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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
990
- 英文名:
BaFaSYBR Mixture(Low ROX)
- 保质期:
长期
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
-20℃
特别提示:包括快速实时荧光定量PCR预混体系(低含量ROX校正染料)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:快速实时荧光定量PCR预混体系(低含量ROX校正染料)
英*(代"文")名称:BaFaSYBR Mixture(Low ROX)
产品规格:5ml
本品是专用于染料法(SYBR GreenⅠ)实时荧光定量PCR的预混体系,浓度为2×,包含Fast Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、dNTPs、SYBR Green I荧光染料和Mg2+,操作简单方便。主要用于基因组DNA靶序列和RNA反转录后的cDNA靶序列检测。本品所含荧光染料SYBR Green I可以与所有的双链DNA相结合,使该产品可用于不同靶序列的检测而不需合成特异性标记探针。本品含有的Fast Taq DNA Polymerase能有效减少在常温条件下由引物和模板非特异性结合或引物二聚体而产生的非特异性扩增,酶的激活仅需在95℃孵育20s。整个PCR反应过程比普通反应可节省约40分钟,大大缩短了PCR的反应时间。独特的PCR缓冲体系与热启动酶的组合,有效抑制了非特异产物的产生,并显著提高PCR的扩增效率。该产品应用范围广,适用于普通和快速定量PCR程序,可适用于无需ROX校正的所有荧光定量PCR仪。
ROX染料用于校正定量PCR仪孔与孔之间产生的荧光信号误差,一般用于ABI、Stratagene等公司的Real Time PCR 扩增仪。不同仪器的激发光学系统有所不同,因此ROX染料的浓度必须与相应的荧光定量PCR仪相匹配。
不需要ROX校正的仪器(WE0141):
Roche LightCycler 480,Roche LightCyler 96,Bio-rad iCyler iQ,iQ5,CFX96等。
需要Low ROX校正的仪器(WE0142):
ABI Prism7500/7500 Fast,QuantStudio® 3 System,QuantStudio® 5 System,QuantStudio® 6 Flex System,QuantStudio® 7 Flex System,ViiA 7 system,Stratagene Mx3000/Mx3005P,Corbett Rotor Gene 3000等。
需要High ROX校正的仪器(WE0143):
ABI Prism7000/7300/7700/7900,Eppendorf,ABI Step One/Step One Plus等。
产品组成:
| 组份 | WE0141-5ml | WE0142-5ml | WE0143-5ml |
| 2×BaFaSYBR Mixture | 5×1ml | 5×1ml | 5×1ml |
| 50×Low ROX | - | 200μl | - |
| 50×High ROX | - | - | 200μl |
| ddH2O | 5×1ml | 5×1ml | 5×1ml |
注意事项:
1、使用前请上下颠倒轻轻混匀,尽量避免起泡,并经短暂离心后使用。
2、本产品中含有荧光染料SYBR Green I,保存本产品或配制PCR反应液时应避免强光照射。
3、避免反复冻融本品,反复冻融可能使产品性能下降。本产品长期保存可置于-20℃,避光。如果在短期内需要频繁使用,可在2~8℃保存。
4、本品不能用于探针法荧光定量PCR。
使用方法:
以下举例为常规PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小不同进行相应的改进和优化。
1、PCR反应体系:
| 试剂 | 50μl反应体系 | 终浓度 |
| 2×BaFaSYBR Mixture | 25μl | 1× |
| Forward Primer,10μM | 1μl | 0.2μM |
| Reverse Primer,10μM | 1μl | 0.2μM |
| Template DNA | 2μl | |
| 50×Low ROX or High ROX(可选) | 1μl | 1× |
| ddH2O | up to 50μl |
注意:
1)通常引物浓度以0.2μM可以得到较好结果,可以在0.1-1.0μM作为设定范围的参考。扩增效率不高的情况下,可提高引物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系。
2)通常DNA模板的量以10-100ng基因组DNA或1-10ng cDNA为参照,因不同物种的模板中含有的目的基因拷贝数不同,可对模板进行梯度稀释,以确定最佳的模板使用量。
3)不同仪器的激发光学系统有所不同,根据使用荧光定量的仪器选择加入50×Low ROX or 50×High ROX.
2、PCR反应条件:
| 步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 95℃ | 20 s | |
| 变性 | 95℃ | 3 s | 35-40个循环 |
| 退火/延伸 | 60℃ | 30 s | |
| 融解曲线分析 | 95℃ | 15 s | |
| 60℃ | 1 min | ||
| 95℃ | 15 s | ||
| 60℃ | 15 s |
注意:
1)本产品所采用的酶须在预变性95℃、20s条件下实现酶的活化。在此条件下,大多数模板可良好的进行解链。对GC含量高、二级结构复杂的模板,可将预变性时间延长至1分钟,以使起始模板充分解链。若高温处理时间过长,会对酶的活性造成影响。可根据模板情况确定最佳的预变性时间。
2)建议采用两步法PCR反应程序,退火温度请以60-64℃作为设定范围的参考,发生非特异性反应时,可提高退火温度。若因使用Tm值较低的引物等原因,得不到良好的实验结果时,可尝试进行三步法PCR扩增,退火温度请以 56℃-64℃的范围作为设定参考。
3)融解曲线分析请以所使用的荧光定量PCR仪推荐的程序进行设定,本程序是以ABI 7500荧光定量PCR仪为参照设定。
储存条件:-20℃,避免反复冻融
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文献和实验扩增曲线的分析攻略。 1、确认软件设置是否正确 对照试剂盒说明书,检查时间、温度、循环数、荧光采集等是否设置正确。有一个比较容易忽略的设置问题是,需要看下所选用的试剂中是否含有 ROX 来作为参比荧光染料。Applied Biosystems™ 系列荧光定量 PCR 仪器可以用 ROX 来作为参比荧光染料,用以校正仪器系统以外的物理误差,比如均一化校正由于移液误差或者蒸发导致的批内体积误差等。目前市面上有的的荧光定量 PCR 预混液是不含有 ROX 的,当用此类试剂的时候,应该将 ROX 参比
MasterMix,模板和引物的不同进行优化,达到一个最佳反应体系。在反应体系配置过程中,有下面几点需要注意:1. MasterMix不要反复冻融,如果经常使用,最好溶解后放在4度。2. 更多的配制Mix进行,减少加样误差。最好能在冰上操作。3. 每管或每孔都要换新枪头!不要连续用同一个枪头加样!4. 所有成分加完后,离心去除气泡。5. 每个样品至少3个平行孔。参比或者校正染料(reference dye,passive dye)常用的是ROXTM(现在已经是ABI的注册商标了!)或者其他染料,只要不影响检测
the dye to use as the passive reference,也就是设置我们反应体系是否含有参比荧光。这里需要根据实际情况进行选择,不正确的定义参比荧光同样会导致最终结果的异常。例如图 7 中实验采用染料法进行相对定量分析,但是结果中的扩增曲线异常(图 7A),排查多组分图时发现 SYBR 在扩增循环过程中荧光信号变化正常,但是细致来看作为参比荧光的 ROX 信号却在整个反应过程中信号接近于零(图 7B)。我们知道扩增图谱纵坐标 ΔRn 的数值是报告基团荧光信号和参比荧光信号的比值
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