lncRNA功能预测

lncRNA是当前生物医学的热门研究领域，但是由于其作用方式多样，作用位点复杂，如果通过常规的实验进行验证往往费时费力，而且还存在较多变数，是目前非编码RNA研究中的主要难点所在。目前lncRNA的功能主要通过和特定的蛋白质/DNA/RNA进行相互结合，发挥对靶基因的调控作用。因此，对目标lncRNA的功能预测，将大大减少我们的科研工作量，提高实验的成功率，为发现目标分子的功能研究奠定坚实的基础。
如果两个分子存在相互作用，那么二者在表达上往往具有某种关联，基于这个原理因此，我们开发了lncRNA（包括mRNA）共表达分析技术，应用于目标分子的功能预测。本技术利用不断更新的海量数据库（目前已经包括6万张Affymetrix 表达谱芯片数据及5000套TCGA数据），建立共表达分析流程，预测功能相关基因，并建立功能分类网络、信号通路、蛋白互作网络，通过对数据的深入挖掘，可获得相关的重要蛋白及其功能和所在通路，以指导下一步的lncRNA功能验证。




本服务项目提供分析结果包括：
表一.xls：与目标lncRNAmRNA 具有正向和反向共表达关系的基因各500个；
表二.xls：共表达基因功能分类网络
表三.xls：共表达基因信号通路网络
图一.jpg：蛋白互作网络
表四.xls：网络元素权重分析
完整分析报告.pdf：内容包括功能预测、靶点基因、正负调控关系及相关文献查询结果分析。