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  • 免疫共沉淀(CHIRP)实验服务
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      晶莱生物

    • 服务名称

      免疫共沉淀(CHIRP)实验服务

    • 规格

      实验服务

    RNA绑定的DNA和蛋白相互作用:CHIRP
     

    免疫共沉淀实验(Chromatin Isolation by RNA Purification,CHIRP)是一种检测体内与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法,可同时分析lncRNA/circRNA 、蛋白及DNA三者互作关系。

     
    CHIRP实验意义
    lncRNA可与蛋白质、DNA和RNA相互作用,实现多样化功能,CHIRP可以探讨lncRNA与其互作的DNA、蛋白质的功能与作用机制,是相关科学研究工作的有力工具。lncRNA的研究在表观遗传调控等生命活动中发挥重要作用,CHIRP是研究lncRNA的重要技术手段,可在全基因组范围内鉴定RNA与染色质的互作,并对其进行定性、定量及定位的分析。
     
    CHIRP实验原理
    CHIRP(Chromatin Isolation by RNA Purification)是通过结合生物素的核酸探针,将目标RNA拉下来,与之共同作用的DNA染色体片段(DNA与蛋白质复合体)就会被吸附下来,最后可以通过qRT-PCR、WB、测序分析和质谱分析等检测RNA、DNA和蛋白质。

    CHIRP的实验流程
    ①探针设计:设计反义寡核苷酸探针;
    ②细胞培养;
    ③破碎细胞;
    ④生物素标记的DNA探针与RNA杂交;
    ⑤CHIRP;
    ⑥RNA、DNA及核酸结合蛋白提取;
    ⑦分析检测。
     
    结果展示
     
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    实验完成周期及交付标准
    1. 实验周期:1-3个月
    2. 交付标准:CHIRP鉴定结果报告、分析报告、实验报告(试剂、耗材、实验步骤)、原始数据等
     
    实验需与客户确认的信息
    1. 目的基因与蛋白信息。
    2. 样本类型与种属
    3. 是否需要生信分析
     
    参考文献
    [1] Iyer S , Modali S D , Agarwal S K . The Long Non-Coding RNA MEG3 is an Epigenetic Determinant of Oncogenic Signaling in Functional Pancreatic Neuroendocrine Tumor Cells[J]. Molecular and Cellular Biology, 2017:MCB.00278-17.
    [2] Chu C , Chang H Y . Understanding RNA-Chromatin Interactions Using Chromatin Isolation by RNA Purification (ChIRP).[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480.
    [3] Zhu J J , Fu H J , Wu Y G , et al. Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. Science China Life Sciences, 2013, 56(10):876-885.
     

    晶莱生物服务流程
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    该产品被引用文献
    [1] Iyer S , Modali S D , Agarwal S K . The Long Non-Coding RNA MEG3 is an Epigenetic Determinant of Oncogenic Signaling in Functional Pancreatic Neuroendocrine Tumor Cells[J]. Molecular and Cellular Biology, 2017:MCB.00278-17.
    [2] Chu C , Chang H Y . Understanding RNA-Chromatin Interactions Using Chromatin Isolation by RNA Purification (ChIRP).[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480.
    [3] Zhu J J , Fu H J , Wu Y G , et al. Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. Science China Life Sciences, 2013, 56(10):876-885.
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      转录因子靶基因的高通量筛选;② ChIP与高通量测序相结合建立的ChIP-Seq方法,广泛用于特定转录因子靶基因的高通量筛选,同时获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息;③ ChIP与qPCR或PCR相结合建立的ChIP-qPCR或ChIP-PCR用于特定反式因子与靶基因的结合鉴定; RIP:技术应用① 研究蛋白质与RNA互作;② 研究miRNA调节靶点; ChiRP:技术应用高通量检测调节RNA结合调控的DNA和蛋白; RAP:技术应用RNA与蛋白质的互作

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      品牌:Invent Magna ChIRP RNA Interactome Kit创新点:它提供了所有必需的缓冲液、酶和试剂以及阴性对照探针组,简化了 ChIRP 的操作流程,并且灵敏度高,让所有实验室都能进入这一领域,有助于研究人员发现新的分子机理和研究靶点。点此索取技术资料与报价 品牌:MerckMillipore

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