经典案例(一)血浆细胞外囊泡 mRNA 用于胰腺导管腺癌患者的非侵入性风险分层、预后估计标志物
研究背景:胰腺导管腺癌 (PDAC) 患者在确诊后的中位生存期仅6-8个月;为了改善PDAC的治疗和管理,确定预后因素对最佳治疗决策和患者生存都很重要。
研究思路:
研究结果:研究工入组239名多中心队列样本,分为发现集、训练集、验证集。分离提取血浆的EV进行长链RNA测序,分析不同总生存期患者血浆EV-mRNA的表达特征,随后在训练集和验证集中评估EV标志物。研究确定一种新的非侵入性3种 EV-mRNA组成的EV signature,可用于PDAC 患者的风险分层,以预测患者的生存期。EV signature是一种独立的不利预测因子,可与肿瘤分期结合改善对PDAC 预后的准确性。研究结果证明临床使用血浆EV-mRNA特征进行PDAC预后的可行性,填补了目前液体活检的研究空白。
经典案例(二)1型糖尿病血浆来源外泌体长链RNA谱的特征研究
研究背景:外泌体包含多种类型的转录本,包括长链非编码rna(lncRNAs)、编码RNA(mRNA)和环状RNA(circRNA);并且其在人类疾病中发挥重要作用。然而,外泌体长链RNA在1型糖尿病(T1DM)中的作用尚未得到很好的研究。该系列研究对T1DM的血浆来源的外泌体长链RNA表达谱进行了表征,并预测了它们在T1DM的发病过程中的潜在的功能。
研究思路:
研究结果:研究者通过对10例正常人和10例T1DM患者血浆外泌体进行分离鉴定,提取RNA进行外泌体lncRNA-seq测序;分别分析其中的lncRNA,mRNA和circRNA 绘制T1DM血浆外泌体长链RNA表达图谱。通过差异分析和靶基因功能富集分析,解析差异血浆外泌体lncRNA和T1DM的潜在关系。在另外30对样本血浆外泌体中,通过RT-PCR对6个差异表达的lncRNA和mRNA进行验证。研究首次表征T1DM血浆外泌体lncRNA图谱,解析外泌体lncRNA在T1DM发病机制中的潜在作用,为研究T1DM发病的分子机制提供新的见解。
[1] Plasma extracellular vesicle messenger RNA profiling identifies prognostic EV signature for non-invasive risk stratification for survival prediction of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma. J Hematol Oncol. 2023 Feb 3;16(1)
[2] Characterization of lncRNA Profiles of Plasma-Derived Exosomes From Type 1 Diabetes Mellitus. Front Endocrinol (Lausanne). 2022 May 12;13:822221.
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[4] Differential Expression and Bioinformatics Analysis of Plasma-Derived Exosomal circRNA in Type 1 Diabetes Mellitus. Journal of Immunology Research.2022