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分子生物学相关技术服务
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伊莱博生物科技(上海)有限公司
Co-ip染色质免疫共沉淀
Co-ip染色质免疫共沉淀简单介绍:
ChIP(Chromatin immunoprecipitation) 染色质免疫共沉淀:染色质免疫共沉淀技术主要应用于验证及探寻体内环境中,蛋白质和DNA的直接相互作用,旨在探索特定蛋白质在DNA上的特定结合序列,常在研究转录调控以及组蛋白修饰中被应用到。
实验过程大致为:交联-解交联-超声打碎-免疫沉淀-洗涤-DNA纯化-PCR检测。
Co-ip染色质免疫共沉淀具体操作:
样品准备:培养细胞(若样品为组织,可先培养原代细胞);固定,或者直接活细胞送样。
细胞固定:此步骤目的为将结合在DNA上的蛋白用共价形式交联在所结合的位点上,避免在之后的操作步骤中脱离丢失。直接将甲醛加入细胞培养液,摇晃固定10分钟后,迅速加入2.5M甘氨酸解交联5分钟,PBS洗涤,刮下细胞。
超声打碎:此步骤目的为将长链的DNA打碎成200-1000bp的DNA片段。使用设备是超声水浴锅,EP管在冰水混合物中超声,超声后细胞悬液变得澄清透明。离心取上清。
免疫沉淀:此步骤是加入特异性抗体和对照IgG,和结合抗体的磁珠(或protein A/G)。经稀释后,超声产物分成两份,分别加入特异性抗体和对照IgG,轮转过液,第二天加入磁珠轮转4小时。
洗涤:此步骤是减少非特异性结合。分别用稀释缓冲液、低盐溶液、高盐溶液、氯化锂溶液以及TE缓冲液洗涤共7次。用洗脱缓冲液在65℃洗脱过液。
DNA纯化:将洗脱的产物用DNA纯化试剂盒纯化,得到50ul纯化产物,用于检测ChIP结果。
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文献和实验某个实验间隙… 萌新:开题报告已提交,转眼 1 个月过去了,实验还是一头雾水,为啥我的 co-IP 拉不下来蛋白? 奋斗中的师兄:我当初正好相反,拉下来的蛋白被抗体条带覆盖住了,换个抗体忒不好找,无奈换了个蛋白,还好挺顺利。 大师兄:蛋白吧,不但种类多,理化性质差异较大,关键它们又喜欢组队在细胞里干活,IP、co-IP 又是常用的手段,掌握好这个工具还是很重要的,总不能随随便便就换个蛋白。 那要怎么快速掌握这项实验,轻松搞定各种疑难杂症呢? 我们依据三十多年的 IP/co-IP 实验经验,总结
紫叶竹韵 做IP,之后Western 分析,看到有两条带,在25和50KD左右,应该是抗体的两条带,但是我的目的蛋白也是52KD的,这该怎么区分呢。 woxingwosu 最好是选择与做IP不同来源的抗体来做(比如说IP用鼠的抗体,WB就用兔的抗体),这样就不会检测到抗体的两条带。 如果没有不同来源的抗体的话,就要做IP的时候尽量少放点抗体,跑胶跑得远一点,使得目的蛋白能够被看到,不过由于你的蛋白是在是太接近重链
一、原理: 免疫共沉淀(co-immunoprecipitation,Co-IP)技术是检测蛋白质间相互作用的经典方法,基本原理是以细胞内源性靶蛋白为诱饵,将靶蛋白抗体与细胞总蛋白进行共孵育,促进免疫复合物的形成;随后加入能够与抗体Fc段结合的proreinA/G(预先结合固化在琼脂糖小珠上),形成“结合蛋白-靶蛋白-靶蛋白抗体-proteinA/G小珠”复合物,纯化该复合物后凝胶电泳分离蛋白,应用Westernblot或者质谱技术鉴定靶蛋白的结合蛋白。 与其它研究方法相比,免疫
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