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文献和实验细胞增殖,增加筛选工作量。培养酵母菌Y2HGold/pGBKT7- CaM(SD/-Trp)时,出现了酵母菌种从第四天开始出现变红的情况,查找资料得知是由于酵母菌在缺乏腺嘌呤的生长环境中,产生红色代谢物的导致的。因而应尽量缩短此步的培养时间。本项目用变红的菌进行下一步的步骤,实验结果并没有受影响,且变红的菌在腺嘌呤丰富的YPDA液体培养基中培养时,后代菌种恢复白色。综上,酵母培养时间的控制是酵母双杂交实验成功的关键。
三篇顶刊论文,同一个技术选择——BiFC如何破解植物蛋白互作难题?
素(auxin)能强烈抑制烟草尼-古-丁合成,这是植物激素调控次生代谢物的典型案例。尼-古-丁是烟草重要的防御性生物碱,对昆虫具有毒性。但具体调控机制一直是个谜! BIFC验证:作者利用酵母双杂交(Y2H)筛选发现NaARF5(生长素响应因子) 可与 NaERF1-like(乙-烯响应转录因子) 相互作用,并进一步通过BiFC 和分裂荧光素酶互补成像(LCI) 验证了这一互作。 验证结果: ➤通过酵母双杂交筛选发现NaARF5与NaERF1-like存在互作 ➤BiFC和荧光素酶互补(LCI)实验共同证实
做分子机制研究,蛋白-蛋白相互作用是绕不开的核心证据。很多课题会遇到这样的问题:Co-IP跑出阳性,审稿人却要求补充体外实验;酵母双杂交筛出一批候选,细胞水平却验证不到结果;弱互作、瞬时互作常规方法很难稳定捕获。 不同蛋白互作技术,分别对应细胞内复合物、体外直接结合、文库筛选、空间邻近以及原位可视化等不同维度,提供的互作信息并不相同。本文梳理五大常用技术:免疫共沉淀Co-IP、GST Pull-down、酵母双杂交Y2H、邻近生物素标记BioID/TurboID、双分子荧光互补BiFC,拆解
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