lncRNA研究（长链非编码RNA）

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长链非编码RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA 分子(不含rRNA)，长度在200bp以上，以RNA的形式在多种层面(表观遗传水平、转录水平和转录后水平)上调控基因的表达水平。近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构，可以与蛋白、DNA和RNA相互作用，参与多种生物学过程的调控，尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色，如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA的诱导分子干扰基因的表达等。目前，lncRNA已经成为继信使RNA(mRNA)、小RNA(microRNA、piRNA、 siRNA等)之后功能基因组学最火热的研究领域，但是绝大部分lncRNA的功能目前仍不清楚。

特征：
· 大部分lncRNA的生成与 mRNA 类似，也是在 RNA 聚合酶Ⅱ的催化作用下进行转录，然后进行剪切修饰，生成 poly(A)尾，也有一部分由 RNA 聚合酶Ⅲ产生，没有 poly(A)尾。
· 多数lncRNA的序列本保守性较低，但具有保守的二级结构，剪切形式以及亚细胞定位。
· 分布广泛，表达具有组织特异性和时空特异性
· 在肿瘤与其他疾病中有特征性的表达方式。


lncRNA这几年可谓研究的热火朝天，各种基金申请，各种lncRNA近期研究铺天盖地袭来，这里我们就来说说lncRNA究竟都做了哪些研究？
1、差异表达筛选
通过lncRNA芯片或RNA-seq测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行lncRNA表达谱分析。
2、生物信息分析
通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异的lncRNA，构建共表达网络，预测lncRNA的靶基因。
3、细胞分子水平研究
（1）功能获得性研究：构建lncRNA过表达载体
（2）功能缺失性研究：可通过siRNA、shRNA、反义核酸等方法沉默lncRNA，干预lncRNA后检测其对疾病相关基因表达的影响和对细胞表型如增值、凋亡、侵袭、转移等的影响
（3）可通过RNA pull down、RNA-RIP、ChIRP-seq等方法检测与lncRNA结合的DNA、RNA、蛋白质。
4、动物实验
（1）构建移植瘤或原位瘤模型，转移模型
（2）导入siRNA或者lncRNA表达质粒
（3）检测肿瘤生长曲线
（4）通过免疫组化、RT-PCR、Western Blot等方法检测相关指标变化。






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