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        【求助】blastp 比对结果中间一行空白和加号各代表什么意义?

        丁香园论坛

        6393
        在下新手,可能这个问题比较幼稚,请路过高手帮忙!
        中间的序列代表什么?空白和加号有何区别?多谢!!
        空白 很明显是两个位置的氨基酸不一致
        星号 氨基酸不一样,但是化学性质相近
        谢谢楼上的解答,在别处也得到战友的相似解答——
        两个残基容易相互突变,因此在比对的时候认为它们相似。
        序列比对是需要打分矩阵的,蛋白质比对请查询常用打分矩阵如BLOSUM62等等你就明白了
        http://www.uky.edu/Classes/BIO/520/BIO520WWW/blosum62.htm
        bits score是被E value 修正过的。括号里面的是按分数矩阵与gap情况直接加出的分。
        看来这个东西还挺复杂的,因为刚刚接触blast,所以还要仔细学习

        本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴

        师兄微信号:shixiongcoming

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