Thermo scientific-fermentas SmoI(SmlI) Tango缓冲液 thermo双酶切体系

Thermo scientific-fermentas Sm

oI(SmlI) Tango缓冲液 thermo双酶切体系
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  • Thermo scientific -fermentas
  • ER1981
  • 2025年10月07日
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      大量

    • - 推荐的缓冲液 : Tango™
    • - 孵育温度55°C
    • - 连接效率95%
    • - Dam甲基化重叠可能影响DNA切割
    • - 热失活80°C, 20 min
    • - 基因组级别
    • - LO合格
    Catalog# Size, concentration Supplied with: Certificate of Analysis MSDS
    10X Buffer Tango™
    ER1981 200 u (10 u/µl) 1.00 ml ER1981
    Reaction conditions
    Recommended buffer for 100% activity Optimal temperature Enzyme activity in Fermentas buffers, % Tango™ buffer for double digestion
    B (blue)
    1X
    G (green)
    1X
    O (orange)
    1X
    R (red)
    1X
    Tango™ (yellow)
    1X / 2X
    Tango™ 55°C 50-100 20-50 0-20 20-50 100 20-50 1X or 2X

    Lambda DNA
    0.7%琼脂糖
    17 切割位点

    100%酶活性的反应条件
    1X 缓冲液Tango™:
    33 mM Tris-acetate (pH 7.9, 37°C), 10 mM Mg-acetate, 66 mM K-acetate, 0.1 mg/ml BSA。
    55°C酶切。

    保存缓冲液
    SmoI保存在:
    10 mM Tris-HCl (pH 7.5, 25°C), 50 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。

    连接和重新酶切
    50倍SmoI过量酶切后,超过95%的酶切产物可以连接和重新酶切。

    琼脂糖包埋DNA酶切
    至少需要5 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的λ DNA。

    备注
    • 37°C酶切时只有10%的酶活性。
    • 重叠的Dam甲基化会影响SmoI酶切。为避免Dam甲基化影响,样本DNA需要从dam-, dcm- 菌株中抽提,如GM2163 (#M0099)。
    • 低盐、pH> 8.0、高浓度甘油(>5%)或过量酶切都会导致星活性。

    商业化同裂酶
    采用REsearch™软件寻找同功酶。

    双酶切
    采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。

    兼容性末端
    C^TTAAG – BspTI;
    C^TCGAG – Eco88I, XhoI, SalI。

    甲基化影响
    Dam: 可能重叠 – 部分影响。
    Dcm: 无重叠 – 不影响。
    CpG: 可能重叠 – 不影响。
    EcoKI: 无重叠 – 不影响。
    EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。

    Methylation type Sequence Cleavage effect
    Dam (GATC)

    5'...CTYRAGm6A TC ...3'
    3'...GARYTC Tm6AG ...5'

    部分影响
    CpG

    5'...CTm5C G GT...3'
    3'...GA Gm5C CA...5'

    不阻止酶切
    Cleavage efficiency close to the termini of PCR fragments
    bp from the recognition site to fragment end
    1 2 3 4 5
    0 50-100
    Number of recognition sites in DNA molecules
    Lambda ΦX174 M13mp18/19 pBR322 puc18/19 pUC57
    17 5 5 6 4 4
    pTZ19R/U pTZ57R pBluescriptIIKS(-/+) pBluescriptIISK(-/+) pACYC177 pACYC184
    4 4 5 5 4 4

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