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small RNA测序

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  • 2025年07月14日
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    SMALL RNA测序产品概述
    Small RNA是一类大小约17~40个碱基的单链小分子RNA。小RNA在细胞内有重要的调控功能,具有作为疾病诊断标记物或药物靶标的潜力,正被广泛研究。新一代高通量测序可以在一次测序中获得样本细胞中小RNA的序列信息,能够快速鉴定出不同组织、不同发育阶段、不同疾病状态下已知和未知的小RNA表达水平及其表达差异,为研究小RNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具,尤其能通过测序鉴别新的小RNA。Small RNA主要包括 microRNA、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(piwi-interacting RNA)三类。
    应用领域
    1、直接参与转录后水平对生物学功能的调控
    2、作为生物标志物进行疾病检测和监控
    3、作为竞争性内源RNA参与生命活动的调节
    测序策略

    样本要求
    样本类型:完整且无污染的Total RNA;
    Total RNA需求量(单次)≥ 5.0 μg
    RNA浓度: ≥200 ng/μL
    RNA纯度:OD260/280=1.8-2.2,OD260/230 ≥2.0;RIN ≥8.0,18S ≥1.5;
    样本寄送
    Total RNA或者组织样本必须采用干冰进行运输,确保样本到达实验室时仍有干冰剩余,否则严重影响RNA质量。
    技术流程


    常见问题

    Q: 研究small RNA需要提供什么样品?
    客户只需提供样品总RNA,无需将small RNA进行分离。提取方法不能按照做转录组的标准提取的,提取过程中不能过柱,不能用LiCl沉淀,否则small RNA会丢失,不能用于small RNA建库。
    Q:small RNA测序原理是怎样的?
    Small RNA(micro RNAs、siRNAs和 pi RNAs等)是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Illumina能够对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。实验时首先将18-30 nt范围的Small RNA从总RNA中分离出来,两端分别加上特定接头后体外反转录做成cDNA再做进一步处理后,利用测序仪对DNA片段进行单向末端直接测序。通过Illumina对Small RNA大规模测序分析,可以从中获得物种全基因组水平的miRNA图谱,实现包括新miRNA分子的挖掘,其作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学应用。

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    图标文献和实验
    相关实验
    • RNA测序简介

      NGS已成为生命科学领域中基因组学和转录组学研究的金标准。虽然它与桑格测序等方法有某些核心相似之处,但NGS所能实现的绝对的高通量水平使它与其他方法截然不同,并彻底改变了科学家的工作方式。 RNA测序(RNA-seq)尤其处于NGS功能应用的前言沿。RNA-seq最简单的形式允许我们在取样时确定样本中的RNAs的丰度。转录组是一个高度动态的细胞特征,并打开了一个巨大发掘潜力的世界。对药物、各种疾病状态、转录后修饰和选择性剪接转录本的反应变化只是 RNA-Seq 使其能够发现的一些例子

    • 微量RNA建库测序方案

      RNA测序 (RNA Sequencing,简称RNA-Seq) ,是基于高通量测序技术的转录组学研究方法,可以快速对基因组中的RNA种类和数量进行分析,揭示特定生物学或疾病发生过程中的分子机制。

    • Small RNA Sequencing Sample Preparation Guide

      Small RNA Sequencing Sample Preparation Guide.pdf

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