胃癌是世界上第三大致死性肿瘤,尤其是在东亚。Diffuse-type gastric cancer (DGC) 大约占肺癌中的30%,预后差,基本没有靶向治疗的选择。虽然此前的研究通过基因组测序或者转录组分研究,对胃癌分成了不同的亚型,但是此前一系列的研究表明,mRNA转录本丰度不能可靠地预测蛋白质丰度差异,尽管CNV对mRNA丰度表现出强烈的顺式和反式影响,但这些差异相对较少延伸至蛋白质水平。因此来自同一患者的配对肿瘤和癌旁组织,通过蛋白组学的筛选以发现蛋白质水平的改变对于DGC的诊断和治疗就非常重要。
DIA分析确定的荷质比(m / z)窗口内的所有肽段信息,所以DIA不会损失肽段信号,采集更加完整。(文献来源:Technical advances in proteomics: new developments in data-independent acquisition. F1000Res, 2016. 5.)
DIA在一级质谱和二级质谱同时定量,所以蛋白定量更加准确。(文献来源:Technical advances in proteomics: new developments in data-independent acquisition. F1000Res, 2016. 5.)
DIA技术的可重复性更高,可对大量生物样本进行检测;数据记录更加完整,可二次挖掘(文献来源:Mol Cell Proteomics, 2015. 14(5): p. 1400-10.)