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锐博生物
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lncRNA、circRNA、mRNA qRT-PCR检测
锐博生物提供专业可靠的lncRNA、circRNA、mRNA qRT-PCR检测服务,能够确保基因表达检测实验的高灵敏及准确性。
lncRNA qRT-PCR实验服务
qRT-PCR技术以其高灵敏度及高准确性,已成为RNA表达丰度检测的一个重要标准,二代测序及芯片数据往往都需要qRT-PCR检测进行验证,常规实验中的相对定量检测或绝对定量检测,qRT-PCR也是最合适的方法。
目前数据库对lncRNA序列的收录及注释都不完备,大部分lncRNA的表达丰度也比较低,对lncRNA引物设计策略及qRT-PCR检测提出了一定的挑战。锐博生物有着丰富的lncRNA引物设计经验及qRT-PCR检测经验,为lncRNA检测提供真实而可靠的结果。
技术支持或应用实例

circRNA qRT-PCR实验服务
环状RNA是近年来非常受关注的一类单链闭环RNA,由RNA初级转录产物通过back-splicing而形成,除了成环junction之外,其它部分序列与线性转录本是一样的,故需通过divergent引物进行RT-PCR或qRT-PCR检测,而同一个线性转录本有可能剪切加工成多种circRNA,也会对circRNA的引物设计和检测带来更多的复杂性。锐博生物在circRNA引物设计及qRT-PCR检测方面有丰富的实践经验,从引物设计到qRT-PCR检测,都可以提供合适的方案及可靠的结果。

divergent primer示意图
circRNA鉴定实验服务
环状RNA(circRNA)是一类单链闭环RNA,一般由转录出来的线性RNA通过back-splicing而形成。由于RNA加工过程存在多样化的可变剪切,往往需要对高通量测序及生信分析得到的circRNA进行鉴定,包括对splice junction进行鉴定以及对circRNA的序列组成进行鉴定。下图为鉴定实验示意图,其中Forward Primer-1及Reverse Primer可以组合进行PCR或qPCR,对进行常规的circRNA表达丰度进行检测及对扩增产物进行测序以鉴定splice junction的确切序列(用过表达载体表达的circRNA成环准确性也可使用该对引物鉴定),而Forward Primer-2及Reverse Primer组合PCR的产物进行测序则可鉴定circRNA的序列组成。

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文献和实验【求助】miRNA mimic qRT-PCR检测可以提高多少倍?
nvonne 我购买的miRNA mimic 带FAM标记,本打算用流式检测转染效率,但发现荧光信号很弱,转染后采用定量PCR检测miRNA的表达变化,相对定量分析,发现mimic组比NC阴性对照组的miRNA表达量提高了100多倍,这虽然表明转染mimic成功,但总感觉这么高的变化有点太离谱了是不是?也没查到相关文献,谁能给我一些参考?非常感谢 zhujoker 顺转就是这么高,我的也是这样,有的能够上调1000倍
团体和科研机构使用不同的操作流程,必然导致大家使用不同定量的来源物以及数据分析:1. 新鲜、冰冻、甲醛固定的样品2. 整个组织样本,显微切割样本,单个细胞,组培细胞3. 总RNA或者mRNA4. RNA反转录成cDNA的不同的引发策略5. 不同的酶以及酶的不同组合6. 变异系数、灵敏度7. 多类型的检测化学方法,反应的条件,热循环仪的分析以及汇报方式。8. 每一步骤缺乏标准化分析流程造成了在样品的处理,内参的使用,归一化的方法,质量控制等等因素严重影响RT-qPCR的可信度,重复性。RNA 质量评价现在
. Drawback: rapidly dividing cells will have more rRNA and different rRNA/mRNA ratio which will complicate comparison; difference in cDNA synthesis not taken into account. Genomic DNA Genomic DNA or cell number. Drawbacks: RNA degrades faster than RNA
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