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NadPrep®️ 血浆游离
企业认证
1
NadPrep cfDNA Library Preparation Kit (for MGI)
纳昂达(南京)
-20℃
该试剂盒搭配双端分子标签(Bi-Molecular Identifier, BMI)接头,可满足血浆游离 DNA 低频突变分析的需求。
应用方向
样本类型
推荐起始量
全基因组测序
血浆游离 DNA(无大片段污染)
≥ 1 ng(依据检测需求调整)
靶向捕获测序
文库产出稳定高效
图1. NadPrep®️ 血浆游离 DNA 双端分子标签文库构建试剂盒(for MGI)对不同 DNA 起始量的文库产出。A. 搭配 NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module 时 cfDNA 文库的产出稳定;B. 搭配 MDI 接头模块时的 cfDNA 文库片段分布示例(Agilent 2100 Bioanalyzer)。
分子标签助力低频突变分析
图2. 双端分子标签分析原理示意图。
来源于两个健康捐献者的 cfDNA 以 1% 比例混合,文库制备总投入量为 10 ng,人工模拟 1% 及 0.5% 突变。在 MGISEQ-2000 测序平台上,利用双端分子标签,在不同分析与过滤方法下进行低频突变分析的结果示例如下。
表1. 低频突变分析过滤方法
分析与过滤方法
详情
No BMI
根据片段在基因组上比对的起始、终止位点去除重复。
SSCS
利用单链分子标签进行一致性分析(Call Molecular Consensus Reads),形成单链一致性序列(Single Strand Consensus Sequence, SSCS)。
DCS211 / DCS633
利用双链分子标签,即互补链(Top / Bottom)分子标签进行一致性分析,形成双链一致性序列(Duplex Consensus Sequence, DCS),且 Top 与 Bottom Reads 均 ≥1(DCS211)/ 3(DCS633)。
DCS211 (≥ 2) / DCS633 (≥ 2)
在DCS211 / DCS633 的基础上,支持该突变的DCS一致性序列 ≥ 2。
图3. 不同分析模式对于 1% 和 0.5% 模拟突变位点的 A. 灵敏度与 B. 阳性预测值。
图4. 不同分析模式对背景 “噪音” 的过滤情况。
类别
产品
货号
建库模块
NadPrep®️ DNA Library Preparation Module (for MGI), 24 rxn
24 rxn
1002211
NadPrep®️ DNA Library Preparation Module (for MGI), 96 rxn
96 rxn
1002212
单端接头模块
NadPrep®️ BMI Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn
SI 1-12
1003811
NadPrep®️ BMI Adapter (SI) Module Set D1 (for MGI), 480 rxn
SI 1-96
1003820
NadPrep®️ BMI Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn
SI 1-24
1003821
NadPrep®️ BMI Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn
SI 25-48
1003822
双端唯一接头模块
NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn
MDI 1-12
1003911
NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn
MDI 1-24
1003921
NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn
MDI 25-48
1003922
NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn
MDI 49-72
1003925
NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn
MDI 73-96
1003926
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