml
        EB 4ul
        方法的改进版:室温冷切10min,放至4ºC冰箱20min


        相关技巧


        1、注意反应体系的一致,可分装


        2、先P内参,检验CDNA的完整性


        3、首先考虑退火温度


        4、注意引物的设计


        5、若目的条带无法到达指定位置,可先或晚于MAKER电泳


        6、通过加量或减量PCR产物来达到灰度的调整


        7、必要时可行标本间替代


        8、可设计相应大小的内参来达到最终目的


        9、2度水浴箱的妙用


        10、必要时进行相关技术处理


        (责任编辑:大汉昆仑王)

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