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SNP(Single Nucleotide Polymorphisms,单核苷酸多态性)是由基因组上单个核苷酸改变而引起的DNA序列多态性。包括碱基的转换、颠换以及单碱基的插入、缺失等,是基因突变的一种。SNP作为第三代遗传标记,分布非常广泛,在遗传分析,疾病诊治,分子育种和种群生态评估等诸多领域有十分重要的意义。
Taqman探针法
应用ABI7900、ABI 7500型实时荧光定量PCR仪,采用ABI合成探针或国产探针,完成SNP的检测分析,适用于位点少,样本通量高的检测。
焦磷酸测序(Pyrosequencing)
应用Qiagen公司PyroMark Q96 ID平台,可定量等位基因,即使是低频率等位基因;同时可测未知突变;不同的应用实验可同时在一次运行中实现;
质谱法
Sequnom质谱法将稳健的单碱基引物延伸反应与灵敏可靠的MALDI-TOF质谱检测的优点相结合,提供了高灵敏性低成本的SNP检测服务。该检测服务采用专业的引物设计和基因分型软件,可对95%以上已被证实的SNP进行实验设计。一张芯片可平行完成384个样本的实验,单个well最高可达40重反应。
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| 送样要求 | 服务周期 | 交付结果 | |
| 基因组DNA: |
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约15个工作日 |
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| 全血样本: |
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约15个工作日 |
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| 组织样本 |
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约15个工作日 |
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| PCR产物 | 浓度≥20ng/μl,体积≥10μl | 约15个工作日 |
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文献和实验光染料与PCR扩增产物的结合情况,来判断是否存在SNP,而且不同SNP位点、是否是杂合子等都会影响熔解曲线的峰形,因此HRM分析能够有效区分不同SNP位点与不同基因型。这种检测方法不受突变碱基位点与类型的局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨率熔解,即可完成对样品基因型的分析。该方法无需设计探针,操作简便、快速,低成本,结果准确,并且实现了真正的闭管操作。 启因生物:www.wcgene.com
相关专题 SNP是近年来基因突变的热点研究之一。它是指在单个的核苷酸上发生了变异,有四种不同的变异形式,而实际上只发生转换和颠换这两种。当科学家弄清了SNP的突变原理以后,他们就着手对SNP进行分析,以求找到疾病相对应的突变位点或者是进行个性化药物治疗研究。其中应用到的技术多达上百余种,其中包括有测序 技术、质谱分析技术、HRM技术、Taqman技术以及SNP芯片技术。 SNP 的分型技术可分为两个时代,一为凝胶时代,二为高通量时代
的生物芯片主要用于对DNA 的测序, 基因表达谱的鉴定及基因突变体的检测、分析等方面。迄今为止, 使用最多的也是DNA 芯片。DNA 水平遗传多态性标记至今已经历了3 个阶段:限制性酶切片段长度多态性标记(RFLP)、DNA 重复序列的多态性标记(包括小卫星、微卫星DNA 重复序列)、单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphisms , SNPs)。SNP 具有数量多,分布广泛,易于快速、规模化筛查,便于基因分型等特点。伴随着SNP 检测和分析技术的进一步发展,尤其
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