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多肽序列分析（非标准氨基酸）
方法：质谱法
原理：多肽在质谱中的碎裂有一定规律，通常最容易断裂的是肽键位置，得到分别命名为b离子（从N端）和y离子（从C端）的M/Z的图谱，从而进行多肽序列分析。
仪器：Thermo LTQ-VelosABI 4800 MALDI-TOF-TOF
样品要求：挥发性无机盐<20mM；不挥发性无机盐<5mM 样品量：蛋白质总量>50pmol；样品纯度>90%
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文献和实验Nature 子刊：迈出基因组重编码制备抗病毒人类细胞系的第一步
」密码子）新编码能力的技术。通过基因组重编码不仅可以赋予了生物体或细胞抗病毒的能力，也可以重新赋予「空白」密码子新的功能，包括非标准氨基酸的整合和生物防护。 2013 年 Church 实验室首次在大肠杆菌通过 TAA 取代 TAG 终止密码子并删除释放因子 1 (RF1)，使得其具有抗病毒的能力 2。2021 年，Jason Chin 实验室在大肠杆菌全基因组范围内实现用同义词密码子替换两个有义密码子和一个终止密码子，并删除相应的转运 RNA (tRNA) 和释放因子，使得该大肠杆菌码子具有
手把手教你用 Pymol, Chimera 预测点突变蛋白结构！
单个氨基酸的变化有可能会剧烈的影响蛋白的活性和功能，除了通过 X-ray 实验的方法以外。用软件来预测点突变蛋白的结构，解释其功能的变化 / 无变化，是最常见的蛋白结构分析的工具。接下来我们会通过一个实际的点突变例子来介绍操作方法。范例蛋白名称：BARNASE, 点突变 E73WWT 蛋白 PDB 编号：1b27序列：>1b27:A|PDBID|CHAIN
还在没日没夜跑定量？教你一招不做实验也能预测基因表达水平的小妙招！
sequence）、参考集及用于翻译的密码子规则。查询序列必须是 fasta 格式的 DNA 或 RNA 序列。CAIcal 服务器会首先检查查询序列是否是编码蛋白质的 DNA 或 RNA 区域，以及序列是否包含内部终止密码子 (通常表示基因发生了移码突变)、是否存在非标准字符，以及序列是否编码氨基酸。2. 计算 CAI 所需的参考集可以从密码子使用数据库中导入，可以同时使用两个参考集，比较关于两种不同生物的密码子使用，并检查它是否更适合其中一种。CAIcal 界面中提供了此数据库的链接。该数据库包含
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