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【求助】蛋白质空间结构模拟

糖嘻嘻 请问在哪个网站可以模拟多肽链蛋白质空间结构?dyykll2011 给你一个课件 好好看哦 蛋白质结构与功能预测(浙江大学沃森基因组科学研究院生信培训课件)dyykll2011 忘了传上去了cyzhgt 非常有用啊!!!modestbird 非常感谢 提供呢本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】检测细胞整体乙酰化水平的方法

janetlee1976 我记得从前看到过检测细胞总体的蛋白质乙酰化水平的方法,大概是免疫荧光或者共聚焦显微之类的方法,现在找不到了,不知道哪位知道,请赐教(不是检测某种组蛋白或某种蛋白质的乙酰化)。可否提供参考文献?谢谢!woxingwosu 免疫荧光后再共聚焦应该是可行的,或者是western也行。目前除了蛋白特异性的乙酰化抗体以外,还有一些针对乙酰化赖氨酸(Lysine)的抗体Acetylated-Lysine An ...

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【求助】blastp 比对结果中间一行空白和加号各代表什么意义?

手指爱上烟 在下新手,可能这个问题比较幼稚,请路过高手帮忙!中间的序列代表什么?空白和加号有何区别?多谢!!吴佰霖 空白 很明显是两个位置的氨基酸不一致星号 氨基酸不一样,但是化学性质相近手指爱上烟 谢谢楼上的解答,在别处也得到战友的相似解答——两个残基容易相互突变,因此在比对的时候认为它们相似。序列比对是需要打分矩阵的,蛋白质比对请查询常用打分矩阵如BLOSUM62等等你就明白了http://www.uky.edu/Classes/B ...

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【求助】组成型的stat3的磷酸化是指先由基因先表达出stat3蛋白,再由细胞内的磷酸激酶使stat3磷酸化,还是细胞本身就能直接表达出磷酸化的stat3?谢谢

lsdcfhyj 组成型的stat3的磷酸化是指先由基因先表达出stat3蛋白,再由细胞内的磷酸激酶使stat3磷酸化,还是细胞本身就能直接表达出磷酸化的stat3?谢谢bigbang_0_0 是前者,是条件非依赖的,一表达,就被磷酸化。是不受诱导的磷酸化。且不被去磷酸化。lsdcfhyj 谢谢你的回答,你的意思是细胞中的磷酸酶也不能使其去磷酸化吗?bigbang_0_0 lsdcfhyj wrote:谢谢你的回答,你的意思是细胞中 ...

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【求助】GFP融合蛋白的荧光检测文题

zybaby1008 请教各位,我用酵母分泌表达GFP融合蛋白,酵母中可以直接在荧光显微镜下观察到绿色荧光吗,我曾经观察过,但是,野生酵母也能看到类似绿色荧光,还想请问怎么区分背景和真正的荧光呢,感谢大家的帮助!侠骨仁医 应该是可以直接观察到的,强度肯定是有区别的,野生型的应该只能看见一点轮廓,而不是真正的绿色荧光,还有就是应该可以利用流式定量检测。zybaby1008 非常感谢楼上的战友,恩呢,照片现在不在手头上,今天上传 ...

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【求助】用糖蛋白的一个亚基能找到这个蛋白的受体吗?

PCR352 本人想寻找一个糖蛋白的受体,这个糖蛋白由另个亚基(A和B )组成。但是目前没有这个糖蛋白的产品,只有A亚基原核表达产品,请问可以用这个亚基进行寻找受体吗?freecell 理论上可以。可以考虑用IP和PULL-DOWN找出共同结合的蛋白;随后将A的抗体封闭A,然后进一步分析。PCR352 谢谢,我再考虑一下,实在不行就得做真核表达产物了。dnazyme 这个蛋白的受体作用位点万一是与B亚基其作用呢?其作用的部位到底是 ...

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【求助】关于磷酸化位点的几个问题

yysghyy 请问各位高手,1)除了质谱分析还有什么办法可以确定某个蛋白的磷酸化位点;2)还有如果知道了这个磷酸化位点怎样可以抑制其磷酸化(研究其下游信号通路)?3)我研究的某个受体具有酪氨酸激酶区域,也知道了几个磷酸化位点,但是研究发现其酪氨酸激酶活性并不高,这是什么意思?是说其磷酸化位点不易被磷酸化,还是可以磷酸化,但激活了另外的信号通路?非常感谢!narcissus27 回答问题2,可以将这个位点突变成其他氨基酸, ...

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【求助】怎样除掉蛋白中的核酸

yaojodan 怎样除掉蛋白中的核酸freecell 核酸酶降解。分子筛纯化。雪中梅 可以参照上世纪初关于到底是蛋白还是核酸是遗传物质的争论中所采用的方法。本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】NF-KB65磷酸化位点

lisha2008 NF-KB65磷酸化位点怎么选择啊?本人是实验研究某药物抗炎作用抑制NF-KBP65活化的.lisha2008 怎么没有人啊michaelmichael 你可以在网上搜索识别65位磷酸化的抗体,用于检测药物作用前后该位点磷酸化水平的变化情况。本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】关于靶蛋白预测

guaiguainiehui 采用双报告基因,我和一位师兄做不同的寡核苷酸跟不同的基因的3‘utr作用。比如mir-1 and pmir-report-A3'UTRmir-1 and pmir-report-B3'UTR为什么我按照师兄的各个量转染,renilla的数值我们差不多,但是目的的数值,我的是overload,师兄的却比较小呢?难道跟构建进去的3’UTR有很大关系吗?谢谢!另外,附带问一下,3;UTR采用合成几十bp的寡核苷酸, ...

