逐步地从靶 DNA 的一端或另一端删除多个寡核苷酸的嵌套式缺失突变方法被用来确定功能性顺式调控元件的边界,早先曾作为指导 DNA 测序的模板。该方法依赖于核酸酶,这些核酸酶均以可预测的方式消化 DNA, 其中外切核酸酶 HI 是目前最好的。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。
这一方法适用于任何大小的细菌克隆,但小的克隆可以给出最清楚的结果。小克隆可以产生尖锐的杂交信号,而且在克隆从琼脂板转到膜的过程中不会弥散。操作中采用能够包含 2500 克隆的 90 mm 板效果最好。在保证没有气泡的情况下,用更大的滤膜很难正好覆盖于 150 mm 板。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。