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ABI 310型DNA测序仪的测序原理和操作规程

DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。本实验介绍的是ABI PRISM 310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。【原理】 ABI ...

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Genomic DNA Isolation Kits

Description:BiomolesSuperSpin Genome DNA Isolation Kitsare specifically designed to rapidly isolate super pure DNA from blood and tissue samples with utmost yields. The SuperSpin filter columns are ...

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DNA SampleMatrix Protocol

Objective:Preserve plasmid and genomic DNA.Storage:Open tube or remove seal from plateAdd 1-20μl of DNA to tube or well (from picograms up to 30μg)Dry samples completely at room temperatureOvernight ...

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Hirt法快速提取腺病毒DNA

取腺病毒以m.o.i=5病毒量感染293细胞,待细胞病变达+++~++++时收获。沉淀细胞加2m1 TE重悬,分装四个1.5ml Eppendorf管,每管加蛋白酶K(20μg/μl)7μl和10% SDS 50μl37 C孵育1 h再加5mol/L NaCI 150μl置于4℃反应2ho 13000rpm离心30min,转移上清,用等体积酚、酚一氯仿/异戊醇、氯仿/异戊醇各抽提一次,抽提上清加入 ...

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Hirt法快速提取腺病毒DNA

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用Hirt法提取法抽提染色体外游离DNA

病毒感染宿主细胞后常常存在一些非整合的线形或环状双链DNA分子,通常称为赫特(Hirt)DNA。下面是一个试剂盒的步骤:GENMED 赫特(HIRT)法病毒DNA 纯化试剂盒1. 准备 个 孔细胞培养板的细胞(不同试剂盒的具体用量不一,说明书中有具体流程)2. 抽掉 孔细胞培养板里的 孔培养液3. 轻轻沿壁加入 毫升GENMED 清理液(Reagent A),清洗生长的细胞表面4. 小心抽掉清理液 ...

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焦磷酸测序(Pyrosequencing)实验方法及技术

先进的基于焦磷酸测序(Pyrosequencing)的PSQ96 MA技术平台,能提供基于序列测定的SNP检测、等位基因频率分析和甲基化检测服务。另外,还提供短片段的测序服务(50-100 bp),适用于细菌和病毒分型等研究领域。 基于Pyrosequencing的SNP分析具有快速、高通量的特点,完成96个样品的SNP分析仅需10分钟。整个实验过程(包括PCR扩增、单链分离、Pyro ...

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焦磷酸测序(Pyrosequencing)实验方法及技术

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DNA Extraction Promega DNA-IQ System Database Protocol

Always wear gloves and use barrier (filter) tips when performing this protocol. To prevent confusion and contamination never process more than 4 swabs at one time.Preparation:Before beginning put down ...

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DNA Extraction Promega DNA-IQ System Database Protocol

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H. Genomic DNA isolation from blood

Genomic DNA isolation is performed according to the FBI protocol (27). After the blood samples (stored at -70degC in EDTA vacutainer tubes ) are thawed standard citrate buffer is added mixed and the t ...

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Preparation of Genomic DNA from Bacteria- using Phase Lock GelTM

Materials: see Solutions for Recipes TE buffer 10% (w/v) sodium dodecyl sulfate (SDS) 20 mg/ml proteinase K phenol\chloroform (50:50) isopropanol 70% ethanol 3M sodium acetate pH 5.2 Phase Lock ...

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Preparation of Genomic DNA from Bacteria- using Phase Lock GelTM

Materials: see Solutions for Recipes TE buffer 10% (w/v) sodium dodecyl sulfate (SDS) 20 mg/ml proteinase K phenol\chloroform (50:50) isopropanol 70% ethanol 3M sodium acetate pH 5.2 Phase Lock ...

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Methods for DNA sequencing

A. Bst-catalyzed radiolabeled DNA sequencingBst DNA polymerase-catalyzed radiolabeled two-step sequencing reactions (26) are modified from those presented earlier (25) by altering the absolute amounts ...

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亚硫酸氢钠测序法(bisulfite genomic sequencing)原理

直接测序法是建立在MSP基础上进一步深入研究CpG岛各个位点甲基化情况的方法。重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,行PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后,对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点发生甲基化。此方法一种可靠性及精确度很高的方法,能明确目的 ...

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结合亚硫酸氢钠处理和酶解分析(COBRA)法原理

亚硫酸氢钠处理的DNA扩增后使甲基化的胞嘧啶残基成为胸腺嘧啶,而已经甲基化的胞嘧啶残基仍维持胞嘧啶。这种变化会产生新的酶切位点或保持原有的甲基化依赖位点。PCR反应的引物中不包含CpG二核苷酸,因此与模板和原来的甲基化位点不会混淆。在此之后,将PCR产物纯化、酶切、聚丙烯酰胺凝胶电泳、电印迹、单核苷酸杂交和磷图像定量。 COBRA是一个测定DNA甲基化敏感的定量方法,在检测完全甲基化和 ...

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结合亚硫酸氢钠处理和酶解分析(COBRA)法原理

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甲基化敏感的单核苷酸的扩增(Ms―SnuPE)原理

Ms―SnuPE即甲基化特异的单核苷酸扩增,它能对不同甲基化特异位点进行快速定量,是一种快速估计特异性CpG位点甲基化不同情况的定量方法。 先用重亚硫酸盐处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶全部转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。进行PCR扩增,然后取等量扩增产物置于2管中,分别作为Ms―SnuPE单核苷酸引物延伸的模板。设计用于Ms―SnuPE延伸的引物的3’端紧邻待测碱基。同时于2 ...

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甲基化敏感限制性内切酶(MSRE)法

methylation sensitive restriction endonuclease,MSRE是一类对其识别位点含有甲基化碱基敏感的限制性内切酶,目前至少已发现320种。此类酶如在其切割位点中含有一个甲基化碱基,则它们中的绝大多数就不能切割DNA。MSRE法是基于甲基化敏感Ⅱ型限制性内切酶不能切割含有一个或多个甲基化切点序列的基本原理。用甲基敏感Ⅱ型内切酶及其同工酶(对甲基化不敏感) ...

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