材料与仪器
步骤
基 本 方 案 1 通过转换接头的直接 PCR
材 料(带 V 项 目 见 附 录 1)
外周血分离的单核细胞(P B M C ; 单 元 8.1)
I M D M -I O 完全培养基
重组人 IL-4 (rfIL-4; 表 5. 0 •1)


![悬 液 置 于 15m l 圆 底 离 心 管 中 。并 加 入 200M 1 10% S D S [ 终 浓 度 1 % (m /V ) ] 和 200/xl3mol/L p H 5 . 0 乙 酸 钠 轻 轻 地 混 匀 ,使 细 胞 充 分 裂 解 。然 后 将 样 品 冻 存 于 一20°C 中直至所有的样品都处理好。 7 . 融化冻存的样品,加入 2(^110m g /m l 的蛋白酶K , 37°C 中孵育5h 消化样品中的蛋白质。 8. 2m l 苯酚缓冲液提取D N A —次 ,室温, 1200g 离 心 5m i n ; 将 水 相 移 入 新 的 15m l 离 心管中, 2m l 2 5 : l 的氯仿/异戊醇抽提,再次室温, 1200g 离 心 5m i n ; 随后又将水 相移入新的15m l 离心管中,加 入 5ml 9 5 % 的乙醇。颠倒混 匀 ,室 温 放 置 I O m i n 使 D N A 沉淀。 9 . 室温, 1200^离 心 l O m i n,弃上清,用 7 0 % 的乙醇重悬;再 离 心 5m i n ,弃上清,用 7 0 % 的乙醇重复洗一遍,在空气中风干沉淀。 10. 加 入 50M 1的 T E 缓冲 液 , 4°C 孵 育 过 夜 溶 解 D N A 。取 2/^1样品用荧光比色法测定 D N A 的浓度。 5 X 107个 细 胞 一 般 能 得 到 5〜 20|u g D N A 。 11. 在 0.5m l 的微量离心管中加入扩增所需物质(总体积25M 1),用滤网枪头转移溶液: 0. 5M 1的淋巴细胞D N A 各 I.0M1 2. 5M mo l/L 的上下游寡核苷酸引物(终浓度为0. lM m o l/L ) 2. 5M1 I O X P C R 扩增缓冲液 无菌水补到25/xl。 表面覆盖一滴矿物油(约 5〇 W )。 12. 将 离 心 管 置 于 P C R 仪 上 95°C 反 应 l m i n ,然 后 冷 却 到 80°C ,再 在 各 管 中 加 入 Ipl (2. 5U ) T a g D N A 聚合酶。 1 3 . 根据以下程序在P C R 仪中进行反应: 2 个循环: Imin 95〇C 变性 I.5min 58〇C 复性 6min 72〇C 延伸 4 0 个循环: Imin 95〇C 变性 I.5min 63〇C 复性 6min 72〇C 延伸 1 4 . 取 8/^1的 P C R 产物进行琼脂糖电泳(琼脂糖浓度为0 . 7 % , T B E 电泳缓冲液)。 1 5 . 通过毛细管印迹法将胶上的D N A 转 移 到 Immobilon-N膜上。 也 可 以 用 嵌 套 式 引 物 再 次 扩 增 ,最 后 产 物 琼 脂 糖 电 泳 。 16. 置小心预湿的Immobilon-N 膜 和 I O m l 预 杂 交 溶 液 (每 150c m 2膜)在密封塑料袋 中, 65°C 预 杂 交 5〜24h 。 17. 塑料袋开一小口,加入32P 标记的变性探针,再次密封塑料袋,彻底混匀,然后在 65°C 振荡的水浴中杂交8〜16h 。 18. 分别用以下液体洗膜3 次 : 室温 2 X S S C /l% S D S /10m m o l / L E D T A 振荡 5tnin 室温 2 X S S C /l % S D S /10m m o l / L E D T A 振荡 15min 65〇C 0 •l X S S C /l % S D S /10m m o l / L E D T A 振荡 15m i n 。](http://img.dxycdn.com/trademd/upload/userfiles/image/2016/07/A1469780193997u7i82hdnjbpng_small.jpg)

