材料与仪器
步骤
		
一、用 Pd(Ⅱ)金属化 TMPyP
1.将 1mg (1.2umol) 的 TMPyP 溶于 1.4 ml 水中,然后加入 0.34 mg(1.9umol) 的 PdCl2, 加热至 95°C 反应 2 h。
实验提示:在金属化过程中,4 个 Q 带峰值 518nm、554nm、584nm 和 639nm,会变为 525nm 和 558nm 的两个峰,因此可以用可见分光光度计来监控金属化过程。
2.冷却样品,并用孔径为 45um 的注射过滤器过滤,加入 TFA 至终浓度为 1%。
3.将溶液注入用 1%TFA 平衡好的 SepPakC18 容器中,用 5 ml1% 的 TFA 冲洗容器。
4.用 0.5 ml 的甲醇,将 TMPyP-PcKII) 洗脱到一预先称重的小离心管中。
5.甲醇蒸发后,将 TMPyP-Pd(II) 溶于 1ml 水中,在 417nm 处 [e=158X103L/(mol·cm)] 测出其浓度。
该试剂可在冷冻避光条件下无限期保存。
二、光交联蛋白质
警告:在使用氙灯光交联装置时,须戴安全的有色眼镜以保护眼睛。
1.在 1.7 ml 的小离心管内准备总反应体积为 20W 的蛋白样品,其中含有蛋白质、1 X 反应缓冲液和 125umol/L 的 TMPyP-Pd(II),避光反应。
2.在光裂解反应之前,加人 5ul 新鲜配制的过硫酸铵。确保样品管在样品支架上呈水平状态(即与光束平行)。
3.将 SLP 相机与光源间的挡板移开,控制快门的开启时间为0.5s,此处可以使用相机的自动计时器。在关上快门后,将相机与光源之间的挡板重新装上。
4.迅速加入 7 ul 4 X 上样缓冲液,以终止反应。
5.SDS-PAGE 电泳后,考马斯亮蓝染色或 Western 印迹,对反应产物进行分析。
		图 10.26 显示的是一个典型的交联反应实验结果。在这个实验中,用上述方法使 UvsY 发生交联反应。可以从第六列看到:只有在金属复合物和过硫酸铵均存在的情况下,闪烁曝光光裂解交联反应才得以发生。同时可以看到的是:在第三列上,在未加人过硫酸铵的情况下长期曝光,可发生氧分子介导的交联反应。
		
		
		![在含有多种蛋白质组分的复合体中,弄清蛋白质-蛋白质之间的相互联系是一件很 困难的事情。因此,发展新的化学方法以解决这一困扰就变得非常重要。通过对某一特 定的残基或基团进行亲和标记修饰,已成为探测瞬间环境变化的有力工具( Fancy, 2〇〇〇)。目前的研究主要依赖于功能交联剂或紫外线激发的光学探针,这常常会导致低 产量和蛋白质降解。 下文介绍的是使用水溶性长波的、光捕获金属复合物,来进行P I C U P 的亲和方法。 在实验中,研究发现带有pd( n ) 金属标记的原卟啉K (ppix-Pd[ n ])(Aidrkh) 与流 行性感冒血球凝集蛋白上的一段n h 2-y p y d v p d y a (h a ) 相粘连后,即可被a-H A 抗 体 ( 或单抗12C A 5)(Sigma) 识别,并发生交联反应。 P P I X 的两个羧基,使它易于在1- 乙基-3-(3-二甲基丙胺)碳 二 亚 胺 ( E D C ) 的作用下同肽段发生粘连。在这个实验中, 采用不同的比例,将 H A -PPIX-Pd[ n ] 与 《_H A 或者谷胱甘肽转移酶的抗体( Sigma) 相混合后进行孵育,后者是一种不与H A -PPIX-Pd[ n ] 结合的抗体。于是就可以看到 交联试剂的选择作用:在 a-H A 与 H A -PPIX-Pd[ n ] 之间交联程度很高,而 H A -PPIXPd[ n ] 与 《-G S T 之间则未发生交联( 图 10. 28)。实验中所用的蛋白质浓度和肽偶联物 浓度要保持在一个较低的水平(< l〇 ng),以避免由外源H A -PPIX-Pd[ n ] 引起的蛋白 质非特异性交联。 这个实验的结果见图10. 29。由图可以清楚地看到,在加入过硫酸铵( S2C t ) 后 , 经过光裂解,《-H A 发生了特异性交联。有趣的是, H A -PPIX-P d[ n ] 与抗体即使在 1 0 0 0 : 1 的比例下反应,都不会导致H A -PPIX-Pd[ n ] 与 《 -G ST的交联。另一个有意思 的地方是过硫酸铵在交联反应的起始是发挥作用的。这有可能是因为氧气通过一种未知 机制,活化了交联反应。 - + - + + + Ru(bpy)2+/hv/S20 |-](http://img.dxycdn.com/trademd/upload/userfiles/image/2016/07/B14694228468845xz6ngekq7png_small.jpg)
		
来源:丁香实验











