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SysQuant:基于质谱的定量软件（标记定量和非标记定量）
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SysQuant是用于蛋白质组数据分析基于质谱的定量分析软件，支持了标记定量和非标记定量多种的实验方法。采用mzXML数据输入方式，能支持不同厂商的高分辨率质谱仪器，具有较好的通用性。可根据Sequest等定性软件输出得到肽段和蛋白质的定量结果，与国际上同类的软件相比具有更高的精度和较好的易用性。
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基于MS强度或计数的数据依赖法非标记定量蛋白质组学的蛋白质互作分析（一）
本期要介绍到的是基于MS强度或计数的数据依赖法非标记定量蛋白质组学的蛋白质互作分析。 在试验中使用不同的同位素标记（某些情况下等压标记）是一种行之有效的肽和蛋白质定量方法。通常，分析之前，标记样品和未标记样品是混合在一起的，这时可以通过测量相应的峰值强度来直接确定化合物比率。标记大致可以分成这些共价附着在肽上的标记，包括同位素编码的亲和标签、ICAT或iTRAQ、通过酶反应合成（例如通过胰蛋白酶合成18O）或通过代谢合成（例如在细胞培养中用氨基酸标记稳定同位素）、SILAC等。在蛋白质互作
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