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吉凯基因
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文献和实验Science:颉伟 / 陈子江 / 赵涵团队揭示人类早期胚胎翻译组图谱并发现 TPRXs 参与人类合子基因组激活
调控因子 TPRXL, TPRX1, 和 TPRX2。 通过结合超灵敏翻译组测序技术 Ribo-lite (Ligation-free, ultra-low-InpuT and Enhanced Ribo-seq) 和转录组测序技术(Smart-seq2)而开发出的 Ribo-RNA-lite (R2-lite) 方法可以进行翻译组与转录组联合测序,该方法被应用于人类卵子和早期胚胎共 8 个时期。经翻译组分析比较发现,在卵子向早期胚胎转变过程中,人-鼠同源基因中有一半呈现保守的翻译
-tool利用 464 个 RNA-seq 测序数据,进行新 circRNA 预测及基因组注释,并计算已知的及新预测的 circRNA 表达情况,构建 circRNA-miRNA-genet 调控网络,以上信息均可从该数据库获得。物种为人。4.deepBase v2.0网站链接:http://www.rna-seqblog.com/deepbase-v2 - 0 -identification-expression-evolution-and-function-of-small-rnas-lncrnas
样本RNA提取、去除残留DNA及RNA质检后,我们需要决定是否以及如何去富集感兴趣的RNA。总RNA中含有大量的核糖体 RNA (rRNA),约占总RNA 80 – 98%的比例。对绝大多数 RNA-Seq 应用来说,需要去除 rRNA 或富集mRNA,以将测序资源集中在转录组所需的部分并节省成本。 除核糖体 RNA 外,样本还可能含有其他丰富的转录本,例如,血液样本中的珠蛋白 mRNA 可占所有 mRNA 分子的 30 – 80%。如果不除去这些占比很大的globin mRNA,我们测序
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