NovoNGS DNA Library FlashPrep Kit for Illumina

NovoNGS DNA Library FlashPrep

Kit for Illumina
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  • ¥24700
  • 近岸蛋白(Novoprotein)已认证
  • 2025年11月16日
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    • 详细信息
    • 技术资料
    • 规格

      96

    产品概述:
    NovoNGS DNA Library FlashPrep Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台开发的专用试剂盒,可将DNA制备成Illumina高通量测序平台专用的测序文库。该试剂盒采用新型的体外转座技术,只需5分钟即可一步实现DNA的片段化与接头连接,实验操作快速简单,无需经过传统文库制备时的片段化、末端修复、接头连接等繁琐步骤。本试剂盒适用于50ng起始DNA量的基因组文库制备。

    特点:
    快速、简单、DNA用量少。

    质量控制:
    试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证文库质量的稳定性和重复性。

    适用范围:
    适用于将DNA制备成Illumina高通量测序平台专用文库。

    产品组成:
    Component A包装(24 rxns) B包装(96rxns)
    NovoTn5 Mix 72μl 288μl
    5×Reaction Buffer 160μl 640μl
    5×Stop Buffer 200μl 800μl
    2×Amplify Mix 600μl 2400μl

    保存条件:
    5×Stop Buffer室温保存,其余组分-20保存。

    建库原理及流程:
    转座酶与两种等摩尔量的接头Adapter1Adapter2混合形成转座复合体。在55℃条件下孵育5min,转座复合体便能一步实现基因组DNA的片段化与加接头两个过程。纯化后的片段化产物经N5xx/N7xx引物(NovoNGS Index Kit for Illumina,提供8N5引物及12N7引物的选择,目录号:N237)扩增后,再经过磁珠分选,便可得到测序文库。建库原理及流程示意图如下:

    文库结构:
    5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC-Index2(i5)-TCGTCGGCAGCGTCAGAT
    GTGTATAAGAGACAG-xxxxxxxxx-CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGAC-Index1(i7)-ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’
    NovoNGS DNA Library FlashPrep
    文库结构:
    5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC-Index2(i5)-TCGTCGGCAGCGTCAGAT
    GTGTATAAGAGACAG-xxxxxxxxx-CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGAC-Index1(i7)-ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’

    Adapter1Adapter2:转座复合物中包被的两种接头,分别带有N5/N7引物识别序列及转座酶识别序列,文库打断的同时会添加到DNA片段两端
    i5i7:分别代表Index2(i5)Index1(i7)均为8 bp
    N5N7:分别携带Index2(i5)Index1(i7)的引物
    -xxxxxxxxx-: 插入序列
    操作流程:
    适用于将DNA制备成Illumina高通量测序平台专用文库。
    1. 实验耗材准备
    新鲜配制的80%乙醇、灭菌超纯水、低吸附EP管和PCR管、磁力架、PCR仪、磁珠。
    1. 起始DNA的准备与要求
    纯化过的DNA溶于灭菌纯水或10mMTris-HCl (pH8.0),吸光度260/2801.8~2.0之间。因为转座体用量与DNA起始量密切相关,所以准确测定DNA浓度是实验成功的关键。推荐使用Qubit或荧光染料PicoGreen进行浓度测定,请勿使用以吸光度为基础的任何测定方法。
    1. 实验流程:
    Step1DNA片段化
    1. 于室温融解5×Reaction buffer,上下颠倒混匀后备用;从4℃取出磁珠,室温静置30min备用。
     
    1. 在灭菌PCR管中依次添加各反应组分:
    5×Reaction buffer 4μl
    DNA 50ng
    NovoTn5 Mix 3μl
    ddH2O To  20μl
    使用移液器轻轻吹打20次,充分混匀。十分重要!
     
