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泛素化修饰蛋白质组学
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北京青莲百奥生物科技有限公司
泛素化是一种真核细胞中广泛存在的翻译后修饰。泛素是一个高度保守的由76个氨基酸残基组成的细胞质蛋白,能够共价连接到靶蛋白上,这一过程是由泛素激活酶(E1)、泛素结合酶(E2)和泛素连接酶(E3)的连续作用实现的。泛素化能够影响蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解,参与了细胞周期、增殖、凋亡、分化、转移、基因表达、转录调节、信号传递、损伤修复、炎症免疫等几乎一切生命活动的调控,与肿瘤、心血管等疾病密切相关,具有广泛的生物学意义。
技术原理
利用对泛素化赖氨酸(K-GG)具有高亲和力的基序抗体,特异性富集复杂样本中的泛素化肽段,结合labelfree蛋白质定量方法,实现大规模泛素化蛋白质定量分析。

(类)泛素化蛋白组学流程图
技术特点
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高灵敏度
可检测到低丰度的蛋白质,并对其修饰类型进行定性和定量分析
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高准确性
使用高分辨率高灵敏度的timsTOF HT质谱仪等设备,准确地鉴定泛素化修饰类型和修饰位点
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应用广泛
可应用于肿瘤、神经、免疫等多个领域,在生物学、医学和药学等学科有广泛的应用前景
技术优势
1.相关领域专业技术团队;
2.经验丰富的实验操作人员;
3.独立研发改进的具有技术领先地位的操作方法;
4.动物植物多种案例经验累积;
5.强大的生物信息分析团队。
应用领域
基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;
生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;
微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;
海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等。
分析流程

结果展示

样本要求
| 样本类型 | 送样量 | |
| 动物组织 | 常规组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等柔软组织) | 100 mg |
| 坚硬组织(软骨、毛发) | 5 g | |
| 植物组织 | 柔软组织(木本植物的叶、花等,草本植物,藻类,蕨类植物) | 5 g |
| 坚硬组织(根、树皮、树枝,果实种子等) | 10 g | |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体(菌体沉淀)、精细胞 | 500 μL |
| 细胞 | 悬浮/贴壁培养细胞(细胞计数/沉淀) | 2×107或200 μL |
| 体液类 | 泪液、穿刺液 | 300 mL |
| 淋巴液、关节液、唾液、乳汁、腹水 | 50 mL | |
| 其他 | 蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea) | 5 mg |
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文献和实验[1] Zhu Y, Liu Y, Ma Y, et al. Macrophage autophagy deficiency-induced CEBPB accumulation alleviates atopic dermatitis via impairing M2 polarization[J]. Cell Reports, 2023, 42(11).
蛋白质组作为重要的科研技术,广泛应用于科研中,在每年数万篇论文中发挥重要作用。如何利用组学工具快速切入临床科学问题形成科研思路,为我们的研究提速?可参考以下三种研究思路: 6.1、IF 1-3 分文章:蛋白质组学+差异蛋白 蛋白质组学检测 筛选差异蛋白进行表达量验证 分析差异蛋白,对差异蛋白进行 GO 和 KEGG 分析 6.1.1、案例一,影响因子 IF=2.2 iTRAQ-based quantitative proteomics analysis of immune
University, Research Dr., C118 LSRC, Durham, NC 27710. Phone: (919) 613-8606. Fax: (919) 668-0977. E-mail: hayst001@mc.duke.edu . REFERENCES 蛋白质组相关设备及试剂: 液相HPLC系统 | 毛细管LC系统 | 气相色谱系统 | 自动固相萃取系统 | 联用色谱系统 | 更多... (a) Triple quadrupole. Triple
备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
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