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微生物基因组测序
随着新一代高通量测序技术的飞速发展,微生物基因组研究日趋广泛。目前全球大约有5384种细菌、1658种真核微生物和208种古菌基因组研究项目已开展,微生物全基因组测序已逐步成为基础科学研究和产业化应用的常规手段。
应用领域
人体微生物: 解析人体微生物与人体间的相互关系,找到疾病关联的微生物,疾病诊断的生物靶标,微生态制剂 的开发;
宿主环境: 探索微生物与动物的互利共生关系,发现新基因,动物保健品开发;
工业环境: 监测发酵微生物的群落动态结构变化,筛选特殊功能酶,选育微生物功能菌;
生态环境: 土壤,水体,活性污泥,空气中微生物生态系统,开发新的微生物活性物质;
极端环境: 极地,冰川,深海微生物资源的勘探与代谢活性产物研究,新型天然药物的发现和筛选。
服务流程

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文献和实验了土壤的质量。土壤微生物多样性一般包括微生物分类群的多样性、遗传(基因) 多样性、生态特征多样性和功能多样性[3 ]。由于土壤微生物的复杂性、土壤本身的多变性和研究方法不完善等原因的限制, 以往人们对土壤微生物多样性的研究与动、植物相比远远落后。随着多聚酶链反应(PCR)、核酸测序等现代生物学分子生物学技术的迅速发展, 人们对土壤微生物多样性有了更多的了解;高通量测序技术的发展则为研究土壤宏基因组提供了大量数据,为直接探究土壤中的微生物群落结构提供了客观而全面的信息。 一、对土壤微生物进行
Roche 454(GS FLX Titanium System)超高通量测序技术原理
2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里程碑事件报道,开创了边合成边测序的先河。2007年又推出了性能更优的第二代基因组测序系统——Genome Sequencer FLX System。2008年10月,454推出了全新的GS FLX Titanium系列试剂和软件,让GS FLX的通量一下子提高了5倍,准确性和读长
芯片技术在检测小分子时遇到的技术难题(短序列,高度同源),而且小分子RNA的短序列正好配合了高通量测序的长度,使得数据“不浪费”,同时测序方法还能在实验中发现新的小分子RNA。 在DNA—蛋白质相互作用的研究上,染色质免疫沉淀—深度测序(ChIP-seq)实验也展示了其非常大的潜力。染色质免疫沉淀以后的DNA 直接进行测序,对比ref seq可以直接获得蛋白与DNA结合的位点信息,相比ChIP-chip,ChIP-seq可以检测更小的结合区段、未知的结合位点、结合
技术资料暂无技术资料 索取技术资料









