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- SITE-seq体外脱靶检测及高通量sgRNA筛选
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- 2025年12月28日
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- 详细信息
- 技术资料
- 提供商：
杭州舒桐生物科技有限公司
- 服务名称：
GUIDE-Seq;SITE-seg
TE-Pro体外脱靶检测
舒桐生物科技长期致力于基因编辑领域，其中也包括对脱靶检测手段的大力研发。近年来，我们成功开发了GUIDE-pro体内脱靶检测及SITE-pro体外脱靶检测。SITE-pro是由鼓润公司基于SITE-seq体外脱靶检测手段自主研发的高效、高敏感、高特异性、高通量的sgRNA脱靶检测及筛选的方法。
SITE-seq原理如下：提取高分子量DNA，直接进行体外切割，加带有生物素标记的接头，DNA片段化，加上另外一端接头，PCR扩增完成文库构建。最后采用PE150策略进行测序。
SITE-seq原理及实验流程
舒桐SITE-Pro优势
- 无需高分子量DNA，普通提取的DNA即可；
- DNA需要量少，传统的SITE-seq每个样本至少需要的DNA为10ug，改造后的SITE-Pro仅需5ug就能完成实验；
- 不受物种限制，无论是植物还是动物都可进行检测；
- 可同时检测多条sgRNA的在靶机脱靶，可用于大规模的sgRNA筛选；
- 不仅能检测SpCas9 的脱靶，还能检测SaCas9，AsCpf1和LbCpf1的脱靶；
- 脱靶位点相较于细胞内脱靶检测，其覆盖更加全面；
- 服务周期短，从准备DNA到最终可视化结果呈现，仅需1月。
舒桐升级版SITE-Pro的应用场景
- 高通量sgRNA筛选：
- 脱靶检测：
- 不仅适用于SpCas9，还适用于SaCas9，AsCpf1和LbCpf1等
实验示例
杭州舒桐生物科技有限公司利用SITE-Pro对文献常检测的位点HEK293细胞系的site 1进行了脱靶检测，找到了更多的脱靶位点。
服务内容
| 服务项目 | 内容 | 周期 | 价格 | 交付形式 |
| SITE-Pro | 建库+测序+分析 | 25-35个工作日 | 12000元 | sgRNA质粒（可选）+原始数据+可视化结题报告 |
样品要求
- DNA样品总量：10ug以上，浓度50ng/ul以上；
- DNA样品纯度：OD260/280=1.8~2.0 ；
- DNA样品完整性：DNA无降解，需提供凝胶电泳检测胶图。
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