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吉凯基因
表观研究利器ATAC-seq
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产品简介:
在真核生物中,核DNA并不是裸露的,而是与组蛋白结合后压缩形成紧密的染色体高级结构。DNA在复制转录时,需要将DNA的紧密结构打开,这部分打开的染色质,就是开放染色质;开放染色质允许其他调控因子与之结合,这一特性被称为染色质的可及性,染色质的可及性被认为与转录调控密切相关
ATAC-seq是一种表观遗传学研究技术,该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列,并且通过分析染色质开放区域的motif,可以获得潜在的活跃转录因子及其靶基因。
技术原理:
技术优势:
1、灵敏性高,低起始量细胞,每个样本50000个细胞即可
2、zui新的优化技术方案,有效降低线粒体DNA的数据污染
3、实验步骤简化,实验重复性好,成功率高
4、信息量大,能同时揭示开放染色质的基因组位置,DNA结合蛋白,转录结合位点的相互作用
5、结果呈现直观,与Chip-seq/DNA甲基化等复杂表观技术相比,ATAC-seq结果简单易懂,可以直接关联到下游基因的转录表达,是表观研究的最佳入门技术
在真核生物中,核DNA并不是裸露的,而是与组蛋白结合后压缩形成紧密的染色体高级结构。DNA在复制转录时,需要将DNA的紧密结构打开,这部分打开的染色质,就是开放染色质;开放染色质允许其他调控因子与之结合,这一特性被称为染色质的可及性,染色质的可及性被认为与转录调控密切相关
ATAC-seq是一种表观遗传学研究技术,该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列,并且通过分析染色质开放区域的motif,可以获得潜在的活跃转录因子及其靶基因。
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1、灵敏性高,低起始量细胞,每个样本50000个细胞即可
2、zui新的优化技术方案,有效降低线粒体DNA的数据污染
3、实验步骤简化,实验重复性好,成功率高
4、信息量大,能同时揭示开放染色质的基因组位置,DNA结合蛋白,转录结合位点的相互作用
5、结果呈现直观,与Chip-seq/DNA甲基化等复杂表观技术相比,ATAC-seq结果简单易懂,可以直接关联到下游基因的转录表达,是表观研究的最佳入门技术
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