
Snp检测
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- 如耀
- DNA1-01-01
- 2025年07月16日
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- 技术资料
服务简介
SNP,即单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起 的DNA序列多态性。与其它分子标记相比,SNP分辨率最高也最为丰富,覆盖基因组范围大,遗传上比较稳定。在人类基因组中,估计平均每1,000个碱基对就有1个SNP,估计其总数可达300万个甚至更多,是继微卫星之后的第三代遗传标记。
SNP分布不均匀,在非转录序列中要多于转录序列,绝大多数位于蛋白的非编码区。通常情况下是一种二等位基因的变异,多为转换,即一种嘧啶碱基换为另一种嘧啶碱基,或一种嘌呤碱基换为另一种嘌呤碱基,转换与颠换之比为2:1。SNP在CG序列上出现最为频繁,而且多是C→T,因为CG中C即胞嘧啶常被甲基化,自发脱氨后即变为胸腺嘧啶。
客户提供
交付样品
1. DNA样品:待检测DNA样品浓度要相对均一,DNA样品浓度在10~50 µg/µl之间,体积>20 µl,用双蒸水或者TE缓冲液溶解,不含PCR抑制剂。务必注明样品的准确浓度。
2. 为了保证样品质量能够达到SNP检测要求,正式实验前我们需要对样品DNA浓度与质量进行检测,并根据检测结果进行浓度调整;随机选取10%样品,用我们公司已有的高频率 SNP位点所对应的引物进行SNP分型实验,我们会将DNA鉴定结果及时告知客户并共同决定是否进入正式实验。
3. 血液或组织样本:血液样本用EDTA抗凝剂的真空管采集或枸椽酸钠抗凝,采集后放入-20℃保存(最好-80℃保存),体积大于1ml;组织样本最好是新鲜(-80℃保存)或石蜡包埋的组织,也可以是95%乙醇中固定的组织,组织量大于10 mg。血液或组织DNA抽提费用,10元/样本。
提供信息
NCBI基因登录号和rs号或详细的SNP检测位点及上下游各200个碱基的基因组DNA模板序列,并注明在此范围之内所有其它SNP位点。最好能提供待检测SNP位点在采样人群中的等位基因频率信息。
最终交付
交付报告
1. SNPs统计结果(Excel表格);
2. 实验过程及其涉及的电泳图、酶切图、测序峰型图;
3. 扩增和反应体系所设计的引物序列;
4. 客户所需的其他资料。
SNP,即单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起 的DNA序列多态性。与其它分子标记相比,SNP分辨率最高也最为丰富,覆盖基因组范围大,遗传上比较稳定。在人类基因组中,估计平均每1,000个碱基对就有1个SNP,估计其总数可达300万个甚至更多,是继微卫星之后的第三代遗传标记。
SNP分布不均匀,在非转录序列中要多于转录序列,绝大多数位于蛋白的非编码区。通常情况下是一种二等位基因的变异,多为转换,即一种嘧啶碱基换为另一种嘧啶碱基,或一种嘌呤碱基换为另一种嘌呤碱基,转换与颠换之比为2:1。SNP在CG序列上出现最为频繁,而且多是C→T,因为CG中C即胞嘧啶常被甲基化,自发脱氨后即变为胸腺嘧啶。
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1. DNA样品:待检测DNA样品浓度要相对均一,DNA样品浓度在10~50 µg/µl之间,体积>20 µl,用双蒸水或者TE缓冲液溶解,不含PCR抑制剂。务必注明样品的准确浓度。
2. 为了保证样品质量能够达到SNP检测要求,正式实验前我们需要对样品DNA浓度与质量进行检测,并根据检测结果进行浓度调整;随机选取10%样品,用我们公司已有的高频率 SNP位点所对应的引物进行SNP分型实验,我们会将DNA鉴定结果及时告知客户并共同决定是否进入正式实验。
3. 血液或组织样本:血液样本用EDTA抗凝剂的真空管采集或枸椽酸钠抗凝,采集后放入-20℃保存(最好-80℃保存),体积大于1ml;组织样本最好是新鲜(-80℃保存)或石蜡包埋的组织,也可以是95%乙醇中固定的组织,组织量大于10 mg。血液或组织DNA抽提费用,10元/样本。
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NCBI基因登录号和rs号或详细的SNP检测位点及上下游各200个碱基的基因组DNA模板序列,并注明在此范围之内所有其它SNP位点。最好能提供待检测SNP位点在采样人群中的等位基因频率信息。
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1. SNPs统计结果(Excel表格);
2. 实验过程及其涉及的电泳图、酶切图、测序峰型图;
3. 扩增和反应体系所设计的引物序列;
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