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NanoHema Panel v2.0

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  • Nanodigmbio
  • 中国南京
  • 1001704(16 rxn)/1001705(96 rxn)
  • 2026年01月03日
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      NanoHema Panel v2.0

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      纳昂达(南京)

    NanoHema Panel v2.0 靶向 481 个血液肿瘤相关基因,全面覆盖碱基替换、插入/缺失、基因扩增及融合基因等多种变异类型。该 Panel 由 DNA 和 RNA 两部分组成:DNA 部分覆盖 1.7 Mb 基因组区域,包含 436 个基因的全部编码区、12 个基因的部分内含子区及 IGH 基因 Switch 区;RNA 部分覆盖 146 个基因,优化融合基因检测。NanoHema Panel v2.0 通过多组学整合、高靶向性设计及临床实用性优化,为血液肿瘤的精准诊断、治疗决策及全程管理提供了高效、经济的分子检测方案。

    产品特色

    ● 多类型变异覆盖更全面
    涵盖 481 个血液肿瘤相关基因,全面解析碱基替换、插入/缺失、扩增及融合基因等多种变异类型。

    ● 双流程协同结果更准确
    RNA 流程有效弥补 DNA 流程的局限,不仅精准识别融合基因伴侣,还能验证融合事件的功能性影响,双流程多维互补保障检测结果的全面性和准确性。

    ● 个性化定制服务更灵活
    支持 Panel 灵活拆分或增加目标基因,精准适配不同类型血液肿瘤的检测需求,满足科研探索或临床诊断的多元场景应用。

     

    产品表现

    NanoHema Panel v2.0_DNA——捕获表现

    图1

    图 1. NanoHema Panel v2.0_DNA 对不同样本的捕获表现。A. 比对率&中靶率;B. 靶区域覆盖度;C. 平均测序深度 (去重后);D. GC 偏好性。50 ng 不同类型 gDNA 样本利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行预文库构建,以 NanoHema Panel v2.0_DNA 搭配 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获。测序模式分别为 Novaseq 6000,PE150 和 DNBSEQ-T7,PE150;随机选取 1.3 Gb 进行数据分析。
    注:LDT-831 样本为血液肿瘤 gDNA 质控品 (LDT Bioscience,LDT-831A:AF = 5%;LDT-831D:AF = 0%);Male 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)。

    NanoHema Panel v2.0_DNA——多类型变异稳定检出

    表 1. NanoHema Panel v2.0_DNA 对不同标准品中多类型变异的检出情况。

    图1

    NanoHema Panel v2.0_RNA——捕获表现

    图1

    图 2. NanoHema Panel v2.0_RNA 捕获测序数据组成。50 ng K562 细胞系 RNA 以 NadPrep® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep® DNA Library Preparation Kit v2 进行预文库构建,以 NanoHema Panel v2.0_RNA 搭配 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获。测序模式分别为 Novaseq 6000,PE150 (A) 和 DNBSEQT7, PE150 (B)。以 Salmon 进行分析。

    NanoHema Panel v2.0_RNA——融合基因检出情况

    表 2. NanoHema Panel v2.0_RNA 对 K562 细胞系 RNA 中融合基因的检出。

    图1

    注:每百万 read pair。测序数据以 Arriba 进行分析。

     

    基因列表

     

