细菌完成图测序

天津生物芯片通过基于第三代测序技术 PacBio RS II 的全基因组测序，可以快速低成本地组装出细菌的完成图，预测重要基因和蛋白以及了解其功能和机制。完成图在研究病原菌的致病性与疾病的预防和治疗方面，鉴定致病相关基因、开发和研究药物，疫苗、开发新型抗生素等方面具有非常重要的应用。同时它在研究细菌进化，生理和生态多样性，种内进化关系也有其他技术所不具备的优势。细菌 de novo 测序已取代传统方法成为研究细菌遗传机制，锁定关键功能基因的重要工具。
技术路线





完成图技术指标

测序策略	参考指标	交付周期
PacBio RS II 平台 10kb SMRT bell 文库 >=100X测序深度	完成图 单碱基错误率<0.01%	建库测序：1个月 标准分析：1个月 高级分析：根据实际信息分析内容而定

生物信息分析

基础分析		高级分析
原始数据处理	√	COG功能分类	√
基因组拼接	√	GO功能分类	√
基因功能注释	√	KEGG代谢通路	√
基因预测	√	跨膜结构与信号肽预测	√
rRNA、tRNA查找	√	基因组圈图	√

价格
新年伊始，天津芯片公司用三代测序助力细菌基因组完成图，为各位科研老师节省时间节省经费。

	二代测序	三代测序
时间	4周	2周
完整性	2-3 gap	0 gap
价格	2-4万	惊爆价（来电来函咨询） T:022-6629538 E-mail：tjbiochipmk@126.com

机会难得，时间有限


参考文献
　　Koren, Sergey, et al. "Reducing assembly complexity of microbial genomes with single-molecule sequencing." arXiv preprint arXiv:1304.3752 (2013).
　　Bashir, Ali, et al. "A hybrid approach for the automated finishing of bacterial genomes." Nature biotechnology (2012).
　　Rasko, David A., et al. "Origins of the E. coli strain causing an outbreak of hemolytic–uremic syndrome in Germany." New England Journal of Medicine 365.8 (2011): 709-717.
　　Murray, Iain A., et al. "The methylomes of six bacteria." Nucleic acids research 40.22 (2012): 11450-11462.
Clark, Tyson A., et al. "Characterization of DNA methyltransferase specificities using single-molecule, real-time DNA sequencing." Nucleic Acids Research 40.4 (2012): e29-e29.


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