传统的转录组测序技术,可以揭示RNA在一个稳定状态下质和量上的变化,但是这仅仅是基因表达的一个“快照”,无法观察到RNA转录、加工和降解的细胞内动态过程。SLAM-seq,即thiol(sh)-linked alkylation for the metabolic sequencing of RNA,可以理解为“S4U烷基化RNA代谢测序技术”,可观察转录的实时情况和特征。通过研发成熟的代谢RNA标记方法和高通量测序技术,SLAM-seq能从单核苷酸水平上检测整合到总RNA中的核苷类似物4-硫尿苷(S4U),绘制RNA聚合酶II依赖性的基因表达动态,是一种操作性强、稳定、可靠的基因表达调控机制研究方法。
[1].Herzog V A, Reichholf B, Neumann T, et al. Thiol-linked alkylation of RNA to assess expression dynamics[J]. Nature methods, 2017, 14(12): 1198. [2].Paris J, Morgan M, Campos J, et al. Targeting the RNA m6A Reader YTHDF2 Selectively Compromises Cancer Stem Cells in Acute Myeloid Leukemia[J]. Cell stem cell, 2019.