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【求助】请问如何筛选靶蛋白?

xjoak 比如我们用非特异性的筛选方法筛到一个与肿瘤细胞相结合而与正常细胞不结合的抗体,但我们不知道该抗体的靶蛋白是什么,那么可以用一些什么技术筛到该抗体的靶蛋白呢?多谢!freecell 酵母双杂交、免疫共沉淀,应该都可以吧。xjoak 多谢,酵母双杂交应该可以,免疫共沉淀可能不行,因为靶蛋白是未知啊!还有其他方法吗,?本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴 ...

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【求助】pkc亚基激活怎么表现,如何检测?

三七家园 呵呵,希望大侠们,大牛们,前辈们不吝赐教。。。。:Plicanming 可以讲具体一点吗?三七家园 谢谢楼上的关心,我现在要检测pkc三个亚基δ,ε,ζ在用0.2uM的PMA(pkc的激动剂)后如何被激活?(是被磷酸化呢?还是蛋白量表达增加?或者别的什么?)怎样检测这种激活?(如果是前两个,我想用western blot因为我现在只会这个技术)ffyy8888 哈哈,技术很多呢,WB是经典金标准,但是现在还有很多新的方法,哈哈哈哈,其中 ...

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【求助】蛋白和蛋白质是同一种物质吗?

orgachem 各位哥哥姐姐,大家好!我想请教一个很简单的问题,但是我确实不知道,让大家见笑了。问题如下:蛋白和蛋白质是同一种物质吗?如果不是的话,二者主要有什么区别 ?:)谢谢各位!阳光海岛 关键看这个“蛋白”是指什么东西了。蛋白质是由氨基酸组成的大分子,其水溶液在冻干除水之后,留下的固体粉末就是了蛋白质。“蛋白”呢,意思很多,如果说指的是鸡蛋的“蛋清”的话,那基本就是一个蛋白质的水溶液吧,煮熟只是蛋白质变性了,凝固了。(没做过实验 ...

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【求助】比对同源蛋白序列

yanjinghou 请问各位高手,怎么比对多个物种的同源蛋白序列?freecell google.com: multiple protein sequences alignment梧桐纷飞 dnaman dnasistthomasz 进入这里:http://www.ebi.ac.uk/Tools/muscle/yanjinghou 我下载了其推荐的软件,好像不能用。郁闷zhongkui 不是吧,google一下会有一大堆的了。用过几个,都挺好的,不过,几年前 ...

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【求助】肽键合成过程中 peptidyl-tRNA的2-OH of final “A”有什么作用

cakeman 在肽键合成过程中 peptidyl-tRNA的2-OH of final “A”有什么作用?谢谢freecell WHICH "A"? Where did you find it?cakeman 有质子穿梭作用的那个 我也不知道是哪个。。。本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】问一下“氨基酸序列突变 P194_H195dup"代表什么意思

榴莲宝宝 问一下“氨基酸序列突变 P194_H195dup"代表什么意思?谢谢!zhanglifei 同问同问,**freecell_在194位插入了脯氨酸,在195位插入了组氨酸。dup是Duplication。本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】求一种细胞核转位的信号蛋白?

dcr_80 细胞内信号蛋白 :其功能是从细胞浆到细胞核的转位完成,量没有变化。除了SMAD家族外还有那些呢?好心的战友,帮帮我下。toddy99 STAT, nuclear receptors, NF-kB, beta-catinin,dcr_80 谢谢!!zfyyzz00 smad本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】如何让一个胞浆蛋白上膜

littlekaka 我手头有一个胞浆蛋白,是一个离子通道的辅助亚基,我的实验设计希望它表达后上膜,现在我的初步设想是在这个蛋白的N端挂一个CD4,但是我担心CD4太大会影响我这个蛋白的本身功能(也许通过改变linker的长度可以减小影响),请问是否有人知道,有没有什么比较经典的改造方式,比如连一个其他什么蛋白甚至某段domain,而对蛋白本身的表达和功能没有影响,不胜感激!zhuqueleee 我记得以前看到一篇文 ...

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【求助】请教有哪些蛋白容易被氧化,或者容易被还原

oveiyi 先谢过了oveiyi 就是容易被氧化或者容易被还原的蛋白redox proteingingivalis 铁硫蛋白应该可以算。不知道血红蛋白能不能算?电子传递链中的蛋白质算不算?oveiyi 多谢楼上,这些都算哈,还有别的吗本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】如何实验证明一种分泌蛋白是自分泌作用还是旁分泌作用?

wbis 请教大家如何实验证明一种分泌蛋白是自分泌作用还是旁分泌作用?谢谢!zhujoker 我不知道你说的情况是什么样的情况,如果是养的细胞的话,那是不是不会出现这样的问题。如果是机体的话,你的这个问题就太复杂了,因为如果搞清楚了至少也是一篇10分的文章吧?如果要证明,也就只能是原代培养,分离组织挑单克隆培养细胞,然后进行鉴定了。单个细胞的话这个问题应该是能够解决了吧?索莱宝 唯一的方法就是免疫组化!董学易7235202 我 ...

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