CRISPR 筛选结合单细胞测序（CROP-seq）

单细胞免疫组库(TCR/BCR-seq)测序

Clonotype 组成（如增殖性克隆，细胞类型间 clonotype overlap 情况，clonotype 多样性等），样本间 clonotype 组成（同一生物个体不同样本间 clonotype overlap 情况等） 单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近数千个细胞，可在一个样本中同时获5'端 mRNA 表达谱、TCR 和 BCR 的信息，结合基因的表达谱和 V(D)J 数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析。 实验流程 免疫组库测序实验

单细胞免疫组库（TCR/BCR-seq）测序

，clonotype多样性等），样本间clonotype组成（同一生物个体不同样本间clonotype overlap情况等） 单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近数千个细胞，可在一个样本中同时获5'端mRNA表达谱、TCR和BCR的信息，结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析。 实验流程 免疫组库测序实验流程如下： 基于TCR/BCR检测的V(D)J区域靠近5'端，故免疫组库测序所用磁珠标签序列由也单细胞最末端的polydT序列改为TSO序列，构成read

单细胞测序技术（scRNA-Seq）之 NCB 高分文章解析前列腺癌相关研究

腺癌淋巴结转移样本（batch2）进行单细胞测序，同样地发现所有肿瘤样本的 T 细胞普遍高表达 KLK3。有趣的是，其中一例前列腺癌患者的 MRI 影像及术后病理均提示左右两侧髂外淋巴结为阴性，而 scRNA-Seq 细胞亚群统计显示右侧淋巴结组织中存在高表达 KLK3 的 T 细胞，提示这可能已经形成了“转移前癌巢”结构；而左侧淋巴结组织中不仅存在高表达 KLK3 的 T 细胞，还存在恶性上皮细胞，即左侧淋巴结已发生了临床无法识别的微转移灶。 除了这一发现，我们还注意到 batch2 样本采用 BD