
基因组功能注释与分析服务
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- 2025年07月16日
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基因组功能注释与分析
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- 蛋白质功能分类
- 蛋白质亚细胞定位
- rRNA和tRNA基因预测
- IS element和Prophage预测
- Paralog和Ortholog计算
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- 基因岛和水平转移基因的发现
- 基因组多态性的分析
- 基于同源基因的DN/DS计算的进化分析
- 基因的预测及注释
- 基因功能的COG分类和毒性因子的预测
- 根据基因的功能分类构建圈图
- GC含量和编码偏好性以及插入序列和tRNA的位置判断定位毒力岛(PAI)
- 基因组多态性结合进化选择性的分析
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- 根据基因的功能和在基因组的位置结构信息找出潜在的基因簇和基因岛
- 基于同源基因的预测,利用KEGG数据库的Pathway信息,对微生物的重要代谢通路和关键酶的发现
- 关键酶的进化分析和对主要功能结构域的预测
- 根据分析设计实验对关键酶进行分子水平的改造
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文献和实验DAVID(the Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery),它是一个生物信息数据库,整合了生物学数据和分析工具,为大规模的基因或蛋白列表(成千上百个基因 ID 或者蛋白 ID 列表)提供系统综合的生物功能注释信息,帮助用户从中提取生物学信息(想了解更多,转战度娘~)。Tips: 通过 DAVID 对肿瘤相关基因做功能注释和富集分析。打开 DAVID 平台http://david.abcc.ncifcrf
有这个东西)。你的耐药基因存在不表达是不是因为什么因素影响其上游的甲基化或者说是其他修饰。 个人建议你先做一个5’RACE,先看看你的耐药基因上游的基因组序列到底是个什么情况,要不你即使做一个基因组测序又能怎么样?或者说哺乳动物基因组可以通过EMSA来证实调控什么的,5你的5’RACE出来后也可以分析一下你的上游是不是有其他调控蛋白结合,这样的话你会清楚点吧。 个人观点,仅供参考! 本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验
随着人类基因密码解读完成,伴随而来的大量 DNA 序列资料,马上产生一个重要的课题,即如何从这些资料中,找到大约四万个人类的主要基因。人类的 DNA 序列中大概仅有不到 5% 是能产生蛋白质的基因,因此要从人类基因组中辨认出有功能的基因,首先就必须了解基因的结构。一般来说,人类基因可概分为以下几个部分:激活子、5'非转译区、表现序列、内子、3'非转译区、聚腺启酸化作用点,其中只有表现序列才携带产生蛋白质的讯息。 因此,辨认基因的计算机程序,最主要的任务就是从 DNA 序列中
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