
测序高级分析
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- 广东广州
- 2025年07月03日
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明领基因
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文献和实验1、PCR 产物测序时出现重叠峰 问题图1(模板中有碱基缺失,往往是单一位点(1-1)或两个位点(1-2)碱基缺失导致测序结果移码) 图1-1 图1-2 解决方法:将PCR 产物克隆到质粒(如T 载体)中挑单克隆测序,或将PCR 产物进行PAGE纯化(至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化)后再进行测序。问题图2(PCR 产物不纯,含部分序列一致的两种以上的片段,长度不一) 图2 解决方法:主要原因是PCR 产物没有纯化,含有部分序列一致的两种以上长度不一的片段
1、PCR 产物测序时出现重叠峰问题图1【模板中有碱基缺失,往往是单一位点(1-1)或两个位点(1-2)碱基缺失导致测序结果移码】图1-1解决方法:将PCR产物克隆到质粒(如T载体)中挑单克隆测序,或将PCR产物进行PAGE纯化(至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化)后再进行测序。问题图2(PCR产物不纯,含部分序列一致的两种以上的片段,长度不一)解决方法:主要原因是PCR产物没有纯化,含有部分序列一致的两种以上长度不一的片段,将PCR产物进行PAGE纯化(至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化)后再进行测序
结构等。此外,另一种情况为反应中途出现的套峰现象,此种情况一般为DNA结构中的重复序列,造成测序用引物和模板之间有二个以上的结合位点。具体问题分析如下: 1: 测序结果有很多套峰,出现很多N值原因分析:PCR产物直接进行测序,在PCR产物长度以后将无反应信号,机器将产生许多N值。 在序列的起始端出现N值,主要是由于有未去除的染料单体造成的干扰峰,是机器无法正确判读出位何值。有时,引物二聚体或者起始端小片段的丢失,也会出现N值。模版本身含杂合序列,有等位基因。 2:为什么找不到我的PCR引物
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