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- m6A全转录组测序(不仅限于mRNA）
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- 2026年01月04日
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吉凯基因
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吉凯基因
m6A是一种常见的RNA甲基化修饰方式，研究表明它在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA 寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色。吉凯基因的微量meRIP-seq技术，通过特殊的技术优化，大大降低 meRIP-seq对样本量的要求，和常规的meRIP-seq需要上百μg的总RNA量相比，微量meRIP-seq仅仅500 ng~20 μg 总RNA量即可满足实验要求。利用最xin的去rRNA技术，可以同时检测mRNA、 lncRNA 及circRNA的甲基化修饰谱，帮助研究人员对RNA转录后甲基化修饰图谱进行全面研究。
技术优势
1、样本要求低：500 ng~20 μg 总RNA
2、同时适用于细胞株和临床样本（包括外泌体样本）
3、全面覆盖mRNA、LncRNA、circRNA的m6A修饰
4、一个样本两套数据（meRIP-seq+RNA-seq）
5、赠送meRIP-seq和RNA-seq联合分析
样本类型
1、总RNA，500 ng~20 μg
2、细胞，数量为5x106~107
3、组织，质量为10~20 mg
仅限人、大、小鼠,其他物种需评估
测序方案
1、测序平台:Illumina Nova Seq 6000
2、测序模式:PE150
3、测序数据:20G
备注：该产品样本寄送费用由吉凯基因负责
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文献和实验Nat Commun：肖东/孙妍课题组合作揭示 m6A 修饰调节细胞自噬的新机制
27a 与 METTL3 结合减弱显著抑制 METTL3 泛素化降解，是导致饥饿时 METTL3 蛋白稳定性和丰度增加的主要原因。 图 2 YTHDF3 需要 METTL3 介导的 m6A 修饰来促进自噬 （图源：Hao WC, et al., Nat Commun, 2022） 为探究 YTHDF3 识别 mRNA m6A 修饰诱导自噬的具体机制，研究者运用饥饿诱导的 MEFs 细胞模型通过 RIP 和 MeRIP 测序（图 3a-f），并运用 RNA EMSA 等实验（图 3 g-k），证实 METTL3
DNA 样品，将未甲基化的胞嘧啶（C）转化为尿嘧啶（U）。重亚硫酸盐处理不会影响甲基化的胞嘧啶（m5C） 。为了检测甲基化位点，一对引物经设计带有鸟嘌呤（G），可与目标序列中的 m5C 配对；为了检测未甲基化位点，另一对引物带有腺嘌呤（A），可与重亚硫酸盐转化分子中的U配对（随后，与后续 PCR 循环中的胸腺嘧啶（T）配对）。通过引物配对得到的阳性 PCR 扩增结果可用于确定位点的甲基化状态（图 7）。 图 7.甲基化特异性 PCR 第一步，使用重亚硫酸盐处理 DNA 样品，将未甲基化的胞嘧啶转化
兰州大学第一医院李汛团队首次揭示胃癌演进中mRNA乙酰化修饰新机制
胃癌（GC）是全世界最常见的恶性肿瘤之一，发病率居全球恶性肿瘤第 4 位，病死率居全球恶性肿瘤第 2 位。这种癌症预后差，治疗选择也相当有限。 我国是真正的「胃癌大国」。尽管早期诊断技术、手术、放化疗以及免疫治疗技术的进步，但胃癌发病率和死亡率仍然居高不下。因此，普及胃癌早筛技术、探索胃癌演进的分子机理，为寻找新的胃癌分子靶点和治疗策略具有重要的价值。 mRNA 修饰被认为在基因表达转录后调控过程发挥重要作用。目前研究表明 mRNA 上存在着广泛的化学修饰，如 m6A、m5C、m1Am、ac