![图 14.4.3 DCPCR检 测 Sjit-Syl转化重组。顶 排 为 u -e转换重组涉及的小鼠免疫球蛋白框架: 装 配 好 的VDJ区 ,两 个 恒 定 区 (Qx-Cyl) ,两 个 转 换 区 (Sju-Syl), 4 个 EcoRI酶切位点。寡 核 苷 酸 a 和寡核苷酸b 的位置分别对应图14. 2, 2 中 CPA5M-B 和 CAP3G1-A 。转换再结合去 掉了点线之间的DNA序列,形成了第二行中的结构(“转 换 DNA”)。第三行描述了 DCPCR 的中间步骤:带 有 S/ x -Syl转换区的线性片段和DCPCR引 物 a 和 b 扩增的靶序列; EcoRI酶 切后的连接片段的环化;引 物 a 和 b 得 到 的 PCR产 物 。 小鼠重组1乙-4(表5.0.1),无菌 J^ 0R I 限制性内切核酸酶和I O X ^ 0R I 缓冲液 ^/400U /iu l T 4 D N A 连接酶和10X 连 接 酶 缓 冲 液 (附 录 l) V 1〇 X D C P C R 扩增缓冲液 2.5M mol/L 寡 核 苷 酸 引 物 (图 14.4.2B ; 溶 于 无 菌 水 至 2.5p m 〇l/W ,一20°C 保 存 ) 2. 5U Tag D N A 聚合酶 无菌水 经过修饰的spiking质 粒 (可选,可由作者处获得) 10mCi/ m l [a-32P ] 标记的 d C T P (3000Ci/m m o l ) 矿物油 37°C , 6 % C O 2增湿箱 70°C 和 16°C 水浴 1.5m l 和 0.5m l 微量离心管,高压灭菌 滤 网 枪 头 (欧洲实验室) P C R 仪 1 . 从小鼠脾脏制备淋巴细胞悬液。用 T 细胞特异性表面抗原的抗体去除T 细胞和补体 (C P I 单 元 3. 4),通 过 不 连 续 Percoll密 度 梯 度 离 心 法 获 得 静 息 期 的 B 细 胞 (单元 2. 5),取 6 6 % 〜7 0 % 片段。 1 0 个 脾 脏 产 生 IO8个 细 胞 。 2 . 在 R P M I - 5 完全培养基中培养B 细 胞 ,初 始 浓 度 I X l O 5〜 2 X 105个细胞/m l 。 加入 LPS (终 浓 度 20/xg/ml) 和 IL-4 (终 浓 度 10 000U /ml) 放置于培养箱中,并定期换 液 (如 2. 5〜4 天)](http://img.dxycdn.com/trademd/upload/userfiles/image/2016/07/A1469780220566w9m4wckncapng_small.jpg)
![加 入 L P S 至终浓度之后需将培养基进行过滤除菌,经过过滤除菌后加入IL-4。 3 . 制 备 基 因 组 D N A ,并通过荧光比色或紫外分光光度法在280n m 和 260n m 处测定 D N A 浓度。 T E 缓冲液调节浓度至20M g/m l 。 4. 1.5m l 微量离心管配制酶切反应体系: 2M g 基 因组 D N A (从 步 骤 3 开始) 10M 1 10 X EcoRI 缓冲液 5U EcoRI 加 水 至 lOO/ xl。 37C 孵 育 6〜8h 或者过夜, 70°C孵 育 20miri灭活限制酶活性。 5 . 在另一 1.5m l 微量离心管中配制连接反应体系(终 体 积 100M 1): 9iul£: a )R I 消 化 混 合 物 (步 骤 4 的酶切产物; D N A 终 浓 度 I.8iug/m l ) 10M1 I O X 连 接 缓 冲 液 (终 浓 度 I X ) 2/xl T 4 D N A 连 接 酶 (终 浓 度 800U ) 79/xl 水 16°C 孵育过夜。 6 . 将 0.5m l 离心管放于冰上,配 制 扩 增 体 系 (共 20M1): 用滤网枪头转移溶液 3M 1 连 接 混 合 物 (步 骤 5 的连接产物;约 5n g D N A ) 2/xl 10X D C P C R 扩增缓冲液 2. 5p m o l / V 寡核苷酸引物各4/xl (终浓 度 0. 5|u m 〇l/L ) 1M1 2. 5U/iul Tag D N A 聚 合 酶 (终浓度 2. 5U ) 6卜1水 表面覆盖一滴矿物油(约5〇 4)。 如果要定量P C R 反 应 ,在扩增体系中加入下列试剂:① Ijul修 饰 过 的 spiking 质粒,稀 释 到 10〜2000个分子/jul. ,② lOmCi/ml O -32P ] 标 记 的 d C T P 0.5/xl (特 异活性 3000Ci/m m o l )。 7 . 扩增步骤 I 个循环: 6min 94〇 C 预变性 5 个循环: Imin 94〇 C 变性 Imin 65〇 C 复性 2min 72 °C 延伸 3 0 个循环: Imin 94〇 C 变性 Imin 68〇 C 复性 2min 72°C 延伸 1 个循环: 7min 72〇 C 延伸 8 . 用非变性聚丙烯酰胺电泳法分析P C R 扩增产物](http://img.dxycdn.com/trademd/upload/userfiles/image/2016/07/A1469780235444ag6pezqfbhpng_small.jpg)
来源:丁香实验
材料与仪器
