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在真核生物中，核DNA并不是裸露的，而是与组蛋白结合后压缩形成紧密的染色体高级结构。DNA在复制转录时，需要将DNA的紧密结构打开，这部分打开的染色质，就是开放染色质；开放染色质允许其他调控因子与之结合，这一特性被称为染色质的可及性，染色质的可及性被认为与转录调控密切相关
ATAC-seq是一种表观遗传学研究技术，该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割，进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列，并且通过分析染色质开放区域的motif，可以获得潜在的活跃转录因子及其靶基因。
技术原理：
技术优势：
1、灵敏性高，低起始量细胞，每个样本50000个细胞即可
2、zui新的优化技术方案，有效降低线粒体DNA的数据污染
3、实验步骤简化，实验重复性好，成功率高
4、信息量大，能同时揭示开放染色质的基因组位置，DNA结合蛋白，转录结合位点的相互作用
5、结果呈现直观，与Chip-seq/DNA甲基化等复杂表观技术相比，ATAC-seq结果简单易懂，可以直接关联到下游基因的转录表达，是表观研究的最佳入门技术
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ATAC-seq利用转座酶研究染色质可接近性数据分析工具全面介绍
酶 Tn5 获取开放染色质区域，并进行高通量测序和生物信息学分析，以此挖掘转录调控和表观修饰方面的信息。ATAC-seq 仅需要 500-50000 个细胞且操作简单有效，是当前一项重要的研究手段。但是其生物信息分析工具大多数使用 Chip-seq 和 DNas-seq 中使用的工具。而且，目前仍然没有对其分析工具的全面介绍。 2020 年 2 月 3 日，来自澳大利亚维克墨尔本莫纳什大学中央临床学院的 Nicholas C. Wong 团队在 Genome Biology 发表
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