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| Catalog# | Size, concentration | Supplied with: | Certificate of Analysis | MSDS |
| 10X Buffer Tango™ | ||||
| ER1981 | 200 u (10 u/µl) | 1.00 ml | ER1981 |
Reaction conditions
| Recommended buffer for 100% activity | Optimal temperature | Enzyme activity in Fermentas buffers, % | Tango™ buffer for double digestion | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| B (blue) 1X |
G (green) 1X |
O (orange) 1X |
R (red) 1X |
Tango™ (yellow) 1X / 2X |
||||
| Tango™ | 55°C | 50-100 | 20-50 | 0-20 | 20-50 | 100 | 20-50 | 1X or 2X |
Lambda DNA
0.7%琼脂糖
17 切割位点
100%酶活性的反应条件
1X 缓冲液Tango™:
33 mM Tris-acetate (pH 7.9, 37°C), 10 mM Mg-acetate, 66 mM K-acetate, 0.1 mg/ml BSA。
55°C酶切。
33 mM Tris-acetate (pH 7.9, 37°C), 10 mM Mg-acetate, 66 mM K-acetate, 0.1 mg/ml BSA。
55°C酶切。
保存缓冲液
SmoI保存在:
10 mM Tris-HCl (pH 7.5, 25°C), 50 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。
10 mM Tris-HCl (pH 7.5, 25°C), 50 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。
连接和重新酶切
50倍SmoI过量酶切后,超过95%的酶切产物可以连接和重新酶切。
琼脂糖包埋DNA酶切
至少需要5 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的λ DNA。
备注
- 37°C酶切时只有10%的酶活性。
- 重叠的Dam甲基化会影响SmoI酶切。为避免Dam甲基化影响,样本DNA需要从dam-, dcm- 菌株中抽提,如GM2163 (#M0099)。
- 低盐、pH> 8.0、高浓度甘油(>5%)或过量酶切都会导致星活性。
商业化同裂酶
采用REsearch™软件寻找同功酶。
双酶切
采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。
兼容性末端
C^TTAAG – BspTI;
C^TCGAG – Eco88I, XhoI, SalI。
C^TCGAG – Eco88I, XhoI, SalI。
甲基化影响
Dam: 可能重叠 – 部分影响。
Dcm: 无重叠 – 不影响。
CpG: 可能重叠 – 不影响。
EcoKI: 无重叠 – 不影响。
EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。
Dcm: 无重叠 – 不影响。
CpG: 可能重叠 – 不影响。
EcoKI: 无重叠 – 不影响。
EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。
| Methylation type | Sequence | Cleavage effect |
|---|---|---|
| Dam (GATC) | 5'...CTYRAGm6A TC ...3' |
部分影响 |
| CpG | 5'...CTm5C G GT...3' |
不阻止酶切 |
| bp from the recognition site to fragment end | ||||
|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
| 0 | 50-100 | |||
| Lambda | ΦX174 | M13mp18/19 | pBR322 | puc18/19 | pUC57 |
|---|---|---|---|---|---|
| 17 | 5 | 5 | 6 | 4 | 4 |
| pTZ19R/U | pTZ57R | pBluescriptIIKS(-/+) | pBluescriptIISK(-/+) | pACYC177 | pACYC184 |
| 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 |
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Thermo scientific-fermentas SmoI(SmlI) Tango缓冲液 thermo双酶切体系
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