    NanoHema Panel v2.0_DNA_436 genes_Full CDS
    ABL1 ABL2 ACTB AKT1 AKT2 AKT3 ALK AMER1 ANKRD26 AP3B1 APC AR ARAF ARHGAP26 ARID1A
    ARID1B ARID2 ARID5B ASXL1 ASXL2 ASXL3 ATG5 ATM ATR ATRX ATXN1 AURKA AURKB AXIN1 AXL
    B2M BAALC BAP1 BARD1 BCL10 BCL11A BCL11B BCL2 BCL6 BCL7A BCOR BCORL1 BIRC3 BLM BLNK
    BRAF BRCA1 BRCA2 BRD4 BTG1 BTG2 BTK BTLA CALR CARD11 CBFB CBL CBLB CCND1 CCND2
    CCND3 CCNE1 CCR4 CCR7 CCT6B CD22 CD27 CD274 CD28 CD58 CD70 CD79A CD79B CD83 CDC42
    CDC73 CDH1 CDK12 CDK4 CDK6 CDK8 CDKN1A CDKN1B CDKN1C CDKN2A CDKN2B CDKN2C CEBPA CEP57 CHD2
    CHD8 CHEK1 CHEK2 CIITA CKS1B CREBBP CRLF2 CSF1R CSF3R CTCF CTLA4 CTNNB1 CUX1 CXCR4 CYLD
    DAXX DDR2 DDX3X DDX41 DHX15 DNM2 DNMT3A DOT1L DTX1 DUSP2 DUSP22 EBF1 ECT2L EED EGFR
    EP300 EPCAM EPHA2 EPHA3 EPHA5 EPHA7 EPOR ERBB2 ERBB3 ERBB4 ERCC4 ERG ESR1 ETNK1 ETS1
    ETV1 ETV4 ETV6 EZH2 FAM46C FANCA FANCC FANCD2 FANCE FANCF FANCG FANCI FANCJ FANCL FANCM
    FAS FAT1 FAT4 FBXO11 FBXW7 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FGFR4 FH FLCN FLT1 FLT3 FLT4 FOXO1
    FOXO3 FOXP1 FYN GADD45B GATA1 GATA2 GATA3 GNA11 GNA13 GNAQ GNAS GNB1 GRIN2A HACE1 HBA1
    HBA2 HBB HDAC1 HDAC4 HDAC7 HGF HIST1H1A HIST1H1C HIST1H1D HIST1H1E HNF1A HRAS ID3 IDH1 IDH2
    IFNAR2 IGF1R IGH IGK IGL IGLL5 IKBKE IKZF1 IKZF2 IKZF3 IL3 IL7R INPP4B INPP5D IRF1
    IRF4 IRF8 ITK ITPKB JAK1 JAK2 JAK3 JARID2 JUN KAT6A KDM2B KDM5A KDM5C KDM6A KDR
    KIT KLF2 KLHL5 KLHL6 KMT2A KMT2B KMT2C KMT2D KRAS LEF1 LMO2 LRP1B LTB LYN LYST
    MAF MAFB MALT1 MAP2K1 MAP2K2 MAP2K4 MAP3K1 MAP3K14 MAPK1 MCL1 MDM2 MDM4 MED12 MEF2B MEF2D
    MEN1 MET MFHAS1 MGA MITF MLH1 MPL MSH2 MSH3 MSH6 MTOR MUTYH MYB MYC MYCL
    MYCN MYD88 NBN NCKAP1L NCSTN NF1 NF2 NFE2L2 NFKB1 NFKB2 NFKBIA NFKBIE NKX2-1 NLRC4 NOTCH1
    NOTCH2 NPM1 NRAS NSD1 NT5C2 NTRK1 NTRK3 NUP98 P2RY8 PAG1 PAK3 PALB2 PAX5 PBRM1 PC
    PDCD1 PDCD1LG2 PDGFRA PDGFRB PDK1 PHF6 PIK3CA PIK3CD PIK3R1 PIK3R2 PIM1 PLCG1 PLCG2 PML PMS2
    POLE POT1 POU2AF1 PPM1D PPP2R1A PRDM1 PRF1 PRKCB PRPF8 PTCH1 PTEN PTPN1 PTPN11 PTPN2 PTPN6
    PTPRD PTPRK PTPRO RAB27A RAD21 RAD50 RAD51 RAF1 RARA RASGEF1A RB1 RECQL4 REL RELN RET
    RHOA RICTOR RNF43 ROS1 RPL10 RPS15 RPTOR RUNX1 SAMD9 SAMD9L SBDS SDHA SDHB SDHC SDHD
    SETBP1 SETD2 SF3B1 SGK1 SH2B3 SH2D1A SLC19A1 SLC7A7 SMAD2 SMAD4 SMARCA2 SMARCA4 SMARCB1 SMC1A SMC3
    SMO SOCS1 SOX11 SOX2 SPEN SPOP SRC SRP72 SRSF2 STAG2 STAT3 STAT4 STAT5A STAT5B STAT6
    STK11 STX11 STXBP2 SUFU SUZ12 SYK TBL1XR1 TCF3 TCL1A TERC TERT TET1 TET2 TET3 TGFBR2
    TNFAIP3 TNFRSF11A TNFRSF14 TNFRSF17 TNFRSF1B TOP1 TOP2A TP53 TP63 TP73 TRAF2 TRAF3 TRAF5 TSC1 TSC2
    TSHR TYK2 U2AF1 UNC13D VAV1 VHL WHSC1 WT1 XIAP XPC XPO1 ZAP70 ZBTB7A ZEB2 ZMYM3
    ZRSR2                            
    NanoHema Panel v2.0_DNA_12 genes_Selected Intron
    ALK BCL6 BCR BRAF ETV6 JAK2 KMT2A MYC PDGFRA PDGFRB RARA RET      
    NanoHema Panel v2.0_RNA_146 genes
    ABL1 ABL2 ALK ARHGAP26 ARID1A ASXL1 ATG5 BCL10 BCL11A BCL11B BCL2 BCL3 BCL6 BCL7A BCL9
    BCOR BCR BIRC3 BRAF BTG1 CBFA2T3 CBFB CBL CCND1 CCND2 CCND3 CD274 CDK6 CEBPE CIITA
    CREBBP CRLF2 CTNNB1 DEK DUSP22 DUX4 EGFR EP300 EPOR ERBB2 ERG ETS1 ETV1 ETV4 ETV6
    EWSR1 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FOXO1 FOXO3 FOXP1 GLIS2 HLF IGH IGK IGL IKZF1 IL3 IRF4
    ITK JAK1 JAK2 JAK3 KAT6A KIF5B KMT2A LMO1 LMO2 LYN MAF MAFB MALT1 MECOM MEF2D
    MLLT1 MLLT10 MLLT3 MN1 MTCP1 MYB MYC MYH11 NCOA2 NCOR1 NF1 NF2 NFKB2 NOTCH1 NPM1
    NSD1 NTRK1 NTRK3 NUP214 NUP98 NUTM1 P2RY8 PAX5 PBX1 PDCD1LG2 PDGFRA PDGFRB PICALM PIM1 PML
    POU2AF1 PRDM1 PTCH1 RAF1 RARA RARB RARG RBM15 RET ROS1 RUNX1 RUNX1T1 STAT6 STIL SYK
    TAF15 TAL1 TBL1XR1 TCF3 TCL1A TCL1B TET1 TLX1 TLX3 TNFRSF11A TOP1 TP63 TPM3 TPM4 TRA
    TRB TRD TRG TYK2 VAV1 WHSC1 ZBTB16 ZEB2 ZNF292 ZNF362 ZNF384        

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