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从头测序
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0.22u
基因组de novo测序也叫做基因组从头测序，是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序，然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装，最终获得该物种基因组序列图谱的测序方法。该方法可以帮助研究者从基因组水平上对物种的生长、发育、进化、起源等重大问题进行研究，将加深研究者对物种的认识，在新基因的发现、物种改良等方面发挥巨大作用。
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文献和实验网上搜索“抗体从头测序”，搜索结果会展示一长串的资源和服务。关于该技术的描述太多了，有很多描述都大同小异。小编想借此文给大家说说我们为什么需要抗体从头测序以及如何进行抗体从头测序。 抗体从头测序的分类 抗体从头测序是根据抗体样品种类进行区分的。我们通常根据抗体的“克隆性”（ clonality）来描述抗体样品。克隆性是指样品中存在的不同抗体序列或遗传系谱的数量。 单克隆：样品中包含具有相同序列的抗体。单克隆性是进行抗体从头测序的前提条件。在极少数情况下，可以对单抗的简单混合物进行蛋白
比拟的。 能否以有限的成本用一台仪器产生足够数量的序列标记也是另一个需要改善的重要问题。这个问题已经被Roche公司解决了，应用他们的系统，仅花费阅读35bp或者更小片段的成本就能产生比35bp多10倍的序列标记。 一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤，可以非常轻松完成基因组重测序(re-sequence)。但是也应该看到，由于高通量测序读取长度的限制，使其在对未知基因组进行从头测序(novo sequencing)的应用
2003年，Ma等人开发了PEAKS。PEAKS是用于解析肽图谱的一种串联质谱蛋白质组学软件，可用于基于串联质谱的肽测序，蛋白质鉴定和蛋白质定量分析。他们在PEAKS方法中运用了新的从头测序模型和算法，分为四个步骤： 第一步将图谱进行预处理，包括图谱噪声过滤和图谱峰聚合； 第二步是在简化后的图谱中根据母离子质量列举出所有可能的候选肽段； 第三步和第四步为综合打分的差异分析以及分值正则化。 PEAKS蛋白质从头测序技术一般通过肽从头测序辅助的数据库搜索来进行肽鉴定。同时，它还通过基于肽序列标签
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