步骤
外周血分离的单核细胞(P B M C ; 单 元 8.1)
I M D M -I O 完全培养基
重组人 IL-4 (rfIL-4; 表 5. 0 •1)


![悬 液 置 于 15m l 圆 底 离 心 管 中 。并 加 入 200M 1 10% S D S [ 终 浓 度 1 % (m /V ) ] 和 200/xl3mol/L p H 5 . 0 乙 酸 钠 轻 轻 地 混 匀 ,使 细 胞 充 分 裂 解 。然 后 将 样 品 冻 存 于 一20°C 中直至所有的样品都处理好。 7 . 融化冻存的样品,加入 2(^110m g /m l 的蛋白酶K , 37°C 中孵育5h 消化样品中的蛋白质。 8. 2m l 苯酚缓冲液提取D N A —次 ,室温, 1200g 离 心 5m i n ; 将 水 相 移 入 新 的 15m l 离 心管中, 2m l 2 5 : l 的氯仿/异戊醇抽提,再次室温, 1200g 离 心 5m i n ; 随后又将水 相移入新的15m l 离心管中,加 入 5ml 9 5 % 的乙醇。颠倒混 匀 ,室 温 放 置 I O m i n 使 D N A 沉淀。 9 . 室温, 1200^离 心 l O m i n,弃上清,用 7 0 % 的乙醇重悬;再 离 心 5m i n ,弃上清,用 7 0 % 的乙醇重复洗一遍,在空气中风干沉淀。 10. 加 入 50M 1的 T E 缓冲 液 , 4°C 孵 育 过 夜 溶 解 D N A 。取 2/^1样品用荧光比色法测定 D N A 的浓度。 5 X 107个 细 胞 一 般 能 得 到 5〜 20|u g D N A 。 11. 在 0.5m l 的微量离心管中加入扩增所需物质(总体积25M 1),用滤网枪头转移溶液: 0. 5M 1的淋巴细胞D N A 各 I.0M1 2. 5M mo l/L 的上下游寡核苷酸引物(终浓度为0. lM m o l/L ) 2. 5M1 I O X P C R 扩增缓冲液 无菌水补到25/xl。 表面覆盖一滴矿物油(约 5〇 W )。 12. 将 离 心 管 置 于 P C R 仪 上 95°C 反 应 l m i n ,然 后 冷 却 到 80°C ,再 在 各 管 中 加 入 Ipl (2. 5U ) T a g D N A 聚合酶。 1 3 . 根据以下程序在P C R 仪中进行反应: 2 个循环: Imin 95〇C 变性 I.5min 58〇C 复性 6min 72〇C 延伸 4 0 个循环: Imin 95〇C 变性 I.5min 63〇C 复性 6min 72〇C 延伸 1 4 . 取 8/^1的 P C R 产物进行琼脂糖电泳(琼脂糖浓度为0 . 7 % , T B E 电泳缓冲液)。 1 5 . 通过毛细管印迹法将胶上的D N A 转 移 到 Immobilon-N膜上。 也 可 以 用 嵌 套 式 引 物 再 次 扩 增 ,最 后 产 物 琼 脂 糖 电 泳 。 16. 置小心预湿的Immobilon-N 膜 和 I O m l 预 杂 交 溶 液 (每 150c m 2膜)在密封塑料袋 中, 65°C 预 杂 交 5〜24h 。 17. 塑料袋开一小口,加入32P 标记的变性探针,再次密封塑料袋,彻底混匀,然后在 65°C 振荡的水浴中杂交8〜16h 。 18. 分别用以下液体洗膜3 次 : 室温 2 X S S C /l% S D S /10m m o l / L E D T A 振荡 5tnin 室温 2 X S S C /l % S D S /10m m o l / L E D T A 振荡 15min 65〇C 0 •l X S S C /l % S D S /10m m o l / L E D T A 振荡 15m i n 。](http://img.dxycdn.com/trademd/upload/userfiles/image/2016/07/A1469780193997u7i82hdnjbpng_small.jpg)

![图 14.4.3 DCPCR检 测 Sjit-Syl转化重组。顶 排 为 u -e转换重组涉及的小鼠免疫球蛋白框架: 装 配 好 的VDJ区 ,两 个 恒 定 区 (Qx-Cyl) ,两 个 转 换 区 (Sju-Syl), 4 个 EcoRI酶切位点。寡 核 苷 酸 a 和寡核苷酸b 的位置分别对应图14. 2, 2 中 CPA5M-B 和 CAP3G1-A 。转换再结合去 掉了点线之间的DNA序列,形成了第二行中的结构(“转 换 DNA”)。第三行描述了 DCPCR 的中间步骤:带 有 S/ x -Syl转换区的线性片段和DCPCR引 物 a 和 b 扩增的靶序列; EcoRI酶 切后的连接片段的环化;引 物 a 和 b 得 到 的 PCR产 物 。 