ChIP测序 | 核酸-蛋白互作研究

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核酸-蛋白互作研究系列产品：ChIP测序、 RIP测序、 CLIP测序、 MeRIP测序

简介
ChIP-seq是将染色质免疫共沉淀与高通量测序相结合的技术，通过蛋白免疫相互作用，用抗体把和染色质相互作用的蛋白（如组蛋白、转录因子等）沉淀下来，捕捉到细胞内动态的、瞬时的蛋白质与DNA之间的相互作用，从而所获取与其相结合的DNA序列，确定各种转录影响因子以及非组蛋白染色体结合蛋白在染色质上的具体位置。可以一次性得到目的蛋白在整个基因组上的结合分布，得到目的蛋白精确的结合位点以及结合基序等信息，若同时辅以转录组测序，则可以得到目的蛋白对全细胞基因表达的调控模式，大幅提高对目的蛋白的功能认识。

作为国内核酸-蛋白互作研究服务的领跑者，公司已完成1000多项ChIP-seq、RIP-seq、CLIP-seq实验及测序分析服务，包括动物（人、小鼠、大鼠、羊、鸡、斑马鱼等）、植物（水稻、拟南芥、小麦、二穗短柄草、马铃薯、番茄、苹果等）、微生物（大肠杆菌、禾谷镰刀菌等）近50余种物种的CHIP-seq和RIP-seq，其中组蛋白ChIP-seq成功率接近100%，转录因子ChIP-seq成功率超过95%，RIP-seq、CLIP-seq成功率接近95%。

康测技术优势

1. 优化的ChIP实验体系，ChIP建库起始量低至1~30ng DNA；
2. 武汉康测科技专攻IP（ChIP、RIP、CLIP）的博硕团队，拥有十年丰富的项目经验积累；
3. 为客户选择抗体提供辅助指导，并对抗体进行质检、效价分析，提供文章发表质量的IP报告；
4. 特有的Peak calling技术；
5. 提供个性化的分析报告，可根据客户需要提供关联分析、解析目的蛋白调控机制。

建库方法                                                       技术流程

    

分析结果展示

A：IP质检结果（input：样品裂解液中目的蛋白检测结果，IP：抗体富集目的蛋白检测结果，IgG：IgG富集目的蛋白结检测果）；
B：Reads在基因上下游的分布，结合峰主要位于转录起始位点（TSS）上游区域（ChIP_1/2/3为3个生物学重复）；
C：Peak在基因组各功能区的分布；
D：Peak的Motif分析。

武汉康测科技有限公司是由加州大学圣地亚哥分校（UCSD）、武汉大学、华中农业大学博士团队创建的高新技术企业。截至2017年底，团队核心成员已在Nature、Cell、Molecular Cell、Nat. Struct. Mol. Biol.、Proc Natl Acad Sci USA、Cell Reports等国际顶刊发表文章十余篇。公司秉承技术创新、服务至上的核心理念，与多所985/211院校、中国科学院的实验室建立了长期合作关系。

公司研发团队于2017年成功开发出绝对定量转录组（KC-DigitalRNA）、免疫组库（KC-IRQuant）、16S rDNA绝对定量、ctDNA检测（KC-SMP）等4项建库技术，并成功申请发明专利和配套数据分析系统的软件著作权。成为中国首.家UID（UMI）绝对定量高通量测序服务平台，为广大科研工作者提供转录组（mRNA、lncRNA）/TCR/BCR/ctDNA/肠道微生物多样性等多种绝对定量测序服务。