ChIP

做 ChIP 的心得体会

做 ChIP（Chromatin Immunoprecipitation）已经几个月了，虽时间不长，但深刻体会细节决定成败，这里就把自己认为值得注意的细节总结如下： 1、cell counting：尽量做到准确，会影响 input 结果。 2、cross link：甲醛的终浓度是 1%，这个基本所有的 protocol 上都会强调。 3、resuspend cells with SDS:一定要选用小的 tip 头，在液面下吹打，否则很容易产生气泡，后面的 sonication 就麻烦

ChIP实验遇见的坑

染色质免疫共沉淀测序技术（Chromatin immunoprecipitation Sequencing, ChIP- seq）将染色质免疫共沉淀与第二代测序相结合的一种技术。它能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段，是研究体内转录因子和靶基因启动子区域直接相互作用的方法，对于调控蛋白在基因组上的结合靶点筛选、差异化表观遗传变异的原理揭示提供了重要的解决思路。因此，在过去十年已经成为表观遗传信息研究的主要方法，并且一大波的CNS都展示了完美的结果。我想做过ChIP

Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)

INTRODUCTION Chromatin immunoprecipitation (ChIP) is an invaluable method for studying interactions between specific proteins or modified forms of proteins and a genomic DNA region. ChIP can be used to determine whether a transcription