- ￥1 - 10
- SITE-seq体外脱靶检测及高通量sgRNA筛选
- 全国
- 2026年02月04日
企业认证
相关产品推荐更多 >
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商：
杭州舒桐生物科技有限公司
- 服务名称：
GUIDE-Seq;SITE-seg
SITE-seq原理如下：提取高分子量DNA，直接进行体外切割，加带有生物素标记的接头，DNA片段化，加上另外一端接头，PCR扩增完成文库构建。最后采用PE150策略进行测序。
SITE-seq原理及实验流程
- 无需高分子量DNA，普通提取的DNA即可；
- DNA需要量少，传统的SITE-seq每个样本至少需要的DNA为10ug，改造后的SITE-Pro仅需5ug就能完成实验；
- 不受物种限制，无论是植物还是动物都可进行检测；
- 可同时检测多条sgRNA的在靶机脱靶，可用于大规模的sgRNA筛选；
- 不仅能检测SpCas9 的脱靶，还能检测SaCas9，AsCpf1和LbCpf1的脱靶；
- 脱靶位点相较于细胞内脱靶检测，其覆盖更加全面；
- 服务周期短，从准备DNA到最终可视化结果呈现，仅需1月。
- 高通量sgRNA筛选：
- 脱靶检测：
- 不仅适用于SpCas9，还适用于SaCas9，AsCpf1和LbCpf1等
| 服务项目 | 内容 | 周期 | 价格 | 交付形式 |
| SITE-Pro | 建库+测序+分析 | 25-35个工作日 | 12000元 | sgRNA质粒（可选）+原始数据+可视化结题报告 |
- DNA样品总量：10ug以上，浓度50ng/ul以上；
- DNA样品纯度：OD260/280=1.8~2.0 ；
- DNA样品完整性：DNA无降解，需提供凝胶电泳检测胶图。
风险提示：丁香通仅作为第三方平台，为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全，合理判断，谨慎选购商品，商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品，请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
文献和实验北大伊成器团队 Nature Method 发文，揭示单碱基编辑脱靶风险！
方法，通过尿嘧啶 DNA 糖基酶（Uracil-DNA Glycosylase, UDG）识别 dU 的存在，并以此捕捉被编辑的碱基。图片来源：Nature Method 研究团队对此前未被报道过脱靶现象的，包括 VEGFA_site_2，HEK293_site_4 与 EMX1 在内的几个著名单碱基编辑靶点进行了 Detect-seq，并分别识别出了数十到数百个推测出来的 sgRNA 结合位点，这些位点都表现出了较强的 Detect-seq 信号。去除 CBE 所依赖的 sgRNA，APO 以及 UCI
DNA 会被切割成线性 DNA，而没有酶切位点的环形 DNA 则不会。再对线性的 DNA 进行高通量测序，其与 Digenome-seq 相比，是一种更为灵敏的细胞外检测方法 [3]。CIRCLE-seq 流程示意图3、SITE-Seq在细胞外将 DNA 在 sgRNPs 处理后进行高通量测序，该技术使用了 sgRNA 编程的 Cas9 对基因组 DNA 中的剪切位点序列进行识别 [4]。该方法将生化识别法与细胞活性检测法相结合，具有高精高敏的脱靶位点鉴别能力。细胞内检测方法1、GUIDE-seq
诺奖得主 Science 发文：基因编辑诞生 10 年，未来将如何改变世界？
所 David Liu 实验室在传统的 CRISPR/Cas9 基础上优化的精准基因编辑系统。Prime editing 由两部分组成，一是 nCas9 和改造的逆转录酶融合构成的效应蛋白 ——Cas9-逆转录酶，其二是工程编辑向导 RNA (prime editing guide RNA, pegRNA) 。后者既可以将 nCas9 引导到目标位点，又可以作为包含逆转录酶所需编辑的模板。这种方法可用于纠正人类细胞中与 hunter 综合征相关的大型序列倒置，效率高达 9%，且没有检测到的脱靶插入
技术资料暂无技术资料 索取技术资料
