
MethStausBrowser基因组甲基化状态分析系统
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- 2025年07月07日
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MethStausBrowser基因组甲基化状态分析系统
系统简介
能过处理的数据类型
分析流程
技术支持以及软件特性
使用案例
为了鉴定肝癌细胞特有的异常甲基化,对来自于若干个肝癌细胞系和正常组着对照德甲基化状态芯片作了如下分析。分析流程如下图,
我们可以得到以下差异甲基化区域列表,
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文献和实验crazygreat 各位大侠,小弟现在做的实验需要进行全基因组甲基化状态的测定,有谁知道有没有这方面的试剂盒吗,或者大家都选择什么方法进行这种实验? freecell 为了定量测定人基因组中的甲基化,哈佛大学的 George Church等,以及加州大学的Kun Zhang连同弗吉尼亚联邦大学的Yuan Gao等,将传统的甲基化工具如DNA的重亚硫酸盐转化与近期开发的目标基因组捕获技术和高通量测序相结合。
开始投资和实施人类表观基因组计划(HEP)。其主要任务是绘制出人类基因组中甲基化可变位点图谱,即不同组织与疾病状态下,5-甲基胞嘧啶出现及其分布频率的图谱,以指导和系统地研究DNA甲基化在人类表观遗传、胚胎发育、基因印记、等位基因失活及肿瘤发生中的重要作用[2]。DNA甲基化的研究,逐渐成为新的研究热点。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。让我们一一介绍现有的大部分DNA甲基化研究方法,并对其相关特性进行简要分析与总结。 1导言 1.1 DNA甲基化
[46,49]能对整个基因组的甲基化状态进行分析,发现新甲基化基因的方法。这种方法联合使用了限制性内切酶及二维电泳。其过程是:先用甲基化敏感的稀频限制性内切酶NotⅠ消化基因组DNA,甲基化位点保留,标记末端、切割、行一维电泳,随后再用更高频的甲基化不敏感的内切酶切割,行二维电泳,这样甲基化的部分被切割开并在电泳时显带,得到RLGS图谱与正常对照得出缺失条带即为甲基化的可能部位[5]。 这种方法可同时分析不同肿瘤中甲基化模式的异同和寻找肿瘤内DNA甲基化的新靶点,由于新发现的甲基化新靶点的作用尚不
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