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- 免疫共沉淀(CHIRP)实验服务
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- 2025年12月11日
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- 提供商：
晶莱生物
- 服务名称：
免疫共沉淀(CHIRP)实验服务
- 规格：
实验服务
RNA绑定的DNA和蛋白相互作用：CHIRP
免疫共沉淀实验(Chromatin Isolation by RNA Purification，CHIRP)是一种检测体内与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法，可同时分析lncRNA/circRNA 、蛋白及DNA三者互作关系。
CHIRP实验意义
lncRNA可与蛋白质、DNA和RNA相互作用，实现多样化功能，CHIRP可以探讨lncRNA与其互作的DNA、蛋白质的功能与作用机制，是相关科学研究工作的有力工具。lncRNA的研究在表观遗传调控等生命活动中发挥重要作用，CHIRP是研究lncRNA的重要技术手段，可在全基因组范围内鉴定RNA与染色质的互作，并对其进行定性、定量及定位的分析。
CHIRP实验原理
CHIRP（Chromatin Isolation by RNA Purification）是通过结合生物素的核酸探针，将目标RNA拉下来，与之共同作用的DNA染色体片段（DNA与蛋白质复合体）就会被吸附下来，最后可以通过qRT-PCR、WB、测序分析和质谱分析等检测RNA、DNA和蛋白质。
CHIRP的实验流程
①探针设计：设计反义寡核苷酸探针；
②细胞培养；
③破碎细胞；
④生物素标记的DNA探针与RNA杂交；
⑤CHIRP；
⑥RNA、DNA及核酸结合蛋白提取；
⑦分析检测。
CHIRP的实验流程
①探针设计：设计反义寡核苷酸探针；
②细胞培养；
③破碎细胞；
④生物素标记的DNA探针与RNA杂交；
⑤CHIRP；
⑥RNA、DNA及核酸结合蛋白提取；
⑦分析检测。
结果展示
实验完成周期及交付标准
1. 实验周期：1-3个月
2. 交付标准：CHIRP鉴定结果报告、分析报告、实验报告（试剂、耗材、实验步骤）、原始数据等
实验需与客户确认的信息
1. 目的基因与蛋白信息。
2. 样本类型与种属
3. 是否需要生信分析
参考文献
[1] Iyer S , Modali S D , Agarwal S K . The Long Non-Coding RNA MEG3 is an Epigenetic Determinant of Oncogenic Signaling in Functional Pancreatic Neuroendocrine Tumor Cells[J]. Molecular and Cellular Biology, 2017:MCB.00278-17.
[2] Chu C , Chang H Y . Understanding RNA-Chromatin Interactions Using Chromatin Isolation by RNA Purification (ChIRP).[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480.
[3] Zhu J J , Fu H J , Wu Y G , et al. Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. Science China Life Sciences, 2013, 56(10):876-885.
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[1] Iyer S , Modali S D , Agarwal S K . The Long Non-Coding RNA MEG3 is an Epigenetic Determinant of Oncogenic Signaling in Functional Pancreatic Neuroendocrine Tumor Cells[J]. Molecular and Cellular Biology, 2017:MCB.00278-17.
[2] Chu C , Chang H Y . Understanding RNA-Chromatin Interactions Using Chromatin Isolation by RNA Purification (ChIRP).[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480.
[3] Zhu J J , Fu H J , Wu Y G , et al. Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. Science China Life Sciences, 2013, 56(10):876-885.
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