    1. 将样品置于PCR仪中,反应程序设置如下:
    105℃ 热盖
    55℃ 5min
    10℃ 10min
     
    1. PCR仪中取出样品,加入5μl Stop Buffer, 移液器轻柔吹打混匀后再次放回PCR仪,55孵育5min后取出。
     
    1. 片段化产物纯化
    1. 涡旋振荡磁珠,使其充分混匀后,吸取25μl磁珠加入25μl片段化后的产物中,用移液器轻轻吹打10次,充分混匀,室温孵育5 min
    2. 若管壁上有液体,将反应管短暂离心后置于磁力架,使磁珠与液体完全分离,约5 min,小心移除上清。
    3. 向反应管中加入200μl新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育30sec后,用枪头小心移除上清,此过程保持PCR管始终置于磁力架中。
    4. 重复步骤(3)一次。
    5. 保持PCR管置于磁力架上,打开管盖,室温空气干燥5 min左右,切记不可干燥过度。
    6. 从磁力架上取下PCR管,加入22μl无菌超纯水洗脱,移液器轻轻吹打混匀,后室温孵育3min
    7. 若管壁有液体,将反应管短暂离心后置于磁力架,室温静置约2 min,使磁珠与液体完全分离,吸取20μl上清至新的PCR管中。
     
    Step2PCR扩增
    1. 将灭菌PCR管置于冰浴中配置50μl反应体系
    依次添加各反应组分:
    2×Amplify Mix 25μl
    Step1产物 20μl
    N5xx 2.5μl
    N7xx 2.5μl
     
    1. 移液器轻轻吹打,充分混匀。
    2. PCR扩增程序如下:
    3. 72℃*         3min
      98℃       30sec
      98℃       15sec
      60℃       30sec         5-7cycles
      72℃       90sec
      72℃       5min
      10℃       Hold
       
      72℃*孵育3min为链置换反应,此步骤不可省略。
      PCR循环数多则文库产量高,但对应Duplication会增多,请根据测序需要进行选择。不同循环数对应的文库产出请参照附表一。
      Step3:扩增产物长度分选
      如对文库长度分布无特殊要求,可直接使用1.0×磁珠纯化文库扩增产物,不需进行片段分选。本步骤采用磁珠两步分选法对扩增产物进行长度分,请优选Novoprotein DNA Screen Beads (货号:N240)如使用其他品牌磁珠,使用方法请以该品牌说明书推荐的体系为准
      文库平均总长度 ~350bp ~450bp ~550bp ~680bp
      文库平均插入长度 ~220 bp ~320 bp ~420 bp ~550bp
      第一轮磁珠用量V1 0.7× 0.6× 0.55× 0.45×
      第二轮磁珠用量V2 0.2× 0.15× 0.15× 0.15×
       
      举例:“0.7×”代表磁珠与PCR产物的体积比,若PCR产物体积为50μl,则第一轮磁珠用量0.7×50μl =35μl,第二轮磁珠用量为:0.2×50μl=10μl
      注意:由于PCR过程中水分蒸发导致PCR产物体积小于50μl,请务必用ddH2O补齐至50μl,否则会导致分选长度和预期不一致。
      片段筛选:
    4. 涡旋振荡混匀磁珠后,吸取V1体积磁珠加入50μl PCR产物中,使用移液枪轻轻吹打充分混匀,室温孵育5 min
    5. 将反应管短暂离心后置于磁力架,使磁珠与液体分离(约5 min,溶液澄清后),
    6. 小心转移上清至干净的EP管中,丢弃磁珠;
    7. 涡旋振荡混匀磁珠后,吸取V2体积磁珠至上清中,使用移液枪轻轻吹打充分混匀,室温孵育5 min
    8. 将反应管短暂离心后置于磁力架,使磁珠与液体分离(约5 min,溶液澄清后),小心移除上清;
    9. 加入200μl新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育30sec后,小心移除上清,此过程仍保持反应管置于磁力架中;
    10. 重复步骤(5)一次;
    11. 保持反应管置于磁力架中,打开管盖,室温晾干约5min,切记磁珠不要干燥过度;
    12. 将反应管从磁力架上取下,加入22μl无菌超纯水洗脱,吹打混匀或涡旋混匀后室温孵育3min
    13. 将反应管短暂离心后置于磁力架,使磁珠与液体完全分离(约2 min,溶液澄清后),小心吸取20μl上清至新的无菌PCR管内中,-20℃保存。
    14. 附表一:
      PCR扩增循环次数 4 5 6 7
      文库产出总量(ng 250 420 800 1300
      注:此处文库产出总量为未进行长度筛选时的结果。


     

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