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- Thermo scientific -fermentas
- ER1941
- 2025年11月04日
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大量
|
| Catalog# | Size, concentration | Supplied with: | Certificate of Analysis | MSDS | |
| 10X Buffer AjiI | 10X Buffer Tango™ | ||||
| ER1941 | 200 u (5 u/µl) | 1.00 ml | 1.00 ml | ER1941 | |
Reaction conditions
| Recommended buffer for 100% activity | Optimal temperature | Enzyme activity in Fermentas buffers, % | Tango™ buffer for double digestion | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| B (blue) 1X |
G (green) 1X |
O (orange) 1X |
R (red) 1X |
Tango™ (yellow) 1X / 2X |
||||
| AjiI | 37°C | NR | NR | 20-50* | NR | NR | 20-50* | 2X* |
* –星活性比5倍过量酶切(5 units x 1 hour)还强。
Lambda DNA
0.7%琼脂糖
17 切割位点
100%酶活性的反应条件
1X 缓冲液AjiI：
10 mM Bis-Tris Propane-HCl (pH 6.5, 37°C), 10 mM MgCl2 , 100 mM KCl, 0.1 mg/ml BSA。
37°C酶切。
10 mM Bis-Tris Propane-HCl (pH 6.5, 37°C), 10 mM MgCl2 , 100 mM KCl, 0.1 mg/ml BSA。
37°C酶切。
保存缓冲液
AjiI保存在：
10 mM Tris-HCl (pH 7.4, 25°C), 100 mM KCl, 1 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。
10 mM Tris-HCl (pH 7.4, 25°C), 100 mM KCl, 1 mM DTT, 1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。
连接和重新酶切
50倍AjiI过量酶切后，大约80%的酶切产物可以连接。不超过50%的连接产物可以被重新酶切，剩下的未切割连接产物可以被AatII和Eco72I (PmaCI)切割。
琼脂糖包埋DNA酶切
至少需要5 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的λ DNA。
备注
低盐、pH> 8.0、高浓度甘油(>5%)或过量酶切都会导致星活性。
商业化同裂酶
采用REsearch™软件寻找同功酶。
双酶切
采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。
甲基化影响
Dam: 无重叠 – 不影响。
Dcm: 无重叠 – 不影响。
CpG: 完全重叠 – 阻止酶切。
EcoKI: 可能重叠 – 影响不确定。
EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。
Dcm: 无重叠 – 不影响。
CpG: 完全重叠 – 阻止酶切。
EcoKI: 可能重叠 – 影响不确定。
EcoBI: 可能重叠 – 影响不确定。
| Methylation type | Sequence | Cleavage effect |
|---|---|---|
| CpG | CACGTC |
阻止酶切 |
| bp from the recognition site to fragment end | ||||
|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
| 50-100 | ||||
| Lambda | ΦX174 | M13mp18/19 | pBR322 | puc18/19 | pUC57 |
|---|---|---|---|---|---|
| 17 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| pTZ19R/U | pTZ57R | pBluescriptIIKS(-/+) | pBluescriptIISK(-/+) | pACYC177 | pACYC184 |
| 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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