小鼠重组1乙-4(表5.0.1),无菌 J^ 0R I 限制性内切核酸酶和I O X ^ 0R I 缓冲液 ^/400U /iu l T 4 D N A 连接酶和10X 连 接 酶 缓 冲 液 (附 录 l) V 1〇 X D C P C R 扩增缓冲液 2.5M mol/L 寡 核 苷 酸 引 物 (图 14.4.2B ; 溶 于 无 菌 水 至 2.5p m 〇l/W ,一20°C 保 存 ) 2. 5U Tag D N A 聚合酶 无菌水 经过修饰的spiking质 粒 (可选,可由作者处获得) 10mCi/ m l [a-32P ] 标记的 d C T P (3000Ci/m m o l ) 矿物油 37°C , 6 % C O 2增湿箱 70°C 和 16°C 水浴 1.5m l 和 0.5m l 微量离心管,高压灭菌 滤 网 枪 头 (欧洲实验室) P C R 仪 1 . 从小鼠脾脏制备淋巴细胞悬液。用 T 细胞特异性表面抗原的抗体去除T 细胞和补体 (C P I 单 元 3. 4),通 过 不 连 续 Percoll密 度 梯 度 离 心 法 获 得 静 息 期 的 B 细 胞 (单元 2. 5),取 6 6 % 〜7 0 % 片段。 1 0 个 脾 脏 产 生 IO8个 细 胞 。 2 . 在 R P M I - 5 完全培养基中培养B 细 胞 ,初 始 浓 度 I X l O 5〜 2 X 105个细胞/m l 。 加入 LPS (终 浓 度 20/xg/ml) 和 IL-4 (终 浓 度 10 000U /ml) 放置于培养箱中,并定期换 液 (如 2. 5〜4 天)](http://img.dxycdn.com/trademd/upload/userfiles/image/2016/07/A1469780220566w9m4wckncapng_small.jpg)
![加 入 L P S 至终浓度之后需将培养基进行过滤除菌,经过过滤除菌后加入IL-4。 3 . 制 备 基 因 组 D N A ,并通过荧光比色或紫外分光光度法在280n m 和 260n m 处测定 D N A 浓度。 T E 缓冲液调节浓度至20M g/m l 。 4. 1.5m l 微量离心管配制酶切反应体系: 2M g 基 因组 D N A (从 步 骤 3 开始) 10M 1 10 X EcoRI 缓冲液 5U EcoRI 加 水 至 lOO/ xl。 37C 孵 育 6〜8h 或者过夜, 70°C孵 育 20miri灭活限制酶活性。 5 . 在另一 1.5m l 微量离心管中配制连接反应体系(终 体 积 100M 1): 9iul£: a )R I 消 化 混 合 物 (步 骤 4 的酶切产物; D N A 终 浓 度 I.8iug/m l ) 10M1 I O X 连 接 缓 冲 液 (终 浓 度 I X ) 2/xl T 4 D N A 连 接 酶 (终 浓 度 800U ) 79/xl 水 16°C 孵育过夜。 6 . 将 0.5m l 离心管放于冰上,配 制 扩 增 体 系 (共 20M1): 用滤网枪头转移溶液 3M 1 连 接 混 合 物 (步 骤 5 的连接产物;约 5n g D N A ) 2/xl 10X D C P C R 扩增缓冲液 2. 5p m o l / V 寡核苷酸引物各4/xl (终浓 度 0. 5|u m 〇l/L ) 1M1 2. 5U/iul Tag D N A 聚 合 酶 (终浓度 2. 5U ) 6卜1水 表面覆盖一滴矿物油(约5〇 4)。 如果要定量P C R 反 应 ,在扩增体系中加入下列试剂:① Ijul修 饰 过 的 spiking 质粒,稀 释 到 10〜2000个分子/jul. ,② lOmCi/ml O -32P ] 标 记 的 d C T P 0.5/xl (特 异活性 3000Ci/m m o l )。 7 . 扩增步骤 I 个循环: 6min 94〇 C 预变性 5 个循环: Imin 94〇 C 变性 Imin 65〇 C 复性 2min 72 °C 延伸 3 0 个循环: Imin 94〇 C 变性 Imin 68〇 C 复性 2min 72°C 延伸 1 个循环: 7min 72〇 C 延伸 8 . 用非变性聚丙烯酰胺电泳法分析P C R 扩增产物](http://img.dxycdn.com/trademd/upload/userfiles/image/2016/07/A1469780235444ag6pezqfbhpng_small.jpg)
来源:丁香实验
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